RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540963.1

CHFR-218, Transcript of checkpoint with forkhead and ring finger domains, humanhuman

TSL 2

Gene CHFR, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFR-218ENST00000540963 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa44.56■■■■■ 4.72
CHFR-218ENST00000540963 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
CHFR-218ENST00000540963 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa44.53■■■■■ 4.72
CHFR-218ENST00000540963 ATP10AO60312 1499 aa44.52■■■■■ 4.72
CHFR-218ENST00000540963 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
CHFR-218ENST00000540963 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.49■■■■■ 4.71
CHFR-218ENST00000540963 C9orf84Q5VXU9 1444 aa44.48■■■■■ 4.71
CHFR-218ENST00000540963 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa44.46■■■■■ 4.71
CHFR-218ENST00000540963 HSPA2P54652 639 aa44.46■■■■■ 4.71
CHFR-218ENST00000540963 KIF14Q15058 1648 aa44.44■■■■■ 4.7
CHFR-218ENST00000540963 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
CHFR-218ENST00000540963 MLECQ14165 292 aa44.43■■■■■ 4.7
CHFR-218ENST00000540963 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa44.41■■■■■ 4.7
CHFR-218ENST00000540963 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
CHFR-218ENST00000540963 PLPPR3Q6T4P5 718 aa44.4■■■■■ 4.7
CHFR-218ENST00000540963 CLIP1P30622 1438 aa44.36■■■■■ 4.69
CHFR-218ENST00000540963 KDM5CP41229 1560 aa44.35■■■■■ 4.69
CHFR-218ENST00000540963 ARHGAP5Q13017 1502 aa44.32■■■■■ 4.69
CHFR-218ENST00000540963 PREX1Q8TCU6 1659 aa44.32■■■■■ 4.68
CHFR-218ENST00000540963 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.26■■■■■ 4.68
CHFR-218ENST00000540963 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.25■■■■■ 4.67
CHFR-218ENST00000540963 REREQ9P2R6 1566 aa44.24■■■■■ 4.67
CHFR-218ENST00000540963 AFAP1Q8N556 730 aa44.22■■■■■ 4.67
CHFR-218ENST00000540963 CERKQ8TCT0 537 aa44.21■■■■■ 4.67
CHFR-218ENST00000540963 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP44.21■■■■■ 4.67
CHFR-218ENST00000540963 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa44.21■■■■■ 4.67
CHFR-218ENST00000540963 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa44.18■■■■■ 4.66
CHFR-218ENST00000540963 MLH3Q9UHC1 1453 aa44.17■■■■■ 4.66
CHFR-218ENST00000540963 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.13■■■■■ 4.65
CHFR-218ENST00000540963 PREX2Q70Z35 1606 aa44.13■■■■■ 4.65
CHFR-218ENST00000540963 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
CHFR-218ENST00000540963 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.11■■■■■ 4.65
CHFR-218ENST00000540963 MYT1LQ9UL68 1186 aa44.09■■■■■ 4.65
CHFR-218ENST00000540963 DMRT2Q9Y5R5 561 aa44.09■■■■■ 4.65
CHFR-218ENST00000540963 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.08■■■■■ 4.65
CHFR-218ENST00000540963 ABCA6Q8N139 1617 aa44.08■■■■■ 4.65
CHFR-218ENST00000540963 ABCC1P33527 1531 aa44.08■■■■■ 4.65
CHFR-218ENST00000540963 AGLP35573 1532 aa44.08■■■■■ 4.65
CHFR-218ENST00000540963 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa44.07■■■■■ 4.65
CHFR-218ENST00000540963 STRCQ7RTU9 1775 aa44.05■■■■■ 4.64
CHFR-218ENST00000540963 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.03■■■■■ 4.64
CHFR-218ENST00000540963 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa44■■■■■ 4.63
CHFR-218ENST00000540963 C3P01024 1663 aa43.99■■■■■ 4.63
CHFR-218ENST00000540963 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.95■■■■■ 4.63
CHFR-218ENST00000540963 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa43.94■■■■■ 4.62
CHFR-218ENST00000540963 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
CHFR-218ENST00000540963 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.89■■■■■ 4.62
CHFR-218ENST00000540963 CNTLNQ9NXG0 1405 aa43.89■■■■■ 4.62
