RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520911.5

RNF130-204, Transcript of ring finger protein 130, human

TSL 1 (best)

Gene RNF130, Length 1,790 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF130-204	ENST00000520911	TSPOAP1	O95153	1857 aa		43.31	■■■■■ 4.52
RNF130-204	ENST00000520911	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.31	■■■■■ 4.52
RNF130-204	ENST00000520911	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		43.29	■■■■■ 4.52
RNF130-204	ENST00000520911	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	43.27	■■■■■ 4.52
RNF130-204	ENST00000520911	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.24	■■■■■ 4.51
RNF130-204	ENST00000520911	MIA2	Q96PC5	1412 aa		43.22	■■■■■ 4.51
RNF130-204	ENST00000520911	FANCA	O15360	1455 aa		43.22	■■■■■ 4.51
RNF130-204	ENST00000520911	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	43.21	■■■■■ 4.51
RNF130-204	ENST00000520911	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		43.21	■■■■■ 4.51
RNF130-204	ENST00000520911	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		43.16	■■■■■ 4.5
RNF130-204	ENST00000520911	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	43.16	■■■■■ 4.5
RNF130-204	ENST00000520911	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	43.15	■■■■■ 4.5
RNF130-204	ENST00000520911	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.13	■■■■■ 4.5
RNF130-204	ENST00000520911	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		43.12	■■■■■ 4.49
RNF130-204	ENST00000520911	AKNA	Q7Z591	1439 aa		43.09	■■■■■ 4.49
RNF130-204	ENST00000520911	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	43.07	■■■■■ 4.49
RNF130-204	ENST00000520911	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		43.07	■■■■■ 4.48
RNF130-204	ENST00000520911	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	43.06	■■■■■ 4.48	6e-7	■■■■□ 24.1
RNF130-204	ENST00000520911	NEO1	Q92859	1461 aa		43.04	■■■■■ 4.48
RNF130-204	ENST00000520911	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		43.02	■■■■■ 4.48
RNF130-204	ENST00000520911	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.01	■■■■■ 4.48
RNF130-204	ENST00000520911	ADGRL1	O94910	1474 aa		43.01	■■■■■ 4.48
RNF130-204	ENST00000520911	ABCC1	P33527	1531 aa		42.99	■■■■■ 4.47
RNF130-204	ENST00000520911	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.99	■■■■■ 4.47
RNF130-204	ENST00000520911	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		42.98	■■■■■ 4.47
RNF130-204	ENST00000520911	ITGAE	P38570	1179 aa		42.95	■■■■■ 4.47
RNF130-204	ENST00000520911	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.94	■■■■■ 4.46
RNF130-204	ENST00000520911	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.94	■■■■■ 4.46
RNF130-204	ENST00000520911	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.94	■■■■■ 4.46
RNF130-204	ENST00000520911	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.92	■■■■■ 4.46
RNF130-204	ENST00000520911	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	42.9	■■■■■ 4.46
RNF130-204	ENST00000520911	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.89	■■■■■ 4.46
RNF130-204	ENST00000520911	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.87	■■■■■ 4.45
RNF130-204	ENST00000520911	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.86	■■■■■ 4.45
RNF130-204	ENST00000520911	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.84	■■■■■ 4.45
RNF130-204	ENST00000520911	ABCC5	O15440	1437 aa		42.84	■■■■■ 4.45
RNF130-204	ENST00000520911	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	42.82	■■■■■ 4.45
RNF130-204	ENST00000520911	DAPK1	P53355	1430 aa		42.82	■■■■■ 4.44
RNF130-204	ENST00000520911	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.81	■■■■■ 4.44
RNF130-204	ENST00000520911	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.8	■■■■■ 4.44
RNF130-204	ENST00000520911	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.79	■■■■■ 4.44
RNF130-204	ENST00000520911	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.79	■■■■■ 4.44
RNF130-204	ENST00000520911	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.78	■■■■■ 4.44
RNF130-204	ENST00000520911	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.76	■■■■■ 4.44
RNF130-204	ENST00000520911	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.75	■■■■■ 4.43
RNF130-204	ENST00000520911	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.72	■■■■■ 4.43
RNF130-204	ENST00000520911	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.7	■■■■■ 4.43
RNF130-204	ENST00000520911	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.7	■■■■■ 4.43
RNF130-204	ENST00000520911	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.7	■■■■■ 4.43
