RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550178.1

DYNLL1-208, Transcript of dynein light chain LC8-type 1, human

BASIC

Gene DYNLL1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DYNLL1-208	ENST00000550178	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		45.88	■■■■■ 4.94
DYNLL1-208	ENST00000550178	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		45.87	■■■■■ 4.93
DYNLL1-208	ENST00000550178	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		45.87	■■■■■ 4.93
DYNLL1-208	ENST00000550178	PREX2	Q70Z35	1606 aa		45.84	■■■■■ 4.93
DYNLL1-208	ENST00000550178	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		45.83	■■■■■ 4.93
DYNLL1-208	ENST00000550178	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		45.83	■■■■■ 4.93
DYNLL1-208	ENST00000550178	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		45.78	■■■■■ 4.92
DYNLL1-208	ENST00000550178	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		45.78	■■■■■ 4.92
DYNLL1-208	ENST00000550178	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	45.77	■■■■■ 4.92
DYNLL1-208	ENST00000550178	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		45.77	■■■■■ 4.92
DYNLL1-208	ENST00000550178	AFAP1	Q8N556	730 aa		45.73	■■■■■ 4.91
DYNLL1-208	ENST00000550178	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		45.73	■■■■■ 4.91
DYNLL1-208	ENST00000550178	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		45.72	■■■■■ 4.91
DYNLL1-208	ENST00000550178	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		45.71	■■■■■ 4.91
DYNLL1-208	ENST00000550178	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		45.68	■■■■■ 4.9
DYNLL1-208	ENST00000550178	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		45.68	■■■■■ 4.9
DYNLL1-208	ENST00000550178	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		45.68	■■■■■ 4.9
DYNLL1-208	ENST00000550178	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	45.67	■■■■■ 4.9
DYNLL1-208	ENST00000550178	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	45.67	■■■■■ 4.9
DYNLL1-208	ENST00000550178	ABCC1	P33527	1531 aa		45.67	■■■■■ 4.9
DYNLL1-208	ENST00000550178	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		45.63	■■■■■ 4.9
DYNLL1-208	ENST00000550178	TIAM1	Q13009	1591 aa		45.62	■■■■■ 4.89
DYNLL1-208	ENST00000550178	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	45.62	■■■■■ 4.89
DYNLL1-208	ENST00000550178	KDM5C	P41229	1560 aa		45.6	■■■■■ 4.89
DYNLL1-208	ENST00000550178	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		45.58	■■■■■ 4.89
DYNLL1-208	ENST00000550178	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		45.54	■■■■■ 4.88
DYNLL1-208	ENST00000550178	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		45.52	■■■■■ 4.88
DYNLL1-208	ENST00000550178	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		45.52	■■■■■ 4.88
DYNLL1-208	ENST00000550178	ATP10A	O60312	1499 aa		45.51	■■■■■ 4.88
DYNLL1-208	ENST00000550178	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		45.51	■■■■■ 4.88
DYNLL1-208	ENST00000550178	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		45.51	■■■■■ 4.88
DYNLL1-208	ENST00000550178	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	45.5	■■■■■ 4.87
DYNLL1-208	ENST00000550178	NCOA2	Q15596	1464 aa		45.49	■■■■■ 4.87
DYNLL1-208	ENST00000550178	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		45.48	■■■■■ 4.87
DYNLL1-208	ENST00000550178	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		45.47	■■■■■ 4.87
DYNLL1-208	ENST00000550178	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		45.47	■■■■■ 4.87
DYNLL1-208	ENST00000550178	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		45.47	■■■■■ 4.87
DYNLL1-208	ENST00000550178	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	45.46	■■■■■ 4.87
DYNLL1-208	ENST00000550178	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	45.45	■■■■■ 4.87
DYNLL1-208	ENST00000550178	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		45.44	■■■■■ 4.87
DYNLL1-208	ENST00000550178	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		45.43	■■■■■ 4.86
DYNLL1-208	ENST00000550178	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	45.43	■■■■■ 4.86
DYNLL1-208	ENST00000550178	MAP3K1	Q13233	1512 aa		45.43	■■■■■ 4.86
DYNLL1-208	ENST00000550178	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		45.41	■■■■■ 4.86
DYNLL1-208	ENST00000550178	MADD	Q8WXG6	1647 aa		45.37	■■■■■ 4.85
DYNLL1-208	ENST00000550178	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		45.37	■■■■■ 4.85
DYNLL1-208	ENST00000550178	MLEC	Q14165	292 aa		45.37	■■■■■ 4.85
DYNLL1-208	ENST00000550178	PTPRM	P28827	1452 aa		45.36	■■■■■ 4.85
