RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 ABCC5O15440 1437 aa38.53■■■■□ 3.76
HOXB3-212ENST00000498678 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.53■■■■□ 3.76
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
HOXB3-212ENST00000498678 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.49■■■■□ 3.751e-8■■□□□ 11.7
HOXB3-212ENST00000498678 AKNAQ7Z591 1439 aa38.48■■■■□ 3.75
HOXB3-212ENST00000498678 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.45■■■■□ 3.75
HOXB3-212ENST00000498678 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.45■■■■□ 3.75
HOXB3-212ENST00000498678 KCNH8Q96L42 1107 aa38.44■■■■□ 3.74
HOXB3-212ENST00000498678 PREX2Q70Z35 1606 aa38.43■■■■□ 3.74
HOXB3-212ENST00000498678 ROCK1Q13464 1354 aa38.41■■■■□ 3.74
HOXB3-212ENST00000498678 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.41■■■■□ 3.74
HOXB3-212ENST00000498678 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.39■■■■□ 3.74
HOXB3-212ENST00000498678 MAPKBP1O60336 1514 aa38.33■■■■□ 3.73
HOXB3-212ENST00000498678 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.32■■■■□ 3.73
HOXB3-212ENST00000498678 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.31■■■■□ 3.72
HOXB3-212ENST00000498678 CROCC2H7BZ55 1655 aa38.3■■■■□ 3.72
HOXB3-212ENST00000498678 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa38.3■■■■□ 3.72
HOXB3-212ENST00000498678 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.28■■■■□ 3.72
HOXB3-212ENST00000498678 MBD5Q9P267 1494 aa38.25■■■■□ 3.71
HOXB3-212ENST00000498678 PLCH2O75038 1416 aa38.25■■■■□ 3.71
HOXB3-212ENST00000498678 KDM6BO15054 1643 aa38.25■■■■□ 3.71
HOXB3-212ENST00000498678 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.24■■■■□ 3.712e-6■■■■□ 24.7
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HOXB3-212ENST00000498678 ASXL2Q76L83 1435 aa38.24■■■■□ 3.71
HOXB3-212ENST00000498678 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.23■■■■□ 3.71
HOXB3-212ENST00000498678 NCOA1Q15788 1441 aa38.23■■■■□ 3.71
HOXB3-212ENST00000498678 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.23■■■■□ 3.71
HOXB3-212ENST00000498678 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.22■■■■□ 3.71
HOXB3-212ENST00000498678 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.21■■■■□ 3.71
HOXB3-212ENST00000498678 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.15■■■■□ 3.7
HOXB3-212ENST00000498678 C9orf84Q5VXU9 1444 aa38.15■■■■□ 3.7
HOXB3-212ENST00000498678 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.15■■■■□ 3.7
HOXB3-212ENST00000498678 TSPY4P0CV99 314 aa38.14■■■■□ 3.7
HOXB3-212ENST00000498678 TSPY10P0CW01 314 aa38.14■■■■□ 3.7
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.13■■■■□ 3.69
HOXB3-212ENST00000498678 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa38.13■■■■□ 3.69
HOXB3-212ENST00000498678 SYCP2Q9BX26 1530 aa38.13■■■■□ 3.69
HOXB3-212ENST00000498678 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.12■■■■□ 3.69
HOXB3-212ENST00000498678 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.12■■■■□ 3.69
HOXB3-212ENST00000498678 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.1■■■■□ 3.69
HOXB3-212ENST00000498678 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.1■■■■□ 3.69
HOXB3-212ENST00000498678 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.1■■■■□ 3.69
HOXB3-212ENST00000498678 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.1■■■■□ 3.69
HOXB3-212ENST00000498678 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.1■■■■□ 3.69
HOXB3-212ENST00000498678 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
HOXB3-212ENST00000498678 TRIM52Q96A61 297 aa38.06■■■■□ 3.68
HOXB3-212ENST00000498678 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.03■■■■□ 3.68
HOXB3-212ENST00000498678 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa38.03■■■■□ 3.68
HOXB3-212ENST00000498678 SIN3AQ96ST3 1273 aa38■■■■□ 3.67
HOXB3-212ENST00000498678 ABCC1P33527 1531 aa37.99■■■■□ 3.67
HOXB3-212ENST00000498678 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
HOXB3-212ENST00000498678 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.97■■■■□ 3.67
HOXB3-212ENST00000498678 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.96■■■■□ 3.67
HOXB3-212ENST00000498678 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.95■■■■□ 3.66
HOXB3-212ENST00000498678 KIF15Q9NS87 1388 aa37.93■■■■□ 3.66
HOXB3-212ENST00000498678 FANCAO15360 1455 aa37.92■■■■□ 3.66
HOXB3-212ENST00000498678 NEUROD1Q13562 356 aa37.91■■■■□ 3.66
HOXB3-212ENST00000498678 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.87■■■■□ 3.65
HOXB3-212ENST00000498678 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa37.83■■■■□ 3.65
HOXB3-212ENST00000498678 PLXNC1O60486 1568 aa37.81■■■■□ 3.64
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HOXB3-212ENST00000498678 CD109Q6YHK3 1445 aa37.8■■■■□ 3.64
HOXB3-212ENST00000498678 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
HOXB3-212ENST00000498678 AFAP1Q8N556 730 aa37.75■■■■□ 3.63
HOXB3-212ENST00000498678 ADGRL1O94910 1474 aa37.75■■■■□ 3.63
HOXB3-212ENST00000498678 MYT1Q01538 1121 aa37.73■■■■□ 3.63
HOXB3-212ENST00000498678 FOXD1Q16676 465 aa37.72■■■■□ 3.63
HOXB3-212ENST00000498678 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.72■■■■□ 3.63
HOXB3-212ENST00000498678 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
HOXB3-212ENST00000498678 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.7■■■■□ 3.63
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
HOXB3-212ENST00000498678 NUP155O75694 1391 aa37.68■■■■□ 3.62
HOXB3-212ENST00000498678 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.67■■■■□ 3.62
HOXB3-212ENST00000498678 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.67■■■■□ 3.62
HOXB3-212ENST00000498678 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa37.67■■■■□ 3.62
HOXB3-212ENST00000498678 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.65■■■■□ 3.62
HOXB3-212ENST00000498678 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.65■■■■□ 3.62
HOXB3-212ENST00000498678 TONSLQ96HA7 1378 aa37.64■■■■□ 3.62
HOXB3-212ENST00000498678 ERBINQ96RT1 1412 aa37.6■■■■□ 3.61
HOXB3-212ENST00000498678 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
HOXB3-212ENST00000498678 GLI2P10070 1586 aa37.59■■■■□ 3.61
HOXB3-212ENST00000498678 PKD2Q13563 968 aa37.58■■■■□ 3.61
HOXB3-212ENST00000498678 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
HOXB3-212ENST00000498678 ATP7AQ04656 1500 aa37.56■■■■□ 3.6
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HOXB3-212ENST00000498678 UNC13BO14795 1591 aa37.55■■■■□ 3.6
HOXB3-212ENST00000498678 NEO1Q92859 1461 aa37.53■■■■□ 3.6
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.53■■■■□ 3.6
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HOXB3-212ENST00000498678 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.49■■■■□ 3.59
HOXB3-212ENST00000498678 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.48■■■■□ 3.59
HOXB3-212ENST00000498678 DIP2BQ9P265 1576 aa37.47■■■■□ 3.59
HOXB3-212ENST00000498678 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.45■■■■□ 3.59
HOXB3-212ENST00000498678 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.45■■■■□ 3.59
HOXB3-212ENST00000498678 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.44■■■■□ 3.58
HOXB3-212ENST00000498678 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.43■■■■□ 3.58
HOXB3-212ENST00000498678 KDM5CP41229 1560 aa37.43■■■■□ 3.58
HOXB3-212ENST00000498678 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.42■■■■□ 3.58
HOXB3-212ENST00000498678 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.4■■■■□ 3.58
HOXB3-212ENST00000498678 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
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