RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502676.1

PITX1-202, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-202ENST00000502676 PREX2Q70Z35 1606 aa36.84■■■■□ 3.49
PITX1-202ENST00000502676 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.84■■■■□ 3.49
PITX1-202ENST00000502676 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.83■■■■□ 3.49
PITX1-202ENST00000502676 RICTORQ6R327 1708 aa36.82■■■■□ 3.48
PITX1-202ENST00000502676 TIAM1Q13009 1591 aa36.79■■■■□ 3.48
PITX1-202ENST00000502676 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.79■■■■□ 3.48
PITX1-202ENST00000502676 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.78■■■■□ 3.48
PITX1-202ENST00000502676 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.77■■■■□ 3.48
PITX1-202ENST00000502676 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.76■■■■□ 3.48
PITX1-202ENST00000502676 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
PITX1-202ENST00000502676 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
PITX1-202ENST00000502676 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.71■■■■□ 3.47
PITX1-202ENST00000502676 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
PITX1-202ENST00000502676 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.68■■■■□ 3.46
PITX1-202ENST00000502676 APLP2Q06481 763 aa36.67■■■■□ 3.46
PITX1-202ENST00000502676 MAP3K1Q13233 1512 aa36.66■■■■□ 3.46
PITX1-202ENST00000502676 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.66■■■■□ 3.46
PITX1-202ENST00000502676 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.66■■■■□ 3.46
PITX1-202ENST00000502676 ABCC1P33527 1531 aa36.65■■■■□ 3.46
PITX1-202ENST00000502676 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.65■■■■□ 3.46
PITX1-202ENST00000502676 AFAP1Q8N556 730 aa36.65■■■■□ 3.46
PITX1-202ENST00000502676 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
PITX1-202ENST00000502676 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.64■■■■□ 3.46
PITX1-202ENST00000502676 NCOA2Q15596 1464 aa36.62■■■■□ 3.45
PITX1-202ENST00000502676 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.6■■■■□ 3.45
PITX1-202ENST00000502676 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.6■■■■□ 3.45
PITX1-202ENST00000502676 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.6■■■■□ 3.45
PITX1-202ENST00000502676 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.6■■■■□ 3.45
PITX1-202ENST00000502676 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
PITX1-202ENST00000502676 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
PITX1-202ENST00000502676 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.58■■■■□ 3.45
PITX1-202ENST00000502676 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.58■■■■□ 3.45
PITX1-202ENST00000502676 KDM5CP41229 1560 aa36.56■■■■□ 3.44
PITX1-202ENST00000502676 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.54■■■■□ 3.44
PITX1-202ENST00000502676 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.54■■■■□ 3.44
PITX1-202ENST00000502676 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.53■■■■□ 3.44
PITX1-202ENST00000502676 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.51■■■■□ 3.43
PITX1-202ENST00000502676 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.49■■■■□ 3.43
PITX1-202ENST00000502676 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
PITX1-202ENST00000502676 ATP10AO60312 1499 aa36.47■■■■□ 3.43
PITX1-202ENST00000502676 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.46■■■■□ 3.43
PITX1-202ENST00000502676 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.42■■■■□ 3.42
PITX1-202ENST00000502676 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
PITX1-202ENST00000502676 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.39■■■■□ 3.42
PITX1-202ENST00000502676 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.37■■■■□ 3.41
PITX1-202ENST00000502676 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.36■■■■□ 3.41
PITX1-202ENST00000502676 ABCA6Q8N139 1617 aa36.34■■■■□ 3.41
PITX1-202ENST00000502676 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.34■■■■□ 3.41
PITX1-202ENST00000502676 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.34■■■■□ 3.41
PITX1-202ENST00000502676 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.33■■■■□ 3.41
PITX1-202ENST00000502676 MBD5Q9P267 1494 aa36.32■■■■□ 3.41
PITX1-202ENST00000502676 MLECQ14165 292 aa36.32■■■■□ 3.4
PITX1-202ENST00000502676 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.32■■■■□ 3.4
PITX1-202ENST00000502676 ATP7AQ04656 1500 aa36.28■■■■□ 3.4
PITX1-202ENST00000502676 MIA2Q96PC5 1412 aa36.26■■■■□ 3.4
PITX1-202ENST00000502676 REREQ9P2R6 1566 aa36.26■■■■□ 3.39
PITX1-202ENST00000502676 MADDQ8WXG6 1647 aa36.26■■■■□ 3.39
PITX1-202ENST00000502676 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.25■■■■□ 3.39
PITX1-202ENST00000502676 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.24■■■■□ 3.39
PITX1-202ENST00000502676 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
PITX1-202ENST00000502676 PTPRMP28827 1452 aa36.2■■■■□ 3.39
PITX1-202ENST00000502676 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.17■■■■□ 3.38
PITX1-202ENST00000502676 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.16■■■■□ 3.38
PITX1-202ENST00000502676 AGLP35573 1532 aa36.16■■■■□ 3.38
PITX1-202ENST00000502676 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
PITX1-202ENST00000502676 TSPY4P0CV99 314 aa36.15■■■■□ 3.38
PITX1-202ENST00000502676 TSPY10P0CW01 314 aa36.15■■■■□ 3.38
PITX1-202ENST00000502676 A2MP01023 1474 aa36.11■■■■□ 3.37
PITX1-202ENST00000502676 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.1■■■■□ 3.37
PITX1-202ENST00000502676 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.09■■■■□ 3.37
PITX1-202ENST00000502676 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.08■■■■□ 3.37
PITX1-202ENST00000502676 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.07■■■■□ 3.36
PITX1-202ENST00000502676 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.07■■■■□ 3.36
PITX1-202ENST00000502676 PLXNC1O60486 1568 aa36.03■■■■□ 3.36
PITX1-202ENST00000502676 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
PITX1-202ENST00000502676 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
PITX1-202ENST00000502676 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
PITX1-202ENST00000502676 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
PITX1-202ENST00000502676 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.97■■■■□ 3.35
PITX1-202ENST00000502676 GGT6Q6P531 493 aa35.94■■■■□ 3.34
PITX1-202ENST00000502676 ABCC5O15440 1437 aa35.92■■■■□ 3.34
PITX1-202ENST00000502676 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
PITX1-202ENST00000502676 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
PITX1-202ENST00000502676 DAPK1P53355 1430 aa35.9■■■■□ 3.34
PITX1-202ENST00000502676 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
PITX1-202ENST00000502676 KIF3BO15066 747 aa35.88■■■■□ 3.33
PITX1-202ENST00000502676 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.88■■■■□ 3.33
PITX1-202ENST00000502676 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.87■■■■□ 3.33
PITX1-202ENST00000502676 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.86■■■■□ 3.33
PITX1-202ENST00000502676 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.82■■■■□ 3.32
PITX1-202ENST00000502676 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.8■■■■□ 3.32
PITX1-202ENST00000502676 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.78■■■■□ 3.32
PITX1-202ENST00000502676 C3P01024 1663 aa35.77■■■■□ 3.32
PITX1-202ENST00000502676 KIF15Q9NS87 1388 aa35.76■■■■□ 3.32
PITX1-202ENST00000502676 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.75■■■■□ 3.31
PITX1-202ENST00000502676 ZMYM3Q14202 1370 aa35.75■■■■□ 3.31
PITX1-202ENST00000502676 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
PITX1-202ENST00000502676 MROH2AA6NES4 1674 aa35.74■■■■□ 3.31
PITX1-202ENST00000502676 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.74■■■■□ 3.31
PITX1-202ENST00000502676 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms