RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496553.5

NDUFS2-215, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S2, human

TSL 2

Gene NDUFS2, Length 888 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFS2-215	ENST00000496553	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		34.25	■■■■□ 3.07
NDUFS2-215	ENST00000496553	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		34.24	■■■■□ 3.07
NDUFS2-215	ENST00000496553	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		34.24	■■■■□ 3.07
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		34.24	■■■■□ 3.07
NDUFS2-215	ENST00000496553	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		34.21	■■■■□ 3.07
NDUFS2-215	ENST00000496553	PTPRM	P28827	1452 aa		34.2	■■■■□ 3.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		34.19	■■■■□ 3.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		34.16	■■■■□ 3.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	MADD	Q8WXG6	1647 aa		34.15	■■■■□ 3.06
NDUFS2-215	ENST00000496553	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		34.13	■■■■□ 3.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		34.09	■■■■□ 3.05
NDUFS2-215	ENST00000496553	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	34.06	■■■■□ 3.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	PREX2	Q70Z35	1606 aa		34.04	■■■■□ 3.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		34.04	■■■■□ 3.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	ATP10A	O60312	1499 aa		34.02	■■■■□ 3.04
NDUFS2-215	ENST00000496553	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		34.01	■■■■□ 3.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		34.01	■■■■□ 3.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	KDM5C	P41229	1560 aa		33.98	■■■■□ 3.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.97	■■■■□ 3.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	MLEC	Q14165	292 aa		33.97	■■■■□ 3.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.96	■■■■□ 3.03
NDUFS2-215	ENST00000496553	ABCC1	P33527	1531 aa		33.93	■■■■□ 3.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.93	■■■■□ 3.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.92	■■■■□ 3.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.89	■■■■□ 3.02
NDUFS2-215	ENST00000496553	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.88	■■■■□ 3.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.87	■■■■□ 3.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.85	■■■■□ 3.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.85	■■■■□ 3.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.84	■■■■□ 3.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.83	■■■■□ 3.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.83	■■■■□ 3.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.83	■■■■□ 3.01
NDUFS2-215	ENST00000496553	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.82	■■■■□ 3
NDUFS2-215	ENST00000496553	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.81	■■■■□ 3
NDUFS2-215	ENST00000496553	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.79	■■■■□ 3
NDUFS2-215	ENST00000496553	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.79	■■■■□ 3
NDUFS2-215	ENST00000496553	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.79	■■■■□ 3
NDUFS2-215	ENST00000496553	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.76	■■■□□ 2.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.76	■■■□□ 2.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.74	■■■□□ 2.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.73	■■■□□ 2.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.73	■■■□□ 2.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.7	■■■□□ 2.99
NDUFS2-215	ENST00000496553	AGL	P35573	1532 aa		33.69	■■■□□ 2.98
NDUFS2-215	ENST00000496553	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
NDUFS2-215	ENST00000496553	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.68	■■■□□ 2.98
NDUFS2-215	ENST00000496553	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
NDUFS2-215	ENST00000496553	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.65	■■■□□ 2.98
NDUFS2-215	ENST00000496553	HSPA2	P54652	639 aa		33.63	■■■□□ 2.97
NDUFS2-215	ENST00000496553	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.62	■■■□□ 2.97
NDUFS2-215	ENST00000496553	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.6	■■■□□ 2.97
NDUFS2-215	ENST00000496553	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
NDUFS2-215	ENST00000496553	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.59	■■■□□ 2.97
NDUFS2-215	ENST00000496553	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.54	■■■□□ 2.96
NDUFS2-215	ENST00000496553	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
NDUFS2-215	ENST00000496553	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
NDUFS2-215	ENST00000496553	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.52	■■■□□ 2.96
NDUFS2-215	ENST00000496553	C3	P01024	1663 aa		33.51	■■■□□ 2.95
NDUFS2-215	ENST00000496553	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.49	■■■□□ 2.95
NDUFS2-215	ENST00000496553	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.48	■■■□□ 2.95
NDUFS2-215	ENST00000496553	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
NDUFS2-215	ENST00000496553	A2M	P01023	1474 aa		33.47	■■■□□ 2.95
NDUFS2-215	ENST00000496553	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.47	■■■□□ 2.95
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
NDUFS2-215	ENST00000496553	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.44	■■■□□ 2.94
NDUFS2-215	ENST00000496553	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.43	■■■□□ 2.94
NDUFS2-215	ENST00000496553	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.43	■■■□□ 2.94
NDUFS2-215	ENST00000496553	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.42	■■■□□ 2.94
NDUFS2-215	ENST00000496553	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.42	■■■□□ 2.94
NDUFS2-215	ENST00000496553	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.38	■■■□□ 2.93
NDUFS2-215	ENST00000496553	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.37	■■■□□ 2.93
NDUFS2-215	ENST00000496553	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.36	■■■□□ 2.93
NDUFS2-215	ENST00000496553	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.36	■■■□□ 2.93
NDUFS2-215	ENST00000496553	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.36	■■■□□ 2.93
NDUFS2-215	ENST00000496553	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.35	■■■□□ 2.93
NDUFS2-215	ENST00000496553	GGT6	Q6P531	493 aa		33.33	■■■□□ 2.93
NDUFS2-215	ENST00000496553	NPAT	Q14207	1427 aa		33.32	■■■□□ 2.92
NDUFS2-215	ENST00000496553	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.32	■■■□□ 2.92
NDUFS2-215	ENST00000496553	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.3	■■■□□ 2.92
NDUFS2-215	ENST00000496553	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.3	■■■□□ 2.92
NDUFS2-215	ENST00000496553	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.92
NDUFS2-215	ENST00000496553	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.25	■■■□□ 2.91
NDUFS2-215	ENST00000496553	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.25	■■■□□ 2.91
NDUFS2-215	ENST00000496553	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.24	■■■□□ 2.91
NDUFS2-215	ENST00000496553	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.24	■■■□□ 2.91
NDUFS2-215	ENST00000496553	APLP2	Q06481	763 aa		33.21	■■■□□ 2.91
NDUFS2-215	ENST00000496553	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.19	■■■□□ 2.9
NDUFS2-215	ENST00000496553	KIF3B	O15066	747 aa		33.16	■■■□□ 2.9
NDUFS2-215	ENST00000496553	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
NDUFS2-215	ENST00000496553	PTPRT	O14522	1441 aa		33.16	■■■□□ 2.9
NDUFS2-215	ENST00000496553	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.14	■■■□□ 2.9
NDUFS2-215	ENST00000496553	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.14	■■■□□ 2.9
NDUFS2-215	ENST00000496553	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.14	■■■□□ 2.9
NDUFS2-215	ENST00000496553	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.13	■■■□□ 2.89
NDUFS2-215	ENST00000496553	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.13	■■■□□ 2.89
NDUFS2-215	ENST00000496553	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.12	■■■□□ 2.89
NDUFS2-215	ENST00000496553	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.11	■■■□□ 2.89

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