RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533817.5

TSTA3-216, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-216ENST00000533817 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-216ENST00000533817 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-216ENST00000533817 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-216ENST00000533817 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-216ENST00000533817 ADGRL1O94910 1474 aa23.38■■□□□ 1.33
TSTA3-216ENST00000533817 RICTORQ6R327 1708 aa23.38■■□□□ 1.33
TSTA3-216ENST00000533817 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TSTA3-216ENST00000533817 NCOA2Q15596 1464 aa23.37■■□□□ 1.33
TSTA3-216ENST00000533817 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TSTA3-216ENST00000533817 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.37■■□□□ 1.33
TSTA3-216ENST00000533817 RAPGEF3O95398 923 aa23.35■■□□□ 1.33
TSTA3-216ENST00000533817 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.34■■□□□ 1.33
TSTA3-216ENST00000533817 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.34■■□□□ 1.33
TSTA3-216ENST00000533817 ABCC1P33527 1531 aa23.33■■□□□ 1.32
TSTA3-216ENST00000533817 APLP2Q06481 763 aa23.32■■□□□ 1.32
TSTA3-216ENST00000533817 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.32■■□□□ 1.32
TSTA3-216ENST00000533817 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.31■■□□□ 1.32
TSTA3-216ENST00000533817 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.29■■□□□ 1.32
TSTA3-216ENST00000533817 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.28■■□□□ 1.32
TSTA3-216ENST00000533817 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.24■■□□□ 1.31
TSTA3-216ENST00000533817 KDM5CP41229 1560 aa23.24■■□□□ 1.31
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TSTA3-216ENST00000533817 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.23■■□□□ 1.31
TSTA3-216ENST00000533817 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.23■■□□□ 1.31
TSTA3-216ENST00000533817 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.22■■□□□ 1.31
TSTA3-216ENST00000533817 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.22■■□□□ 1.31
TSTA3-216ENST00000533817 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.21■■□□□ 1.31
TSTA3-216ENST00000533817 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.21■■□□□ 1.31
TSTA3-216ENST00000533817 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.19■■□□□ 1.3
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TSTA3-216ENST00000533817 AFAP1Q8N556 730 aa23.19■■□□□ 1.3
TSTA3-216ENST00000533817 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.18■■□□□ 1.3
TSTA3-216ENST00000533817 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.17■■□□□ 1.3
TSTA3-216ENST00000533817 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.17■■□□□ 1.3
TSTA3-216ENST00000533817 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.16■■□□□ 1.3
TSTA3-216ENST00000533817 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
TSTA3-216ENST00000533817 MBD5Q9P267 1494 aa23.15■■□□□ 1.3
TSTA3-216ENST00000533817 MIA2Q96PC5 1412 aa23.15■■□□□ 1.3
TSTA3-216ENST00000533817 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.14■■□□□ 1.29
TSTA3-216ENST00000533817 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.11■■□□□ 1.29
TSTA3-216ENST00000533817 ABCA6Q8N139 1617 aa23.09■■□□□ 1.29
TSTA3-216ENST00000533817 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.09■■□□□ 1.29
TSTA3-216ENST00000533817 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.08■■□□□ 1.29
TSTA3-216ENST00000533817 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.08■■□□□ 1.29
TSTA3-216ENST00000533817 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
TSTA3-216ENST00000533817 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.07■■□□□ 1.28
TSTA3-216ENST00000533817 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.07■■□□□ 1.28
TSTA3-216ENST00000533817 ATP10AO60312 1499 aa23.06■■□□□ 1.28
TSTA3-216ENST00000533817 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.06■■□□□ 1.28
TSTA3-216ENST00000533817 ATP7AQ04656 1500 aa23.05■■□□□ 1.28
TSTA3-216ENST00000533817 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TSTA3-216ENST00000533817 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.04■■□□□ 1.28
TSTA3-216ENST00000533817 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.04■■□□□ 1.28
TSTA3-216ENST00000533817 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TSTA3-216ENST00000533817 REREQ9P2R6 1566 aa23.03■■□□□ 1.28
TSTA3-216ENST00000533817 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.02■■□□□ 1.28
TSTA3-216ENST00000533817 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.01■■□□□ 1.27
TSTA3-216ENST00000533817 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TSTA3-216ENST00000533817 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-216ENST00000533817 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-216ENST00000533817 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-216ENST00000533817 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-216ENST00000533817 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-216ENST00000533817 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-216ENST00000533817 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-216ENST00000533817 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-216ENST00000533817 AGLP35573 1532 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-216ENST00000533817 PLXNC1O60486 1568 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-216ENST00000533817 ABCC5O15440 1437 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-216ENST00000533817 A2MP01023 1474 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-216ENST00000533817 TSPY4P0CV99 314 aa22.91■■□□□ 1.26
TSTA3-216ENST00000533817 TSPY10P0CW01 314 aa22.91■■□□□ 1.26
TSTA3-216ENST00000533817 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.91■■□□□ 1.26
TSTA3-216ENST00000533817 DAPK1P53355 1430 aa22.91■■□□□ 1.26
TSTA3-216ENST00000533817 MADDQ8WXG6 1647 aa22.89■■□□□ 1.25
TSTA3-216ENST00000533817 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TSTA3-216ENST00000533817 MLECQ14165 292 aa22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-216ENST00000533817 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-216ENST00000533817 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-216ENST00000533817 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-216ENST00000533817 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.245e-6■■■■■ 46.2
TSTA3-216ENST00000533817 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-216ENST00000533817 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TSTA3-216ENST00000533817 PTPRMP28827 1452 aa22.79■■□□□ 1.24
TSTA3-216ENST00000533817 ADGRL2O95490 1459 aa22.78■■□□□ 1.24
TSTA3-216ENST00000533817 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.77■■□□□ 1.24
TSTA3-216ENST00000533817 PTPRKQ15262 1439 aa22.76■■□□□ 1.23
TSTA3-216ENST00000533817 KIF15Q9NS87 1388 aa22.76■■□□□ 1.23
TSTA3-216ENST00000533817 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.75■■□□□ 1.23
TSTA3-216ENST00000533817 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TSTA3-216ENST00000533817 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.74■■□□□ 1.23
TSTA3-216ENST00000533817 NCOA1Q15788 1441 aa22.74■■□□□ 1.23
TSTA3-216ENST00000533817 KIF3BO15066 747 aa22.71■■□□□ 1.23
TSTA3-216ENST00000533817 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.71■■□□□ 1.23
TSTA3-216ENST00000533817 ERBINQ96RT1 1412 aa22.7■■□□□ 1.22
TSTA3-216ENST00000533817 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TSTA3-216ENST00000533817 GGT6Q6P531 493 aa22.69■■□□□ 1.22
TSTA3-216ENST00000533817 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.68■■□□□ 1.22
TSTA3-216ENST00000533817 MROH2AA6NES4 1674 aa22.68■■□□□ 1.22
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