RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530002.1

USP2-AS1-203, Transcript of USP2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP2-AS1, Length 764 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2-AS1-203ENST00000530002 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
USP2-AS1-203ENST00000530002 CFAP74Q9C0B2 1584 aa17.13■□□□□ 0.33
USP2-AS1-203ENST00000530002 PIP4K2BP78356 416 aa17.09■□□□□ 0.33
USP2-AS1-203ENST00000530002 C3P01024 1663 aa17.09■□□□□ 0.33
USP2-AS1-203ENST00000530002 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa17.07■□□□□ 0.32
USP2-AS1-203ENST00000530002 HECW1Q76N89 1606 aa17.07■□□□□ 0.32
USP2-AS1-203ENST00000530002 ATP10BO94823 1461 aa17.07■□□□□ 0.32
USP2-AS1-203ENST00000530002 GOLGA3Q08378 1498 aa17.05■□□□□ 0.32
USP2-AS1-203ENST00000530002 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.05■□□□□ 0.32
USP2-AS1-203ENST00000530002 TOM1O60784 492 aa17.05■□□□□ 0.32
USP2-AS1-203ENST00000530002 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
USP2-AS1-203ENST00000530002 ATP10AO60312 1499 aa17.03■□□□□ 0.32
USP2-AS1-203ENST00000530002 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.02■□□□□ 0.31
USP2-AS1-203ENST00000530002 ARID3CA6NKF2 412 aa16.99■□□□□ 0.31
USP2-AS1-203ENST00000530002 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
USP2-AS1-203ENST00000530002 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.97■□□□□ 0.31
USP2-AS1-203ENST00000530002 CPS1P31327 1500 aa16.96■□□□□ 0.3
USP2-AS1-203ENST00000530002 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.95■□□□□ 0.3
USP2-AS1-203ENST00000530002 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.95■□□□□ 0.3
USP2-AS1-203ENST00000530002 PLA2R1Q13018 1463 aa16.94■□□□□ 0.3
USP2-AS1-203ENST00000530002 ALKQ9UM73 1620 aa16.93■□□□□ 0.3
USP2-AS1-203ENST00000530002 PKD2Q13563 968 aa16.92■□□□□ 0.3
USP2-AS1-203ENST00000530002 PTPRKQ15262 1439 aa16.92■□□□□ 0.3
USP2-AS1-203ENST00000530002 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
USP2-AS1-203ENST00000530002 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
USP2-AS1-203ENST00000530002 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
USP2-AS1-203ENST00000530002 POTEAQ6S8J7 498 aa16.89■□□□□ 0.29
USP2-AS1-203ENST00000530002 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.87■□□□□ 0.29
USP2-AS1-203ENST00000530002 NPATQ14207 1427 aa16.87■□□□□ 0.29
USP2-AS1-203ENST00000530002 REREQ9P2R6 1566 aa16.85■□□□□ 0.29
USP2-AS1-203ENST00000530002 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
USP2-AS1-203ENST00000530002 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
USP2-AS1-203ENST00000530002 SCAPERQ9BY12 1400 aa16.84■□□□□ 0.29
USP2-AS1-203ENST00000530002 AGLP35573 1532 aa16.84■□□□□ 0.29
USP2-AS1-203ENST00000530002 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.84■□□□□ 0.29
USP2-AS1-203ENST00000530002 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.83■□□□□ 0.28
USP2-AS1-203ENST00000530002 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.83■□□□□ 0.28
USP2-AS1-203ENST00000530002 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
USP2-AS1-203ENST00000530002 MROH2AA6NES4 1674 aa16.81■□□□□ 0.28
USP2-AS1-203ENST00000530002 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.81■□□□□ 0.28
USP2-AS1-203ENST00000530002 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.8■□□□□ 0.28
USP2-AS1-203ENST00000530002 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
USP2-AS1-203ENST00000530002 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
USP2-AS1-203ENST00000530002 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
USP2-AS1-203ENST00000530002 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
USP2-AS1-203ENST00000530002 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
USP2-AS1-203ENST00000530002 KDM5CP41229 1560 aa16.76■□□□□ 0.27
USP2-AS1-203ENST00000530002 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
USP2-AS1-203ENST00000530002 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.75■□□□□ 0.27
USP2-AS1-203ENST00000530002 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
USP2-AS1-203ENST00000530002 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
USP2-AS1-203ENST00000530002 ABCA6Q8N139 1617 aa16.73■□□□□ 0.27
USP2-AS1-203ENST00000530002 VWDEQ8N2E2 1590 aa16.72■□□□□ 0.27
USP2-AS1-203ENST00000530002 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.71■□□□□ 0.27
USP2-AS1-203ENST00000530002 PLCH2O75038 1416 aa16.7■□□□□ 0.26
USP2-AS1-203ENST00000530002 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.69■□□□□ 0.26
USP2-AS1-203ENST00000530002 SYNMO15061 1565 aa16.66■□□□□ 0.26
USP2-AS1-203ENST00000530002 ZMYM3Q14202 1370 aa16.65■□□□□ 0.26
USP2-AS1-203ENST00000530002 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.64■□□□□ 0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 P3H3Q8IVL6 736 aa16.63■□□□□ 0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 SAMD9Q5K651 1589 aa16.63■□□□□ 0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.62■□□□□ 0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.61■□□□□ 0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.61■□□□□ 0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.61■□□□□ 0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 AFAP1Q8N556 730 aa16.59■□□□□ 0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16.58■□□□□ 0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 STRCP1A6NGW2 1772 aa16.58■□□□□ 0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 DEPDC5O75140 1603 aa16.52■□□□□ 0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 TRIM52Q96A61 297 aa16.52■□□□□ 0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.51■□□□□ 0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 MED14O60244 1454 aa16.51■□□□□ 0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.51■□□□□ 0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 IQGAP1P46940 1657 aa16.5■□□□□ 0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.49■□□□□ 0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.46■□□□□ 0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.46■□□□□ 0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa16.44■□□□□ 0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.44■□□□□ 0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 PRXQ9BXM0 1461 aa16.44■□□□□ 0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 ABCC1P33527 1531 aa16.44■□□□□ 0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.43■□□□□ 0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 FOXD1Q16676 465 aa16.42■□□□□ 0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.4■□□□□ 0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 KIF14Q15058 1648 aa16.4■□□□□ 0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 IFFO2Q5TF58 517 aa16.39■□□□□ 0.21
USP2-AS1-203ENST00000530002 JCADQ9P266 1359 aa16.38■□□□□ 0.21
USP2-AS1-203ENST00000530002 PLXNC1O60486 1568 aa16.38■□□□□ 0.21
USP2-AS1-203ENST00000530002 RXRBP28702 533 aa16.38■□□□□ 0.21
USP2-AS1-203ENST00000530002 PHLPP1O60346 1717 aa16.37■□□□□ 0.21
USP2-AS1-203ENST00000530002 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.36■□□□□ 0.21
USP2-AS1-203ENST00000530002 LRP6O75581 1613 aa16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms