RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.1■□□□□ 0.33
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RABGEF1-211ENST00000503687 UACAQ9BZF9 1416 aa17.09■□□□□ 0.33
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RABGEF1-211ENST00000503687 USP47Q96K76 1375 aa16.94■□□□□ 0.3
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RABGEF1-211ENST00000503687 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.87■□□□□ 0.29
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RABGEF1-211ENST00000503687 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.294e-7■■□□□ 12.5
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RABGEF1-211ENST00000503687 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
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RABGEF1-211ENST00000503687 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.8■□□□□ 0.28
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RABGEF1-211ENST00000503687 MLECQ14165 292 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 STK26Q9P289 416 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGEF11O15085 1522 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCC5O15440 1437 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
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