RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513246.5

CANX-217, Transcript of calnexin, humanhuman

TSL 5

Gene CANX, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANX-217ENST00000513246 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.91■■■□□ 2.22
CANX-217ENST00000513246 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.9■■■□□ 2.22
CANX-217ENST00000513246 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.89■■■□□ 2.21
CANX-217ENST00000513246 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.87■■■□□ 2.21
CANX-217ENST00000513246 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.87■■■□□ 2.21
CANX-217ENST00000513246 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.87■■■□□ 2.21
CANX-217ENST00000513246 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.86■■■□□ 2.21
CANX-217ENST00000513246 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.84■■■□□ 2.21
CANX-217ENST00000513246 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.84■■■□□ 2.21
CANX-217ENST00000513246 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.84■■■□□ 2.21
CANX-217ENST00000513246 TIAM1Q13009 1591 aa28.79■■■□□ 2.2
CANX-217ENST00000513246 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CANX-217ENST00000513246 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.78■■■□□ 2.2
CANX-217ENST00000513246 ABCC1P33527 1531 aa28.78■■■□□ 2.2
CANX-217ENST00000513246 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.76■■■□□ 2.19
CANX-217ENST00000513246 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.75■■■□□ 2.19
CANX-217ENST00000513246 KDM5CP41229 1560 aa28.75■■■□□ 2.19
CANX-217ENST00000513246 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.73■■■□□ 2.19
CANX-217ENST00000513246 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.73■■■□□ 2.19
CANX-217ENST00000513246 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.73■■■□□ 2.19
CANX-217ENST00000513246 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CANX-217ENST00000513246 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.72■■■□□ 2.19
CANX-217ENST00000513246 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.71■■■□□ 2.19
CANX-217ENST00000513246 MAP3K1Q13233 1512 aa28.7■■■□□ 2.19
CANX-217ENST00000513246 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.69■■■□□ 2.18
CANX-217ENST00000513246 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
CANX-217ENST00000513246 AFAP1Q8N556 730 aa28.66■■■□□ 2.18
CANX-217ENST00000513246 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.66■■■□□ 2.18
CANX-217ENST00000513246 PTPRMP28827 1452 aa28.66■■■□□ 2.18
CANX-217ENST00000513246 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.66■■■□□ 2.18
CANX-217ENST00000513246 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
CANX-217ENST00000513246 NCOA2Q15596 1464 aa28.65■■■□□ 2.18
CANX-217ENST00000513246 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.63■■■□□ 2.17
CANX-217ENST00000513246 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.63■■■□□ 2.17
CANX-217ENST00000513246 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CANX-217ENST00000513246 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.63■■■□□ 2.17
CANX-217ENST00000513246 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.62■■■□□ 2.17
CANX-217ENST00000513246 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CANX-217ENST00000513246 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.61■■■□□ 2.17
CANX-217ENST00000513246 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.61■■■□□ 2.17
CANX-217ENST00000513246 ATP10AO60312 1499 aa28.6■■■□□ 2.17
CANX-217ENST00000513246 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.59■■■□□ 2.17
CANX-217ENST00000513246 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.57■■■□□ 2.16
CANX-217ENST00000513246 ABCA6Q8N139 1617 aa28.55■■■□□ 2.16
CANX-217ENST00000513246 MADDQ8WXG6 1647 aa28.54■■■□□ 2.16
CANX-217ENST00000513246 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CANX-217ENST00000513246 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.53■■■□□ 2.16
CANX-217ENST00000513246 REREQ9P2R6 1566 aa28.53■■■□□ 2.16
CANX-217ENST00000513246 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.162e-9■■■■■ 36.1
CANX-217ENST00000513246 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
CANX-217ENST00000513246 MBD5Q9P267 1494 aa28.48■■■□□ 2.15
CANX-217ENST00000513246 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.48■■■□□ 2.15
CANX-217ENST00000513246 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CANX-217ENST00000513246 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.46■■■□□ 2.15
CANX-217ENST00000513246 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
CANX-217ENST00000513246 APLP2Q06481 763 aa28.45■■■□□ 2.14
CANX-217ENST00000513246 ATP7AQ04656 1500 aa28.44■■■□□ 2.14
CANX-217ENST00000513246 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CANX-217ENST00000513246 AGLP35573 1532 aa28.42■■■□□ 2.14
CANX-217ENST00000513246 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.4■■■□□ 2.14
CANX-217ENST00000513246 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.4■■■□□ 2.14
CANX-217ENST00000513246 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.39■■■□□ 2.13
CANX-217ENST00000513246 MLECQ14165 292 aa28.38■■■□□ 2.13
CANX-217ENST00000513246 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.37■■■□□ 2.13
CANX-217ENST00000513246 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.37■■■□□ 2.13
CANX-217ENST00000513246 MIA2Q96PC5 1412 aa28.36■■■□□ 2.13
CANX-217ENST00000513246 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.35■■■□□ 2.13
CANX-217ENST00000513246 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.34■■■□□ 2.13
CANX-217ENST00000513246 PLXNC1O60486 1568 aa28.33■■■□□ 2.13
CANX-217ENST00000513246 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.31■■■□□ 2.12
CANX-217ENST00000513246 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.31■■■□□ 2.12
CANX-217ENST00000513246 A2MP01023 1474 aa28.29■■■□□ 2.12
CANX-217ENST00000513246 HSPA2P54652 639 aa28.29■■■□□ 2.12
CANX-217ENST00000513246 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.23■■■□□ 2.11
CANX-217ENST00000513246 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.22■■■□□ 2.11
CANX-217ENST00000513246 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.22■■■□□ 2.11
CANX-217ENST00000513246 FBXO41Q8TF61 875 aa28.2■■■□□ 2.1
CANX-217ENST00000513246 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CANX-217ENST00000513246 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
CANX-217ENST00000513246 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
CANX-217ENST00000513246 TSPY4P0CV99 314 aa28.17■■■□□ 2.1
CANX-217ENST00000513246 TSPY10P0CW01 314 aa28.17■■■□□ 2.1
CANX-217ENST00000513246 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.16■■■□□ 2.1
CANX-217ENST00000513246 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.13■■■□□ 2.09
CANX-217ENST00000513246 C3P01024 1663 aa28.13■■■□□ 2.09
CANX-217ENST00000513246 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.12■■■□□ 2.09
CANX-217ENST00000513246 MROH2AA6NES4 1674 aa28.11■■■□□ 2.09
CANX-217ENST00000513246 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CANX-217ENST00000513246 ABCC5O15440 1437 aa28.1■■■□□ 2.09
CANX-217ENST00000513246 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CANX-217ENST00000513246 DAPK1P53355 1430 aa28.08■■■□□ 2.09
CANX-217ENST00000513246 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CANX-217ENST00000513246 GGT6Q6P531 493 aa28.05■■■□□ 2.08
CANX-217ENST00000513246 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.05■■■□□ 2.08
CANX-217ENST00000513246 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.04■■■□□ 2.08
CANX-217ENST00000513246 KIF3BO15066 747 aa28.02■■■□□ 2.08
CANX-217ENST00000513246 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CANX-217ENST00000513246 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CANX-217ENST00000513246 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.01■■■□□ 2.07
CANX-217ENST00000513246 ZMYM3Q14202 1370 aa28■■■□□ 2.07
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