RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529362.1

GATD1-210, Transcript of glutamine amidotransferase like class 1 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene GATD1, Length 578 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1-210ENST00000529362 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
GATD1-210ENST00000529362 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
GATD1-210ENST00000529362 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
GATD1-210ENST00000529362 RICTORQ6R327 1708 aa37.37■■■■□ 3.57
GATD1-210ENST00000529362 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.37■■■■□ 3.57
GATD1-210ENST00000529362 NCOA2Q15596 1464 aa37.36■■■■□ 3.57
GATD1-210ENST00000529362 ADGRL1O94910 1474 aa37.32■■■■□ 3.56
GATD1-210ENST00000529362 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.3■■■■□ 3.56
GATD1-210ENST00000529362 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.29■■■■□ 3.56
GATD1-210ENST00000529362 ABCC1P33527 1531 aa37.27■■■■□ 3.56
GATD1-210ENST00000529362 RAPGEF3O95398 923 aa37.27■■■■□ 3.56
GATD1-210ENST00000529362 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.27■■■■□ 3.56
GATD1-210ENST00000529362 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.27■■■■□ 3.56
GATD1-210ENST00000529362 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.55
GATD1-210ENST00000529362 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.25■■■■□ 3.55
GATD1-210ENST00000529362 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.24■■■■□ 3.55
GATD1-210ENST00000529362 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.21■■■■□ 3.55
GATD1-210ENST00000529362 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.18■■■■□ 3.54
GATD1-210ENST00000529362 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.15■■■■□ 3.54
GATD1-210ENST00000529362 APLP2Q06481 763 aa37.14■■■■□ 3.54
GATD1-210ENST00000529362 KDM5CP41229 1560 aa37.12■■■■□ 3.53
GATD1-210ENST00000529362 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.11■■■■□ 3.53
GATD1-210ENST00000529362 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
GATD1-210ENST00000529362 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
GATD1-210ENST00000529362 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
GATD1-210ENST00000529362 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.08■■■■□ 3.53
GATD1-210ENST00000529362 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.07■■■■□ 3.52
GATD1-210ENST00000529362 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.04■■■■□ 3.52
GATD1-210ENST00000529362 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.04■■■■□ 3.52
GATD1-210ENST00000529362 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.03■■■■□ 3.52
GATD1-210ENST00000529362 AFAP1Q8N556 730 aa37.02■■■■□ 3.52
GATD1-210ENST00000529362 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.01■■■■□ 3.51
GATD1-210ENST00000529362 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.01■■■■□ 3.51
GATD1-210ENST00000529362 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37■■■■□ 3.51
GATD1-210ENST00000529362 HECW2Q9P2P5 1572 aa37■■■■□ 3.51
GATD1-210ENST00000529362 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.99■■■■□ 3.51
GATD1-210ENST00000529362 MBD5Q9P267 1494 aa36.99■■■■□ 3.51
GATD1-210ENST00000529362 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.97■■■■□ 3.51
GATD1-210ENST00000529362 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.95■■■■□ 3.51
GATD1-210ENST00000529362 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.94■■■■□ 3.5
GATD1-210ENST00000529362 ABCA6Q8N139 1617 aa36.94■■■■□ 3.5
GATD1-210ENST00000529362 MIA2Q96PC5 1412 aa36.92■■■■□ 3.5
GATD1-210ENST00000529362 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
GATD1-210ENST00000529362 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.91■■■■□ 3.5
GATD1-210ENST00000529362 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.9■■■■□ 3.5
GATD1-210ENST00000529362 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
GATD1-210ENST00000529362 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.89■■■■□ 3.5
GATD1-210ENST00000529362 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.87■■■■□ 3.49
GATD1-210ENST00000529362 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.86■■■■□ 3.49
GATD1-210ENST00000529362 ATP7AQ04656 1500 aa36.82■■■■□ 3.48
GATD1-210ENST00000529362 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
GATD1-210ENST00000529362 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.82■■■■□ 3.48
GATD1-210ENST00000529362 ATP10AO60312 1499 aa36.77■■■■□ 3.48
GATD1-210ENST00000529362 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.75■■■■□ 3.47
GATD1-210ENST00000529362 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.75■■■■□ 3.47
GATD1-210ENST00000529362 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.74■■■■□ 3.47
GATD1-210ENST00000529362 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
GATD1-210ENST00000529362 REREQ9P2R6 1566 aa36.74■■■■□ 3.47
GATD1-210ENST00000529362 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.73■■■■□ 3.47
GATD1-210ENST00000529362 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.71■■■■□ 3.47
GATD1-210ENST00000529362 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
GATD1-210ENST00000529362 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.68■■■■□ 3.46
GATD1-210ENST00000529362 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.67■■■■□ 3.46
GATD1-210ENST00000529362 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.66■■■■□ 3.46
GATD1-210ENST00000529362 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.65■■■■□ 3.46
GATD1-210ENST00000529362 PLXNC1O60486 1568 aa36.65■■■■□ 3.46
GATD1-210ENST00000529362 ABCC5O15440 1437 aa36.63■■■■□ 3.45
GATD1-210ENST00000529362 DAPK1P53355 1430 aa36.6■■■■□ 3.45
GATD1-210ENST00000529362 MADDQ8WXG6 1647 aa36.59■■■■□ 3.45
GATD1-210ENST00000529362 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.58■■■■□ 3.45
GATD1-210ENST00000529362 AGLP35573 1532 aa36.58■■■■□ 3.45
GATD1-210ENST00000529362 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
GATD1-210ENST00000529362 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.56■■■■□ 3.44
GATD1-210ENST00000529362 A2MP01023 1474 aa36.56■■■■□ 3.44
GATD1-210ENST00000529362 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
GATD1-210ENST00000529362 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.48■■■■□ 3.43
GATD1-210ENST00000529362 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
GATD1-210ENST00000529362 TSPY4P0CV99 314 aa36.47■■■■□ 3.43
GATD1-210ENST00000529362 TSPY10P0CW01 314 aa36.47■■■■□ 3.43
GATD1-210ENST00000529362 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
GATD1-210ENST00000529362 PTPRKQ15262 1439 aa36.46■■■■□ 3.43
GATD1-210ENST00000529362 MLECQ14165 292 aa36.45■■■■□ 3.43
GATD1-210ENST00000529362 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
GATD1-210ENST00000529362 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.38■■■■□ 3.415e-8■■■■■ 46.6
GATD1-210ENST00000529362 ADGRL2O95490 1459 aa36.37■■■■□ 3.41
GATD1-210ENST00000529362 PTPRMP28827 1452 aa36.36■■■■□ 3.41
GATD1-210ENST00000529362 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.35■■■■□ 3.41
GATD1-210ENST00000529362 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.33■■■■□ 3.41
GATD1-210ENST00000529362 KIF15Q9NS87 1388 aa36.32■■■■□ 3.4
GATD1-210ENST00000529362 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
GATD1-210ENST00000529362 NCOA1Q15788 1441 aa36.31■■■■□ 3.4
GATD1-210ENST00000529362 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
GATD1-210ENST00000529362 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.28■■■■□ 3.4
GATD1-210ENST00000529362 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.27■■■■□ 3.4
GATD1-210ENST00000529362 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
GATD1-210ENST00000529362 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
GATD1-210ENST00000529362 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.25■■■■□ 3.39
GATD1-210ENST00000529362 KIF3BO15066 747 aa36.22■■■■□ 3.39
GATD1-210ENST00000529362 C3P01024 1663 aa36.22■■■■□ 3.39
GATD1-210ENST00000529362 ERBINQ96RT1 1412 aa36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119 ms