RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497251.1

TRAPPC3-207, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-207ENST00000497251 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 ATP10AO60312 1499 aa27.57■■■□□ 2
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIF14Q15058 1648 aa27.57■■■□□ 2
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.55■■■□□ 2
TRAPPC3-207ENST00000497251 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.55■■■□□ 2
TRAPPC3-207ENST00000497251 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
TRAPPC3-207ENST00000497251 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.53■■■□□ 2
TRAPPC3-207ENST00000497251 FBXO41Q8TF61 875 aa27.53■■■□□ 2
TRAPPC3-207ENST00000497251 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.51■■■□□ 2
TRAPPC3-207ENST00000497251 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC3-207ENST00000497251 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC3-207ENST00000497251 MLECQ14165 292 aa27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC3-207ENST00000497251 KDM5CP41229 1560 aa27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3-207ENST00000497251 AFAP1Q8N556 730 aa27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3-207ENST00000497251 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3-207ENST00000497251 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3-207ENST00000497251 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3-207ENST00000497251 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC3-207ENST00000497251 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3-207ENST00000497251 REREQ9P2R6 1566 aa27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3-207ENST00000497251 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3-207ENST00000497251 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC3-207ENST00000497251 HSPA2P54652 639 aa27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3-207ENST00000497251 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3-207ENST00000497251 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3-207ENST00000497251 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3-207ENST00000497251 PREX2Q70Z35 1606 aa27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3-207ENST00000497251 AGLP35573 1532 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCC1P33527 1531 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3-207ENST00000497251 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3-207ENST00000497251 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3-207ENST00000497251 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3-207ENST00000497251 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3-207ENST00000497251 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3-207ENST00000497251 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3-207ENST00000497251 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3-207ENST00000497251 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3-207ENST00000497251 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3-207ENST00000497251 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3-207ENST00000497251 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3-207ENST00000497251 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCA6Q8N139 1617 aa27.2■■□□□ 1.95
TRAPPC3-207ENST00000497251 CERKQ8TCT0 537 aa27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3-207ENST00000497251 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3-207ENST00000497251 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3-207ENST00000497251 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3-207ENST00000497251 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC3-207ENST00000497251 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC3-207ENST00000497251 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3-207ENST00000497251 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3-207ENST00000497251 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3-207ENST00000497251 NPATQ14207 1427 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3-207ENST00000497251 C3P01024 1663 aa27.07■■□□□ 1.92
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TRAPPC3-207ENST00000497251 ATP7AQ04656 1500 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZMYM3Q14202 1370 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3-207ENST00000497251 STRCQ7RTU9 1775 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3-207ENST00000497251 MROH2AA6NES4 1674 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC3-207ENST00000497251 A2MP01023 1474 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC3-207ENST00000497251 CEP162Q5TB80 1403 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3-207ENST00000497251 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3-207ENST00000497251 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3-207ENST00000497251 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3-207ENST00000497251 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3-207ENST00000497251 PLXNC1O60486 1568 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3-207ENST00000497251 NCOA1Q15788 1441 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3-207ENST00000497251 MBD5Q9P267 1494 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3-207ENST00000497251 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC3-207ENST00000497251 TIAM1Q13009 1591 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC3-207ENST00000497251 GGT6Q6P531 493 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3-207ENST00000497251 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
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TRAPPC3-207ENST00000497251 PKD2Q13563 968 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3-207ENST00000497251 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3-207ENST00000497251 PTPRKQ15262 1439 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3-207ENST00000497251 PLA2R1Q13018 1463 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3-207ENST00000497251 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.83■■□□□ 1.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 NCOA2Q15596 1464 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 TSPY4P0CV99 314 aa26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 TSPY10P0CW01 314 aa26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIF3BO15066 747 aa26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.72■■□□□ 1.87
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