RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542720.1

LATS1-205, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LATS1, Length 1,096 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-205ENST00000542720 MAP3K1Q13233 1512 aa27.72■■■□□ 2.03
LATS1-205ENST00000542720 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.72■■■□□ 2.03
LATS1-205ENST00000542720 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.72■■■□□ 2.03
LATS1-205ENST00000542720 APLP2Q06481 763 aa27.72■■■□□ 2.03
LATS1-205ENST00000542720 RAPGEF3O95398 923 aa27.7■■■□□ 2.02
LATS1-205ENST00000542720 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.7■■■□□ 2.02
LATS1-205ENST00000542720 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.69■■■□□ 2.02
LATS1-205ENST00000542720 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
LATS1-205ENST00000542720 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.68■■■□□ 2.02
LATS1-205ENST00000542720 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.67■■■□□ 2.02
LATS1-205ENST00000542720 PREX2Q70Z35 1606 aa27.67■■■□□ 2.02
LATS1-205ENST00000542720 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.66■■■□□ 2.02
LATS1-205ENST00000542720 PTPRMP28827 1452 aa27.65■■■□□ 2.02
LATS1-205ENST00000542720 NCOA2Q15596 1464 aa27.64■■■□□ 2.02
LATS1-205ENST00000542720 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
LATS1-205ENST00000542720 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.63■■■□□ 2.01
LATS1-205ENST00000542720 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
LATS1-205ENST00000542720 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
LATS1-205ENST00000542720 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
LATS1-205ENST00000542720 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.59■■■□□ 2.01
LATS1-205ENST00000542720 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.58■■■□□ 2.01
LATS1-205ENST00000542720 RICTORQ6R327 1708 aa27.54■■■□□ 2
LATS1-205ENST00000542720 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.54■■■□□ 2
LATS1-205ENST00000542720 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
LATS1-205ENST00000542720 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.52■■■□□ 2
LATS1-205ENST00000542720 AFAP1Q8N556 730 aa27.52■■■□□ 2
LATS1-205ENST00000542720 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.5■■□□□ 1.99
LATS1-205ENST00000542720 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.5■■□□□ 1.99
LATS1-205ENST00000542720 ABCC1P33527 1531 aa27.5■■□□□ 1.99
LATS1-205ENST00000542720 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.49■■□□□ 1.99
LATS1-205ENST00000542720 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.49■■□□□ 1.99
LATS1-205ENST00000542720 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
LATS1-205ENST00000542720 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.48■■□□□ 1.99
LATS1-205ENST00000542720 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.43■■□□□ 1.98
LATS1-205ENST00000542720 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.42■■□□□ 1.98
LATS1-205ENST00000542720 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.42■■□□□ 1.98
LATS1-205ENST00000542720 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.41■■□□□ 1.98
LATS1-205ENST00000542720 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.41■■□□□ 1.98
LATS1-205ENST00000542720 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.41■■□□□ 1.98
LATS1-205ENST00000542720 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.4■■□□□ 1.98
LATS1-205ENST00000542720 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.4■■□□□ 1.98
LATS1-205ENST00000542720 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
LATS1-205ENST00000542720 MADDQ8WXG6 1647 aa27.38■■□□□ 1.97
LATS1-205ENST00000542720 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.38■■□□□ 1.97
LATS1-205ENST00000542720 KDM5CP41229 1560 aa27.38■■□□□ 1.97
LATS1-205ENST00000542720 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.38■■□□□ 1.97
LATS1-205ENST00000542720 MBD5Q9P267 1494 aa27.36■■□□□ 1.97
