RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531951.5

PUF60-217, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 973 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-217ENST00000531951 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.06■■■□□ 2.24
PUF60-217ENST00000531951 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.05■■■□□ 2.24
PUF60-217ENST00000531951 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.04■■■□□ 2.24
PUF60-217ENST00000531951 MIA2Q96PC5 1412 aa29.04■■■□□ 2.24
PUF60-217ENST00000531951 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.04■■■□□ 2.24
PUF60-217ENST00000531951 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29■■■□□ 2.23
PUF60-217ENST00000531951 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PUF60-217ENST00000531951 FANCAO15360 1455 aa28.98■■■□□ 2.23
PUF60-217ENST00000531951 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PUF60-217ENST00000531951 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PUF60-217ENST00000531951 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PUF60-217ENST00000531951 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.95■■■□□ 2.22
PUF60-217ENST00000531951 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.95■■■□□ 2.22
PUF60-217ENST00000531951 NEO1Q92859 1461 aa28.93■■■□□ 2.22
PUF60-217ENST00000531951 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.93■■■□□ 2.22
PUF60-217ENST00000531951 ABCC1P33527 1531 aa28.91■■■□□ 2.22
PUF60-217ENST00000531951 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.89■■■□□ 2.22
PUF60-217ENST00000531951 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
PUF60-217ENST00000531951 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.211e-6■■■□□ 17.2
PUF60-217ENST00000531951 AKNAQ7Z591 1439 aa28.86■■■□□ 2.21
PUF60-217ENST00000531951 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.86■■■□□ 2.21
PUF60-217ENST00000531951 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
PUF60-217ENST00000531951 ADGRL1O94910 1474 aa28.85■■■□□ 2.21
PUF60-217ENST00000531951 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.84■■■□□ 2.21
PUF60-217ENST00000531951 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.84■■■□□ 2.21
PUF60-217ENST00000531951 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
PUF60-217ENST00000531951 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.83■■■□□ 2.21
PUF60-217ENST00000531951 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
PUF60-217ENST00000531951 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.8■■■□□ 2.2
PUF60-217ENST00000531951 RICTORQ6R327 1708 aa28.79■■■□□ 2.2
PUF60-217ENST00000531951 MBD5Q9P267 1494 aa28.78■■■□□ 2.2
PUF60-217ENST00000531951 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.76■■■□□ 2.19
PUF60-217ENST00000531951 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.74■■■□□ 2.19
PUF60-217ENST00000531951 DAPK1P53355 1430 aa28.72■■■□□ 2.19
PUF60-217ENST00000531951 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.72■■■□□ 2.197e-7■■■□□ 18.4
PUF60-217ENST00000531951 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
PUF60-217ENST00000531951 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.71■■■□□ 2.19
PUF60-217ENST00000531951 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
PUF60-217ENST00000531951 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.71■■■□□ 2.19
PUF60-217ENST00000531951 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.7■■■□□ 2.19
PUF60-217ENST00000531951 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.7■■■□□ 2.19
PUF60-217ENST00000531951 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.7■■■□□ 2.18
PUF60-217ENST00000531951 ABCC5O15440 1437 aa28.69■■■□□ 2.18
PUF60-217ENST00000531951 KDM5CP41229 1560 aa28.69■■■□□ 2.18
PUF60-217ENST00000531951 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.68■■■□□ 2.18
PUF60-217ENST00000531951 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.68■■■□□ 2.18
PUF60-217ENST00000531951 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.67■■■□□ 2.18
PUF60-217ENST00000531951 KDM6BO15054 1643 aa28.65■■■□□ 2.18
