RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.34■■■□□ 2.61
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF14Q15058 1648 aa31.32■■■□□ 2.6
SH3BP2-220ENST00000511663 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.32■■■□□ 2.6
SH3BP2-220ENST00000511663 MADDQ8WXG6 1647 aa31.31■■■□□ 2.6
SH3BP2-220ENST00000511663 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.31■■■□□ 2.6
SH3BP2-220ENST00000511663 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.3■■■□□ 2.6
SH3BP2-220ENST00000511663 MLECQ14165 292 aa31.29■■■□□ 2.6
SH3BP2-220ENST00000511663 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.28■■■□□ 2.6
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.26■■■□□ 2.59
SH3BP2-220ENST00000511663 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.25■■■□□ 2.59
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.24■■■□□ 2.59
SH3BP2-220ENST00000511663 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP10AO60312 1499 aa31.22■■■□□ 2.59
SH3BP2-220ENST00000511663 AFAP1Q8N556 730 aa31.2■■■□□ 2.59
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.2■■■□□ 2.58
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.18■■■□□ 2.58
SH3BP2-220ENST00000511663 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.16■■■□□ 2.58
SH3BP2-220ENST00000511663 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
SH3BP2-220ENST00000511663 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.11■■■□□ 2.57
SH3BP2-220ENST00000511663 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.09■■■□□ 2.57
SH3BP2-220ENST00000511663 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.09■■■□□ 2.57
SH3BP2-220ENST00000511663 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.07■■■□□ 2.56
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
SH3BP2-220ENST00000511663 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.05■■■□□ 2.56
SH3BP2-220ENST00000511663 KDM5CP41229 1560 aa31.05■■■□□ 2.56
SH3BP2-220ENST00000511663 HSPA2P54652 639 aa31.03■■■□□ 2.56
SH3BP2-220ENST00000511663 PREX2Q70Z35 1606 aa31.02■■■□□ 2.56
SH3BP2-220ENST00000511663 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.01■■■□□ 2.55
SH3BP2-220ENST00000511663 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.01■■■□□ 2.55
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.98■■■□□ 2.55
SH3BP2-220ENST00000511663 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO41Q8TF61 875 aa30.96■■■□□ 2.55
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCC1P33527 1531 aa30.96■■■□□ 2.55
SH3BP2-220ENST00000511663 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
SH3BP2-220ENST00000511663 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.93■■■□□ 2.54
SH3BP2-220ENST00000511663 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.93■■■□□ 2.54
SH3BP2-220ENST00000511663 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.92■■■□□ 2.54
SH3BP2-220ENST00000511663 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.91■■■□□ 2.54
SH3BP2-220ENST00000511663 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.91■■■□□ 2.54
SH3BP2-220ENST00000511663 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
SH3BP2-220ENST00000511663 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.9■■■□□ 2.54
SH3BP2-220ENST00000511663 REREQ9P2R6 1566 aa30.9■■■□□ 2.54
SH3BP2-220ENST00000511663 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCA6Q8N139 1617 aa30.87■■■□□ 2.53
SH3BP2-220ENST00000511663 AGLP35573 1532 aa30.84■■■□□ 2.53
SH3BP2-220ENST00000511663 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.82■■■□□ 2.53
SH3BP2-220ENST00000511663 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.81■■■□□ 2.52
SH3BP2-220ENST00000511663 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.8■■■□□ 2.52
SH3BP2-220ENST00000511663 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.8■■■□□ 2.52
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.8■■■□□ 2.52
SH3BP2-220ENST00000511663 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.79■■■□□ 2.52
SH3BP2-220ENST00000511663 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.79■■■□□ 2.52
SH3BP2-220ENST00000511663 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.79■■■□□ 2.52
SH3BP2-220ENST00000511663 CEP162Q5TB80 1403 aa30.77■■■□□ 2.52
SH3BP2-220ENST00000511663 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
SH3BP2-220ENST00000511663 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.75■■■□□ 2.51
SH3BP2-220ENST00000511663 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.69■■■□□ 2.5
SH3BP2-220ENST00000511663 CERKQ8TCT0 537 aa30.69■■■□□ 2.5
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP7AQ04656 1500 aa30.68■■■□□ 2.5
SH3BP2-220ENST00000511663 C3P01024 1663 aa30.68■■■□□ 2.5
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
SH3BP2-220ENST00000511663 GGT6Q6P531 493 aa30.65■■■□□ 2.5
SH3BP2-220ENST00000511663 A2MP01023 1474 aa30.64■■■□□ 2.5
SH3BP2-220ENST00000511663 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
SH3BP2-220ENST00000511663 ZMYM3Q14202 1370 aa30.63■■■□□ 2.49
SH3BP2-220ENST00000511663 TIAM1Q13009 1591 aa30.61■■■□□ 2.49
SH3BP2-220ENST00000511663 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.59■■■□□ 2.49
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.59■■■□□ 2.49
SH3BP2-220ENST00000511663 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
SH3BP2-220ENST00000511663 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.57■■■□□ 2.48
SH3BP2-220ENST00000511663 NPATQ14207 1427 aa30.56■■■□□ 2.48
SH3BP2-220ENST00000511663 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.55■■■□□ 2.48
SH3BP2-220ENST00000511663 MBD5Q9P267 1494 aa30.54■■■□□ 2.48
SH3BP2-220ENST00000511663 MROH2AA6NES4 1674 aa30.54■■■□□ 2.48
SH3BP2-220ENST00000511663 STRCQ7RTU9 1775 aa30.53■■■□□ 2.48
SH3BP2-220ENST00000511663 NCOA2Q15596 1464 aa30.52■■■□□ 2.48
SH3BP2-220ENST00000511663 PLXNC1O60486 1568 aa30.52■■■□□ 2.48
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.51■■■□□ 2.47
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPRTO14522 1441 aa30.5■■■□□ 2.47
SH3BP2-220ENST00000511663 TSPY4P0CV99 314 aa30.48■■■□□ 2.47
SH3BP2-220ENST00000511663 TSPY10P0CW01 314 aa30.48■■■□□ 2.47
SH3BP2-220ENST00000511663 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
SH3BP2-220ENST00000511663 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
SH3BP2-220ENST00000511663 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.47■■■□□ 2.47
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.45■■■□□ 2.47
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF3BO15066 747 aa30.45■■■□□ 2.47
SH3BP2-220ENST00000511663 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.44■■■□□ 2.46
SH3BP2-220ENST00000511663 NCOA1Q15788 1441 aa30.41■■■□□ 2.46
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPRKQ15262 1439 aa30.4■■■□□ 2.46
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.38■■■□□ 2.45
SH3BP2-220ENST00000511663 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.38■■■□□ 2.45
SH3BP2-220ENST00000511663 PKD2Q13563 968 aa30.36■■■□□ 2.45
SH3BP2-220ENST00000511663 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.36■■■□□ 2.45
SH3BP2-220ENST00000511663 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.36■■■□□ 2.45
SH3BP2-220ENST00000511663 APLP2Q06481 763 aa30.35■■■□□ 2.45
SH3BP2-220ENST00000511663 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.3■■■□□ 2.44
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP3K1Q13233 1512 aa30.29■■■□□ 2.44
SH3BP2-220ENST00000511663 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms