RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526137.1

SIPA1-202, Transcript of signal-induced proliferation-associated 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIPA1, Length 379 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1-202ENST00000526137 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.84■■■■■ 4.45
SIPA1-202ENST00000526137 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.84■■■■■ 4.45
SIPA1-202ENST00000526137 FBXO41Q8TF61 875 aa42.84■■■■■ 4.45
SIPA1-202ENST00000526137 MLECQ14165 292 aa42.8■■■■■ 4.44
SIPA1-202ENST00000526137 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.8■■■■■ 4.44
SIPA1-202ENST00000526137 HECW1Q76N89 1606 aa42.78■■■■■ 4.44
SIPA1-202ENST00000526137 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
SIPA1-202ENST00000526137 HSPA2P54652 639 aa42.73■■■■■ 4.43
SIPA1-202ENST00000526137 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.69■■■■■ 4.42
SIPA1-202ENST00000526137 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
SIPA1-202ENST00000526137 ATP10AO60312 1499 aa42.68■■■■■ 4.42
SIPA1-202ENST00000526137 AFAP1Q8N556 730 aa42.63■■■■■ 4.41
SIPA1-202ENST00000526137 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.59■■■■■ 4.41
SIPA1-202ENST00000526137 KIF14Q15058 1648 aa42.59■■■■■ 4.41
SIPA1-202ENST00000526137 CLIP1P30622 1438 aa42.57■■■■■ 4.41
SIPA1-202ENST00000526137 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.54■■■■■ 4.4
SIPA1-202ENST00000526137 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.53■■■■■ 4.4
SIPA1-202ENST00000526137 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.53■■■■■ 4.4
SIPA1-202ENST00000526137 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.51■■■■■ 4.4
SIPA1-202ENST00000526137 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
SIPA1-202ENST00000526137 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.47■■■■■ 4.39
SIPA1-202ENST00000526137 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.43■■■■■ 4.38
SIPA1-202ENST00000526137 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.42■■■■■ 4.38
SIPA1-202ENST00000526137 KDM5CP41229 1560 aa42.41■■■■■ 4.38
SIPA1-202ENST00000526137 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.35■■■■■ 4.37
SIPA1-202ENST00000526137 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.34■■■■■ 4.37
SIPA1-202ENST00000526137 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.34■■■■■ 4.37
SIPA1-202ENST00000526137 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.33■■■■■ 4.37
SIPA1-202ENST00000526137 CERKQ8TCT0 537 aa42.3■■■■■ 4.36
SIPA1-202ENST00000526137 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.28■■■■■ 4.36
SIPA1-202ENST00000526137 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.26■■■■■ 4.36
SIPA1-202ENST00000526137 REREQ9P2R6 1566 aa42.22■■■■■ 4.35
SIPA1-202ENST00000526137 ABCC1P33527 1531 aa42.21■■■■■ 4.35
SIPA1-202ENST00000526137 PREX2Q70Z35 1606 aa42.2■■■■■ 4.35
SIPA1-202ENST00000526137 ABCA6Q8N139 1617 aa42.17■■■■■ 4.34
SIPA1-202ENST00000526137 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.17■■■■■ 4.34
SIPA1-202ENST00000526137 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.17■■■■■ 4.34
SIPA1-202ENST00000526137 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
SIPA1-202ENST00000526137 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
SIPA1-202ENST00000526137 AGLP35573 1532 aa42.15■■■■■ 4.34
SIPA1-202ENST00000526137 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.15■■■■■ 4.34
SIPA1-202ENST00000526137 PREX1Q8TCU6 1659 aa42.15■■■■■ 4.34
SIPA1-202ENST00000526137 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
SIPA1-202ENST00000526137 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.07■■■■■ 4.33
SIPA1-202ENST00000526137 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.06■■■■■ 4.32
SIPA1-202ENST00000526137 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
SIPA1-202ENST00000526137 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
SIPA1-202ENST00000526137 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.01■■■■■ 4.32
SIPA1-202ENST00000526137 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.01■■■■■ 4.32
SIPA1-202ENST00000526137 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.99■■■■■ 4.31
SIPA1-202ENST00000526137 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
SIPA1-202ENST00000526137 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.98■■■■■ 4.31
SIPA1-202ENST00000526137 STRCQ7RTU9 1775 aa41.96■■■■■ 4.31
SIPA1-202ENST00000526137 C3P01024 1663 aa41.95■■■■■ 4.31
SIPA1-202ENST00000526137 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.94■■■■■ 4.3
SIPA1-202ENST00000526137 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.94■■■■■ 4.3
SIPA1-202ENST00000526137 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.92■■■■■ 4.3
SIPA1-202ENST00000526137 PTPRTO14522 1441 aa41.9■■■■■ 4.3
SIPA1-202ENST00000526137 ZMYM3Q14202 1370 aa41.88■■■■■ 4.29
SIPA1-202ENST00000526137 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.88■■■■■ 4.29
SIPA1-202ENST00000526137 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.85■■■■■ 4.29
SIPA1-202ENST00000526137 NPATQ14207 1427 aa41.81■■■■■ 4.28
SIPA1-202ENST00000526137 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
SIPA1-202ENST00000526137 ATP7AQ04656 1500 aa41.79■■■■■ 4.28
SIPA1-202ENST00000526137 NCOA1Q15788 1441 aa41.78■■■■■ 4.28
SIPA1-202ENST00000526137 A2MP01023 1474 aa41.77■■■■■ 4.28
SIPA1-202ENST00000526137 GGT6Q6P531 493 aa41.75■■■■■ 4.27
SIPA1-202ENST00000526137 PLXNC1O60486 1568 aa41.69■■■■■ 4.26
SIPA1-202ENST00000526137 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
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SIPA1-202ENST00000526137 MROH2AA6NES4 1674 aa41.66■■■■■ 4.26
SIPA1-202ENST00000526137 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.66■■■■■ 4.26
SIPA1-202ENST00000526137 MBD5Q9P267 1494 aa41.66■■■■■ 4.26
SIPA1-202ENST00000526137 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.65■■■■■ 4.26
SIPA1-202ENST00000526137 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.63■■■■■ 4.26
SIPA1-202ENST00000526137 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.62■■■■■ 4.25
SIPA1-202ENST00000526137 PTPRKQ15262 1439 aa41.62■■■■■ 4.25
SIPA1-202ENST00000526137 CEP162Q5TB80 1403 aa41.61■■■■■ 4.25
SIPA1-202ENST00000526137 TIAM1Q13009 1591 aa41.6■■■■■ 4.25
SIPA1-202ENST00000526137 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.56■■■■■ 4.24
SIPA1-202ENST00000526137 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.56■■■■■ 4.24
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SIPA1-202ENST00000526137 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.49■■■■■ 4.23
SIPA1-202ENST00000526137 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
SIPA1-202ENST00000526137 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.47■■■■■ 4.23
SIPA1-202ENST00000526137 PLA2R1Q13018 1463 aa41.47■■■■■ 4.23
SIPA1-202ENST00000526137 KIF3BO15066 747 aa41.44■■■■■ 4.22
SIPA1-202ENST00000526137 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.44■■■■■ 4.22
SIPA1-202ENST00000526137 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.43■■■■■ 4.22
SIPA1-202ENST00000526137 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
SIPA1-202ENST00000526137 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
SIPA1-202ENST00000526137 NCOA2Q15596 1464 aa41.41■■■■■ 4.22
SIPA1-202ENST00000526137 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.41■■■■■ 4.22
SIPA1-202ENST00000526137 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
SIPA1-202ENST00000526137 ILDR2Q71H61 639 aa41.39■■■■■ 4.22
SIPA1-202ENST00000526137 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.37■■■■■ 4.21
SIPA1-202ENST00000526137 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
SIPA1-202ENST00000526137 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.34■■■■■ 4.21
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