DYNLL1-208	ENST00000550178	ABCA6	Q8N139	1617 aa		45.34	■■■■■ 4.85
DYNLL1-208	ENST00000550178	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	45.31	■■■■■ 4.84
DYNLL1-208	ENST00000550178	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		45.31	■■■■■ 4.84
DYNLL1-208	ENST00000550178	MBD5	Q9P267	1494 aa		45.26	■■■■■ 4.84
DYNLL1-208	ENST00000550178	APLP2	Q06481	763 aa		45.25	■■■■■ 4.83
DYNLL1-208	ENST00000550178	RERE	Q9P2R6	1566 aa		45.23	■■■■■ 4.83
DYNLL1-208	ENST00000550178	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	45.21	■■■■■ 4.83
DYNLL1-208	ENST00000550178	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		45.18	■■■■■ 4.82
DYNLL1-208	ENST00000550178	ATP7A	Q04656	1500 aa		45.16	■■■■■ 4.82
DYNLL1-208	ENST00000550178	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	45.14	■■■■■ 4.82
DYNLL1-208	ENST00000550178	AGL	P35573	1532 aa		45.12	■■■■■ 4.81
DYNLL1-208	ENST00000550178	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		45.09	■■■■■ 4.81
DYNLL1-208	ENST00000550178	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		45.09	■■■■■ 4.81
DYNLL1-208	ENST00000550178	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		45.07	■■■■■ 4.81
DYNLL1-208	ENST00000550178	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		45.04	■■■■■ 4.8
DYNLL1-208	ENST00000550178	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		45.01	■■■■■ 4.8
DYNLL1-208	ENST00000550178	A2M	P01023	1474 aa		45	■■■■■ 4.79
DYNLL1-208	ENST00000550178	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		45	■■■■■ 4.79
DYNLL1-208	ENST00000550178	MIA2	Q96PC5	1412 aa		45	■■■■■ 4.79
DYNLL1-208	ENST00000550178	PLXNC1	O60486	1568 aa		44.94	■■■■■ 4.79
DYNLL1-208	ENST00000550178	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		44.94	■■■■■ 4.79
DYNLL1-208	ENST00000550178	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	44.93	■■■■■ 4.78
DYNLL1-208	ENST00000550178	TSPY4	P0CV99	314 aa		44.87	■■■■■ 4.77
DYNLL1-208	ENST00000550178	TSPY10	P0CW01	314 aa		44.87	■■■■■ 4.77
DYNLL1-208	ENST00000550178	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		44.86	■■■■■ 4.77
DYNLL1-208	ENST00000550178	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	44.84	■■■■■ 4.77
DYNLL1-208	ENST00000550178	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	44.82	■■■■■ 4.77
DYNLL1-208	ENST00000550178	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		44.82	■■■■■ 4.77
DYNLL1-208	ENST00000550178	GGT6	Q6P531	493 aa		44.78	■■■■■ 4.76
DYNLL1-208	ENST00000550178	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		44.77	■■■■■ 4.76
DYNLL1-208	ENST00000550178	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		44.75	■■■■■ 4.75
DYNLL1-208	ENST00000550178	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		44.75	■■■■■ 4.75
DYNLL1-208	ENST00000550178	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		44.71	■■■■■ 4.75
DYNLL1-208	ENST00000550178	C3	P01024	1663 aa		44.69	■■■■■ 4.74
DYNLL1-208	ENST00000550178	KIF3B	O15066	747 aa		44.68	■■■■■ 4.74
DYNLL1-208	ENST00000550178	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	44.67	■■■■■ 4.74
DYNLL1-208	ENST00000550178	ABCC5	O15440	1437 aa		44.67	■■■■■ 4.74
DYNLL1-208	ENST00000550178	HSPA2	P54652	639 aa		44.66	■■■■■ 4.74
DYNLL1-208	ENST00000550178	ZMYM3	Q14202	1370 aa		44.64	■■■■■ 4.74
DYNLL1-208	ENST00000550178	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		44.6	■■■■■ 4.73
DYNLL1-208	ENST00000550178	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	44.58	■■■■■ 4.73
DYNLL1-208	ENST00000550178	DAPK1	P53355	1430 aa		44.58	■■■■■ 4.73
DYNLL1-208	ENST00000550178	MROH2A	A6NES4	1674 aa		44.57	■■■■■ 4.73
DYNLL1-208	ENST00000550178	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	44.55	■■■■■ 4.72
DYNLL1-208	ENST00000550178	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		44.54	■■■■■ 4.72
DYNLL1-208	ENST00000550178	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		44.54	■■■■■ 4.72
DYNLL1-208	ENST00000550178	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	44.53	■■■■■ 4.72
DYNLL1-208	ENST00000550178	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	44.52	■■■■■ 4.72
DYNLL1-208	ENST00000550178	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		44.51	■■■■■ 4.72
DYNLL1-208	ENST00000550178	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	44.5	■■■■■ 4.71
DYNLL1-208	ENST00000550178	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		44.5	■■■■■ 4.71
DYNLL1-208	ENST00000550178	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		44.47	■■■■■ 4.71

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