LATS1-205ENST00000542720 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.36■■□□□ 1.97
LATS1-205ENST00000542720 HSPA2P54652 639 aa27.35■■□□□ 1.97
LATS1-205ENST00000542720 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.35■■□□□ 1.97
LATS1-205ENST00000542720 MIA2Q96PC5 1412 aa27.34■■□□□ 1.97
LATS1-205ENST00000542720 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.33■■□□□ 1.97
LATS1-205ENST00000542720 CERKQ8TCT0 537 aa27.31■■□□□ 1.96
LATS1-205ENST00000542720 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.31■■□□□ 1.96
LATS1-205ENST00000542720 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
LATS1-205ENST00000542720 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.28■■□□□ 1.96
LATS1-205ENST00000542720 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.27■■□□□ 1.96
LATS1-205ENST00000542720 ATP10AO60312 1499 aa27.26■■□□□ 1.95
LATS1-205ENST00000542720 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.25■■□□□ 1.95
LATS1-205ENST00000542720 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.24■■□□□ 1.95
LATS1-205ENST00000542720 ABCA6Q8N139 1617 aa27.23■■□□□ 1.95
LATS1-205ENST00000542720 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.23■■□□□ 1.95
LATS1-205ENST00000542720 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.23■■□□□ 1.95
LATS1-205ENST00000542720 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.23■■□□□ 1.95
LATS1-205ENST00000542720 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.22■■□□□ 1.95
LATS1-205ENST00000542720 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
LATS1-205ENST00000542720 ATP7AQ04656 1500 aa27.21■■□□□ 1.95
LATS1-205ENST00000542720 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.2■■□□□ 1.94
LATS1-205ENST00000542720 ILDR2Q71H61 639 aa27.2■■□□□ 1.94
LATS1-205ENST00000542720 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
LATS1-205ENST00000542720 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
LATS1-205ENST00000542720 TSPY4P0CV99 314 aa27.17■■□□□ 1.94
LATS1-205ENST00000542720 TSPY10P0CW01 314 aa27.17■■□□□ 1.94
LATS1-205ENST00000542720 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
LATS1-205ENST00000542720 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.16■■□□□ 1.94
LATS1-205ENST00000542720 MLECQ14165 292 aa27.15■■□□□ 1.94
LATS1-205ENST00000542720 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.15■■□□□ 1.94
LATS1-205ENST00000542720 ABCC5O15440 1437 aa27.14■■□□□ 1.93
LATS1-205ENST00000542720 SOCS7O14512 581 aa27.12■■□□□ 1.93
LATS1-205ENST00000542720 REREQ9P2R6 1566 aa27.09■■□□□ 1.93
LATS1-205ENST00000542720 DAPK1P53355 1430 aa27.09■■□□□ 1.93
LATS1-205ENST00000542720 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.08■■□□□ 1.93
LATS1-205ENST00000542720 A2MP01023 1474 aa27.07■■□□□ 1.92
LATS1-205ENST00000542720 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
LATS1-205ENST00000542720 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.06■■□□□ 1.92
LATS1-205ENST00000542720 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.06■■□□□ 1.92
LATS1-205ENST00000542720 AGLP35573 1532 aa27.04■■□□□ 1.92
LATS1-205ENST00000542720 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.03■■□□□ 1.92
LATS1-205ENST00000542720 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.02■■□□□ 1.92
LATS1-205ENST00000542720 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
LATS1-205ENST00000542720 PLXNC1O60486 1568 aa27.01■■□□□ 1.91
LATS1-205ENST00000542720 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27■■□□□ 1.91
LATS1-205ENST00000542720 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.99■■□□□ 1.91
LATS1-205ENST00000542720 ITGAEP38570 1179 aa26.98■■□□□ 1.91
LATS1-205ENST00000542720 PTPRKQ15262 1439 aa26.98■■□□□ 1.91
LATS1-205ENST00000542720 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
LATS1-205ENST00000542720 GGT6Q6P531 493 aa26.95■■□□□ 1.9
LATS1-205ENST00000542720 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.9
LATS1-205ENST00000542720 KIF3BO15066 747 aa26.94■■□□□ 1.9
LATS1-205ENST00000542720 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.2 ms