PUF60-217ENST00000531951 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
PUF60-217ENST00000531951 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
PUF60-217ENST00000531951 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.63■■■□□ 2.17
PUF60-217ENST00000531951 PTPRKQ15262 1439 aa28.62■■■□□ 2.17
PUF60-217ENST00000531951 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.62■■■□□ 2.17
PUF60-217ENST00000531951 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.61■■■□□ 2.17
PUF60-217ENST00000531951 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.6■■■□□ 2.17
PUF60-217ENST00000531951 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.6■■■□□ 2.17
PUF60-217ENST00000531951 ITGAEP38570 1179 aa28.6■■■□□ 2.17
PUF60-217ENST00000531951 AFAP1Q8N556 730 aa28.59■■■□□ 2.17
PUF60-217ENST00000531951 ATP7AQ04656 1500 aa28.59■■■□□ 2.17
PUF60-217ENST00000531951 PLXNC1O60486 1568 aa28.58■■■□□ 2.17
PUF60-217ENST00000531951 RAPGEF3O95398 923 aa28.57■■■□□ 2.16
PUF60-217ENST00000531951 ADGRL2O95490 1459 aa28.57■■■□□ 2.16
PUF60-217ENST00000531951 TSPY4P0CV99 314 aa28.56■■■□□ 2.16
PUF60-217ENST00000531951 TSPY10P0CW01 314 aa28.56■■■□□ 2.16
PUF60-217ENST00000531951 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.55■■■□□ 2.16
PUF60-217ENST00000531951 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.55■■■□□ 2.16
PUF60-217ENST00000531951 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
PUF60-217ENST00000531951 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.53■■■□□ 2.16
PUF60-217ENST00000531951 ROCK1Q13464 1354 aa28.51■■■□□ 2.16
PUF60-217ENST00000531951 ABCA6Q8N139 1617 aa28.51■■■□□ 2.15
PUF60-217ENST00000531951 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.5■■■□□ 2.15
PUF60-217ENST00000531951 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.5■■■□□ 2.15
PUF60-217ENST00000531951 NCOA1Q15788 1441 aa28.48■■■□□ 2.15
PUF60-217ENST00000531951 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.48■■■□□ 2.15
PUF60-217ENST00000531951 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.47■■■□□ 2.15
PUF60-217ENST00000531951 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.45■■■□□ 2.15
PUF60-217ENST00000531951 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.43■■■□□ 2.14
PUF60-217ENST00000531951 HFM1A2PYH4 1435 aa28.43■■■□□ 2.14
PUF60-217ENST00000531951 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.41■■■□□ 2.14
PUF60-217ENST00000531951 KIF15Q9NS87 1388 aa28.4■■■□□ 2.14
PUF60-217ENST00000531951 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.4■■■□□ 2.14
PUF60-217ENST00000531951 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.4■■■□□ 2.14
PUF60-217ENST00000531951 NAIPQ13075 1403 aa28.39■■■□□ 2.14
PUF60-217ENST00000531951 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.38■■■□□ 2.13
PUF60-217ENST00000531951 REREQ9P2R6 1566 aa28.36■■■□□ 2.13
PUF60-217ENST00000531951 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PUF60-217ENST00000531951 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.33■■■□□ 2.13
PUF60-217ENST00000531951 ATP10AO60312 1499 aa28.33■■■□□ 2.13
PUF60-217ENST00000531951 A2MP01023 1474 aa28.33■■■□□ 2.13
PUF60-217ENST00000531951 ERBINQ96RT1 1412 aa28.31■■■□□ 2.12
PUF60-217ENST00000531951 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.31■■■□□ 2.12
PUF60-217ENST00000531951 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.3■■■□□ 2.12
PUF60-217ENST00000531951 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.3■■■□□ 2.12
PUF60-217ENST00000531951 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PUF60-217ENST00000531951 DEPDC5O75140 1603 aa28.24■■■□□ 2.11
PUF60-217ENST00000531951 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
PUF60-217ENST00000531951 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.23■■■□□ 2.11
PUF60-217ENST00000531951 AGLP35573 1532 aa28.23■■■□□ 2.11
PUF60-217ENST00000531951 UNC13BO14795 1591 aa28.21■■■□□ 2.11
PUF60-217ENST00000531951 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.16■■■□□ 2.1
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