RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545663.5

CLSTN3-216, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-216ENST00000545663 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CLSTN3-216ENST00000545663 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.7■■□□□ 1.87
CLSTN3-216ENST00000545663 PRXQ9BXM0 1461 aa26.7■■□□□ 1.87
CLSTN3-216ENST00000545663 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.69■■□□□ 1.86
CLSTN3-216ENST00000545663 PTPRTO14522 1441 aa26.69■■□□□ 1.86
CLSTN3-216ENST00000545663 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.69■■□□□ 1.86
CLSTN3-216ENST00000545663 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.861e-6■■■■■ 42.9
CLSTN3-216ENST00000545663 ATP10AO60312 1499 aa26.65■■□□□ 1.86
CLSTN3-216ENST00000545663 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.64■■□□□ 1.86
CLSTN3-216ENST00000545663 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.63■■□□□ 1.85
CLSTN3-216ENST00000545663 SAMD9Q5K651 1589 aa26.6■■□□□ 1.85
CLSTN3-216ENST00000545663 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3-216ENST00000545663 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.58■■□□□ 1.85
CLSTN3-216ENST00000545663 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.57■■□□□ 1.84
CLSTN3-216ENST00000545663 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CLSTN3-216ENST00000545663 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CLSTN3-216ENST00000545663 PLCH2O75038 1416 aa26.48■■□□□ 1.83
CLSTN3-216ENST00000545663 NCOA1Q15788 1441 aa26.48■■□□□ 1.83
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CLSTN3-216ENST00000545663 AFAP1Q8N556 730 aa26.45■■□□□ 1.82
CLSTN3-216ENST00000545663 C3P01024 1663 aa26.44■■□□□ 1.82
CLSTN3-216ENST00000545663 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.42■■□□□ 1.82
CLSTN3-216ENST00000545663 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.42■■□□□ 1.82
CLSTN3-216ENST00000545663 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.4■■□□□ 1.82
CLSTN3-216ENST00000545663 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.4■■□□□ 1.82
CLSTN3-216ENST00000545663 HSPA1LP34931 641 aa26.39■■□□□ 1.82
CLSTN3-216ENST00000545663 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CLSTN3-216ENST00000545663 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CLSTN3-216ENST00000545663 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CLSTN3-216ENST00000545663 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.36■■□□□ 1.81
CLSTN3-216ENST00000545663 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.33■■□□□ 1.8
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.32■■□□□ 1.8
CLSTN3-216ENST00000545663 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CLSTN3-216ENST00000545663 PIP4K2BP78356 416 aa26.31■■□□□ 1.8
CLSTN3-216ENST00000545663 KDM5CP41229 1560 aa26.28■■□□□ 1.8
CLSTN3-216ENST00000545663 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.27■■□□□ 1.8
CLSTN3-216ENST00000545663 ABCA6Q8N139 1617 aa26.25■■□□□ 1.79
CLSTN3-216ENST00000545663 REREQ9P2R6 1566 aa26.24■■□□□ 1.79
CLSTN3-216ENST00000545663 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.23■■□□□ 1.79
CLSTN3-216ENST00000545663 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CLSTN3-216ENST00000545663 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CLSTN3-216ENST00000545663 AGLP35573 1532 aa26.2■■□□□ 1.79
CLSTN3-216ENST00000545663 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.19■■□□□ 1.78
CLSTN3-216ENST00000545663 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.18■■□□□ 1.78
CLSTN3-216ENST00000545663 PKD2Q13563 968 aa26.18■■□□□ 1.78
CLSTN3-216ENST00000545663 KIF14Q15058 1648 aa26.17■■□□□ 1.78
CLSTN3-216ENST00000545663 NPATQ14207 1427 aa26.17■■□□□ 1.78
CLSTN3-216ENST00000545663 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.17■■□□□ 1.78
CLSTN3-216ENST00000545663 ZMYM3Q14202 1370 aa26.17■■□□□ 1.78