RNF130-204	ENST00000520911	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.69	■■■■■ 4.42
RNF130-204	ENST00000520911	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.66	■■■■■ 4.42
RNF130-204	ENST00000520911	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
RNF130-204	ENST00000520911	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.65	■■■■■ 4.42
RNF130-204	ENST00000520911	KDM6B	O15054	1643 aa		42.64	■■■■■ 4.42
RNF130-204	ENST00000520911	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		42.63	■■■■■ 4.42
RNF130-204	ENST00000520911	KDM5C	P41229	1560 aa		42.63	■■■■■ 4.41
RNF130-204	ENST00000520911	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.62	■■■■■ 4.41
RNF130-204	ENST00000520911	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.59	■■■■■ 4.41
RNF130-204	ENST00000520911	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.55	■■■■■ 4.4
RNF130-204	ENST00000520911	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.54	■■■■■ 4.4
RNF130-204	ENST00000520911	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.54	■■■■■ 4.4
RNF130-204	ENST00000520911	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.52	■■■■■ 4.4
RNF130-204	ENST00000520911	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.51	■■■■■ 4.4
RNF130-204	ENST00000520911	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
RNF130-204	ENST00000520911	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.51	■■■■■ 4.4
RNF130-204	ENST00000520911	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.5	■■■■■ 4.39
RNF130-204	ENST00000520911	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.5	■■■■■ 4.39
RNF130-204	ENST00000520911	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.5	■■■■■ 4.39
RNF130-204	ENST00000520911	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.48	■■■■■ 4.39
RNF130-204	ENST00000520911	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.47	■■■■■ 4.39
RNF130-204	ENST00000520911	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.47	■■■■■ 4.39
RNF130-204	ENST00000520911	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.47	■■■■■ 4.39
RNF130-204	ENST00000520911	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.46	■■■■■ 4.39
RNF130-204	ENST00000520911	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.45	■■■■■ 4.39
RNF130-204	ENST00000520911	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.4	■■■■■ 4.38
RNF130-204	ENST00000520911	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.38	■■■■■ 4.38
RNF130-204	ENST00000520911	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.38	■■■■■ 4.37
RNF130-204	ENST00000520911	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.37	■■■■■ 4.37
RNF130-204	ENST00000520911	NAIP	Q13075	1403 aa		42.34	■■■■■ 4.37
RNF130-204	ENST00000520911	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.33	■■■■■ 4.37
RNF130-204	ENST00000520911	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.33	■■■■■ 4.37
RNF130-204	ENST00000520911	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.27	■■■■■ 4.36
RNF130-204	ENST00000520911	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.24	■■■■■ 4.35
RNF130-204	ENST00000520911	ATP10A	O60312	1499 aa		42.24	■■■■■ 4.35
RNF130-204	ENST00000520911	A2M	P01023	1474 aa		42.24	■■■■■ 4.35
RNF130-204	ENST00000520911	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.23	■■■■■ 4.35
RNF130-204	ENST00000520911	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.23	■■■■■ 4.35
RNF130-204	ENST00000520911	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.23	■■■■■ 4.35
RNF130-204	ENST00000520911	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		42.23	■■■■■ 4.35
RNF130-204	ENST00000520911	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		42.16	■■■■■ 4.34
RNF130-204	ENST00000520911	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.12	■■■■■ 4.33
RNF130-204	ENST00000520911	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.11	■■■■■ 4.33
RNF130-204	ENST00000520911	KIF3B	O15066	747 aa		42.1	■■■■■ 4.33
RNF130-204	ENST00000520911	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.06	■■■■■ 4.32
RNF130-204	ENST00000520911	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42	■■■■■ 4.31
RNF130-204	ENST00000520911	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.98	■■■■■ 4.31
RNF130-204	ENST00000520911	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	41.98	■■■■■ 4.31
RNF130-204	ENST00000520911	GGT6	Q6P531	493 aa		41.97	■■■■■ 4.31
RNF130-204	ENST00000520911	AGL	P35573	1532 aa		41.95	■■■■■ 4.31
RNF130-204	ENST00000520911	TRIM52	Q96A61	297 aa		41.95	■■■■■ 4.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms