RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519020.5

FAM49B-210, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM49B, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49B-210ENST00000519020 PREX2Q70Z35 1606 aa25.83■■□□□ 1.73
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FAM49B-210ENST00000519020 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.8■■□□□ 1.72
FAM49B-210ENST00000519020 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.79■■□□□ 1.72
FAM49B-210ENST00000519020 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.78■■□□□ 1.72
FAM49B-210ENST00000519020 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.78■■□□□ 1.72
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FAM49B-210ENST00000519020 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.77■■□□□ 1.72
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.73■■□□□ 1.71
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FAM49B-210ENST00000519020 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.66■■□□□ 1.7
FAM49B-210ENST00000519020 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.65■■□□□ 1.7
FAM49B-210ENST00000519020 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
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FAM49B-210ENST00000519020 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.62■■□□□ 1.69
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FAM49B-210ENST00000519020 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.59■■□□□ 1.69
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FAM49B-210ENST00000519020 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.57■■□□□ 1.68
FAM49B-210ENST00000519020 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.57■■□□□ 1.68
FAM49B-210ENST00000519020 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.56■■□□□ 1.68
FAM49B-210ENST00000519020 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
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FAM49B-210ENST00000519020 AFAP1Q8N556 730 aa25.53■■□□□ 1.68
FAM49B-210ENST00000519020 TIAM1Q13009 1591 aa25.52■■□□□ 1.68
FAM49B-210ENST00000519020 ABCA6Q8N139 1617 aa25.52■■□□□ 1.68
FAM49B-210ENST00000519020 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.52■■□□□ 1.68
FAM49B-210ENST00000519020 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.52■■□□□ 1.68
FAM49B-210ENST00000519020 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.52■■□□□ 1.68
FAM49B-210ENST00000519020 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.52■■□□□ 1.68
FAM49B-210ENST00000519020 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.51■■□□□ 1.67
FAM49B-210ENST00000519020 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
FAM49B-210ENST00000519020 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.48■■□□□ 1.67
FAM49B-210ENST00000519020 MAP3K1Q13233 1512 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM49B-210ENST00000519020 AGLP35573 1532 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
FAM49B-210ENST00000519020 NCOA2Q15596 1464 aa25.41■■□□□ 1.66
FAM49B-210ENST00000519020 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
FAM49B-210ENST00000519020 ATP7AQ04656 1500 aa25.4■■□□□ 1.66
FAM49B-210ENST00000519020 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.39■■□□□ 1.65
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FAM49B-210ENST00000519020 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
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FAM49B-210ENST00000519020 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.3■■□□□ 1.64
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FAM49B-210ENST00000519020 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM49B-210ENST00000519020 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM49B-210ENST00000519020 MROH2AA6NES4 1674 aa25.28■■□□□ 1.64
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FAM49B-210ENST00000519020 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM49B-210ENST00000519020 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.27■■□□□ 1.64
FAM49B-210ENST00000519020 A2MP01023 1474 aa25.27■■□□□ 1.64
FAM49B-210ENST00000519020 C3P01024 1663 aa25.26■■□□□ 1.63
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
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FAM49B-210ENST00000519020 APLP2Q06481 763 aa25.23■■□□□ 1.63
FAM49B-210ENST00000519020 MIA2Q96PC5 1412 aa25.21■■□□□ 1.63
FAM49B-210ENST00000519020 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.19■■□□□ 1.62
FAM49B-210ENST00000519020 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.18■■□□□ 1.62
FAM49B-210ENST00000519020 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
FAM49B-210ENST00000519020 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.16■■□□□ 1.62
FAM49B-210ENST00000519020 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.15■■□□□ 1.62
FAM49B-210ENST00000519020 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
FAM49B-210ENST00000519020 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
FAM49B-210ENST00000519020 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.13■■□□□ 1.61
FAM49B-210ENST00000519020 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.13■■□□□ 1.61
FAM49B-210ENST00000519020 TSPY4P0CV99 314 aa25.12■■□□□ 1.61
FAM49B-210ENST00000519020 TSPY10P0CW01 314 aa25.12■■□□□ 1.61
FAM49B-210ENST00000519020 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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FAM49B-210ENST00000519020 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.08■■□□□ 1.6
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FAM49B-210ENST00000519020 ZMYM3Q14202 1370 aa25.05■■□□□ 1.6
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FAM49B-210ENST00000519020 HSPA2P54652 639 aa25.04■■□□□ 1.6
FAM49B-210ENST00000519020 GGT6Q6P531 493 aa25.04■■□□□ 1.6
FAM49B-210ENST00000519020 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.02■■□□□ 1.6
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
FAM49B-210ENST00000519020 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
FAM49B-210ENST00000519020 KDM5DQ9BY66 1539 aa25■■□□□ 1.59
FAM49B-210ENST00000519020 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
FAM49B-210ENST00000519020 STRCQ7RTU9 1775 aa25■■□□□ 1.59
FAM49B-210ENST00000519020 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
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