CLSTN3-216ENST00000545663 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.14■■□□□ 1.78
CLSTN3-216ENST00000545663 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CLSTN3-216ENST00000545663 TOM1O60784 492 aa26.12■■□□□ 1.77
CLSTN3-216ENST00000545663 PLA2R1Q13018 1463 aa26.1■■□□□ 1.77
CLSTN3-216ENST00000545663 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CLSTN3-216ENST00000545663 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CLSTN3-216ENST00000545663 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.03■■□□□ 1.76
CLSTN3-216ENST00000545663 MROH2AA6NES4 1674 aa26.03■■□□□ 1.76
CLSTN3-216ENST00000545663 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.03■■□□□ 1.76
CLSTN3-216ENST00000545663 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CLSTN3-216ENST00000545663 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CLSTN3-216ENST00000545663 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.01■■□□□ 1.75
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CLSTN3-216ENST00000545663 PTPRKQ15262 1439 aa26■■□□□ 1.75
CLSTN3-216ENST00000545663 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CLSTN3-216ENST00000545663 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CLSTN3-216ENST00000545663 ABCC1P33527 1531 aa25.98■■□□□ 1.75
CLSTN3-216ENST00000545663 ALKQ9UM73 1620 aa25.97■■□□□ 1.75
CLSTN3-216ENST00000545663 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.97■■□□□ 1.75
CLSTN3-216ENST00000545663 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CLSTN3-216ENST00000545663 CPS1P31327 1500 aa25.94■■□□□ 1.74
CLSTN3-216ENST00000545663 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.94■■□□□ 1.74
CLSTN3-216ENST00000545663 CLIP1P30622 1438 aa25.93■■□□□ 1.74
CLSTN3-216ENST00000545663 GGT6Q6P531 493 aa25.91■■□□□ 1.74
CLSTN3-216ENST00000545663 FMN1Q68DA7 1419 aa25.89■■□□□ 1.74
CLSTN3-216ENST00000545663 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.88■■□□□ 1.73
CLSTN3-216ENST00000545663 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CLSTN3-216ENST00000545663 PREX2Q70Z35 1606 aa25.88■■□□□ 1.73
CLSTN3-216ENST00000545663 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.87■■□□□ 1.73
CLSTN3-216ENST00000545663 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.87■■□□□ 1.73
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CLSTN3-216ENST00000545663 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CLSTN3-216ENST00000545663 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.86■■□□□ 1.73
CLSTN3-216ENST00000545663 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
CLSTN3-216ENST00000545663 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.83■■□□□ 1.72
CLSTN3-216ENST00000545663 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.82■■□□□ 1.72
CLSTN3-216ENST00000545663 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.8■■□□□ 1.72
CLSTN3-216ENST00000545663 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CLSTN3-216ENST00000545663 POTEAQ6S8J7 498 aa25.79■■□□□ 1.72
CLSTN3-216ENST00000545663 A2MP01023 1474 aa25.78■■□□□ 1.72
CLSTN3-216ENST00000545663 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CLSTN3-216ENST00000545663 EEA1Q15075 1411 aa25.77■■□□□ 1.72
CLSTN3-216ENST00000545663 PLXNC1O60486 1568 aa25.77■■□□□ 1.72
CLSTN3-216ENST00000545663 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.76■■□□□ 1.71
CLSTN3-216ENST00000545663 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.712e-7■■■■□ 20.6
CLSTN3-216ENST00000545663 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.75■■□□□ 1.71
CLSTN3-216ENST00000545663 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.74■■□□□ 1.71
CLSTN3-216ENST00000545663 ATP7AQ04656 1500 aa25.73■■□□□ 1.71
CLSTN3-216ENST00000545663 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3-216ENST00000545663 TNRQ92752 1358 aa25.71■■□□□ 1.71
CLSTN3-216ENST00000545663 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.7■■□□□ 1.7
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