CHFR-218ENST00000540963 PTPRTO14522 1441 aa43.86■■■■■ 4.61
CHFR-218ENST00000540963 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.8■■■■■ 4.6
CHFR-218ENST00000540963 MROH2AA6NES4 1674 aa43.76■■■■■ 4.6
CHFR-218ENST00000540963 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
CHFR-218ENST00000540963 NPATQ14207 1427 aa43.72■■■■■ 4.59
CHFR-218ENST00000540963 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.69■■■■■ 4.59
CHFR-218ENST00000540963 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.68■■■■■ 4.58
CHFR-218ENST00000540963 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
CHFR-218ENST00000540963 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
CHFR-218ENST00000540963 NCOA1Q15788 1441 aa43.66■■■■■ 4.58
CHFR-218ENST00000540963 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.66■■■■■ 4.58
CHFR-218ENST00000540963 ATP7AQ04656 1500 aa43.61■■■■■ 4.57
CHFR-218ENST00000540963 LTBP4Q8N2S1 1624 aa43.6■■■■■ 4.57
CHFR-218ENST00000540963 IQSEC2Q5JU85 1478 aa43.6■■■■■ 4.57
CHFR-218ENST00000540963 ZMYM3Q14202 1370 aa43.6■■■■■ 4.57
CHFR-218ENST00000540963 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
CHFR-218ENST00000540963 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.59■■■■■ 4.57
CHFR-218ENST00000540963 PLXNC1O60486 1568 aa43.58■■■■■ 4.57
CHFR-218ENST00000540963 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
CHFR-218ENST00000540963 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
CHFR-218ENST00000540963 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa43.53■■■■■ 4.56
CHFR-218ENST00000540963 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.53■■■■■ 4.56
CHFR-218ENST00000540963 A2MP01023 1474 aa43.52■■■■■ 4.56
CHFR-218ENST00000540963 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
CHFR-218ENST00000540963 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
CHFR-218ENST00000540963 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.45■■■■■ 4.55
CHFR-218ENST00000540963 DISP3Q9P2K9 1392 aa43.45■■■■■ 4.55
CHFR-218ENST00000540963 PPP6R1Q9UPN7 881 aa43.45■■■■■ 4.55
CHFR-218ENST00000540963 ADGBQ8N7X0 1667 aa43.44■■■■■ 4.54
CHFR-218ENST00000540963 MYO3AQ8NEV4 1616 aa43.41■■■■■ 4.54
CHFR-218ENST00000540963 PLA2R1Q13018 1463 aa43.41■■■■■ 4.54
CHFR-218ENST00000540963 PTPRKQ15262 1439 aa43.39■■■■■ 4.54
CHFR-218ENST00000540963 PKD2Q13563 968 aa43.36■■■■■ 4.53
CHFR-218ENST00000540963 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
CHFR-218ENST00000540963 GGT6Q6P531 493 aa43.33■■■■■ 4.53
CHFR-218ENST00000540963 TIAM1Q13009 1591 aa43.33■■■■■ 4.53
CHFR-218ENST00000540963 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.32■■■■■ 4.52
CHFR-218ENST00000540963 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa43.31■■■■■ 4.52
CHFR-218ENST00000540963 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa43.3■■■■■ 4.52
CHFR-218ENST00000540963 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
CHFR-218ENST00000540963 MBD5Q9P267 1494 aa43.3■■■■■ 4.52
CHFR-218ENST00000540963 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa43.26■■■■■ 4.52
CHFR-218ENST00000540963 ILDR2Q71H61 639 aa43.26■■■■■ 4.52
CHFR-218ENST00000540963 CEP162Q5TB80 1403 aa43.24■■■■■ 4.51
CHFR-218ENST00000540963 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
CHFR-218ENST00000540963 SOCS7O14512 581 aa43.21■■■■■ 4.51
CHFR-218ENST00000540963 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
CHFR-218ENST00000540963 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
CHFR-218ENST00000540963 A2ML1A8K2U0 1454 aa43.18■■■■■ 4.5
CHFR-218ENST00000540963 FAM135AQ9P2D6 1515 aa43.17■■■■■ 4.5
CHFR-218ENST00000540963 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
CHFR-218ENST00000540963 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.1■■■■■ 4.49
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