RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 TSPY10P0CW01 314 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-215ENST00000549143 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-215ENST00000549143 FOXD1Q16676 465 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-215ENST00000549143 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
CS-215ENST00000549143 ABCC10Q5T3U5 1492 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-215ENST00000549143 MAPKBP1O60336 1514 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-215ENST00000549143 CYB5RLQ6IPT4 315 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-215ENST00000549143 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-215ENST00000549143 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-215ENST00000549143 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-215ENST00000549143 KDM5BQ9UGL1 1544 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-215ENST00000549143 AKNAQ7Z591 1439 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-215ENST00000549143 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CS-215ENST00000549143 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-215ENST00000549143 NCOA1Q15788 1441 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-215ENST00000549143 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa12.18□□□□□ -0.46
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CS-215ENST00000549143 ADCY10Q96PN6 1610 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-215ENST00000549143 ROCK1Q13464 1354 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-215ENST00000549143 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa12.17□□□□□ -0.46
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CS-215ENST00000549143 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
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CS-215ENST00000549143 AFAP1Q8N556 730 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-215ENST00000549143 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.14□□□□□ -0.476e-9■□□□□ 10
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CS-215ENST00000549143 WDR7Q9Y4E6 1490 aa12.12□□□□□ -0.47
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CS-215ENST00000549143 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-215ENST00000549143 SYCP2Q9BX26 1530 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-215ENST00000549143 NUP155O75694 1391 aa12.11□□□□□ -0.47
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CS-215ENST00000549143 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa12.1□□□□□ -0.47
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CS-215ENST00000549143 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-215ENST00000549143 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-215ENST00000549143 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
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CS-215ENST00000549143 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa12.07□□□□□ -0.48
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CS-215ENST00000549143 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
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CS-215ENST00000549143 CD109Q6YHK3 1445 aa12.02□□□□□ -0.48
CS-215ENST00000549143 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CS-215ENST00000549143 ARHGEF5Q12774 1597 aa12.02□□□□□ -0.49
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CS-215ENST00000549143 ADGRL1O94910 1474 aa12□□□□□ -0.49
CS-215ENST00000549143 CROCC2H7BZ55 1655 aa12□□□□□ -0.49
CS-215ENST00000549143 RAPGEF3O95398 923 aa12□□□□□ -0.49
CS-215ENST00000549143 FAM69CQ0P6D2 419 aa12□□□□□ -0.49
CS-215ENST00000549143 MIER1Q8N108 512 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-215ENST00000549143 ADGBQ8N7X0 1667 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-215ENST00000549143 KIF3BO15066 747 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-215ENST00000549143 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-215ENST00000549143 ABCC1P33527 1531 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-215ENST00000549143 RGL3Q3MIN7 710 aa11.97□□□□□ -0.49
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CS-215ENST00000549143 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-215ENST00000549143 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa11.95□□□□□ -0.5
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CS-215ENST00000549143 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-215ENST00000549143 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa11.9□□□□□ -0.51
CS-215ENST00000549143 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
CS-215ENST00000549143 ERBINQ96RT1 1412 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-215ENST00000549143 MAST1Q9Y2H9 1570 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-215ENST00000549143 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-215ENST00000549143 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-215ENST00000549143 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-215ENST00000549143 ATP7AQ04656 1500 aa11.88□□□□□ -0.51
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