RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496124.1

PRDM15-216, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM15, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-216ENST00000496124 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PRDM15-216ENST00000496124 MAP3K1Q13233 1512 aa22.74■■□□□ 1.23
PRDM15-216ENST00000496124 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.74■■□□□ 1.23
PRDM15-216ENST00000496124 ADGRL1O94910 1474 aa22.73■■□□□ 1.23
PRDM15-216ENST00000496124 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.72■■□□□ 1.23
PRDM15-216ENST00000496124 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PRDM15-216ENST00000496124 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PRDM15-216ENST00000496124 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.71■■□□□ 1.23
PRDM15-216ENST00000496124 RAPGEF3O95398 923 aa22.71■■□□□ 1.23
PRDM15-216ENST00000496124 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.69■■□□□ 1.22
PRDM15-216ENST00000496124 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PRDM15-216ENST00000496124 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.67■■□□□ 1.22
PRDM15-216ENST00000496124 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PRDM15-216ENST00000496124 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.66■■□□□ 1.22
PRDM15-216ENST00000496124 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.65■■□□□ 1.22
PRDM15-216ENST00000496124 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.65■■□□□ 1.22
PRDM15-216ENST00000496124 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.63■■□□□ 1.21
PRDM15-216ENST00000496124 ABCC1P33527 1531 aa22.62■■□□□ 1.21
PRDM15-216ENST00000496124 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.62■■□□□ 1.21
PRDM15-216ENST00000496124 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.62■■□□□ 1.21
PRDM15-216ENST00000496124 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PRDM15-216ENST00000496124 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.59■■□□□ 1.21
PRDM15-216ENST00000496124 RICTORQ6R327 1708 aa22.59■■□□□ 1.21
PRDM15-216ENST00000496124 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.58■■□□□ 1.21
PRDM15-216ENST00000496124 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.57■■□□□ 1.2
PRDM15-216ENST00000496124 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.57■■□□□ 1.2
PRDM15-216ENST00000496124 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.56■■□□□ 1.2
PRDM15-216ENST00000496124 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
PRDM15-216ENST00000496124 AFAP1Q8N556 730 aa22.55■■□□□ 1.2
PRDM15-216ENST00000496124 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.53■■□□□ 1.2
PRDM15-216ENST00000496124 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.51■■□□□ 1.19
PRDM15-216ENST00000496124 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.51■■□□□ 1.19
PRDM15-216ENST00000496124 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM15-216ENST00000496124 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM15-216ENST00000496124 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM15-216ENST00000496124 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM15-216ENST00000496124 KDM5CP41229 1560 aa22.46■■□□□ 1.19
PRDM15-216ENST00000496124 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.46■■□□□ 1.19
PRDM15-216ENST00000496124 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.45■■□□□ 1.18
PRDM15-216ENST00000496124 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.45■■□□□ 1.18
PRDM15-216ENST00000496124 MIA2Q96PC5 1412 aa22.44■■□□□ 1.18
PRDM15-216ENST00000496124 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.42■■□□□ 1.18
PRDM15-216ENST00000496124 MBD5Q9P267 1494 aa22.42■■□□□ 1.18
PRDM15-216ENST00000496124 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PRDM15-216ENST00000496124 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PRDM15-216ENST00000496124 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PRDM15-216ENST00000496124 ABCA6Q8N139 1617 aa22.4■■□□□ 1.18
PRDM15-216ENST00000496124 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.39■■□□□ 1.17
PRDM15-216ENST00000496124 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.38■■□□□ 1.17
PRDM15-216ENST00000496124 ATP7AQ04656 1500 aa22.38■■□□□ 1.17
PRDM15-216ENST00000496124 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.37■■□□□ 1.17
PRDM15-216ENST00000496124 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PRDM15-216ENST00000496124 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.36■■□□□ 1.17
PRDM15-216ENST00000496124 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.35■■□□□ 1.17
PRDM15-216ENST00000496124 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PRDM15-216ENST00000496124 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM15-216ENST00000496124 MLECQ14165 292 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM15-216ENST00000496124 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM15-216ENST00000496124 ATP10AO60312 1499 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM15-216ENST00000496124 DAPK1P53355 1430 aa22.3■■□□□ 1.16
PRDM15-216ENST00000496124 TSPY4P0CV99 314 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM15-216ENST00000496124 TSPY10P0CW01 314 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM15-216ENST00000496124 ITGAEP38570 1179 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM15-216ENST00000496124 ABCC5O15440 1437 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM15-216ENST00000496124 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.28■■□□□ 1.16
PRDM15-216ENST00000496124 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PRDM15-216ENST00000496124 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM15-216ENST00000496124 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM15-216ENST00000496124 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM15-216ENST00000496124 A2MP01023 1474 aa22.24■■□□□ 1.15
PRDM15-216ENST00000496124 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.23■■□□□ 1.15
PRDM15-216ENST00000496124 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.23■■□□□ 1.15
PRDM15-216ENST00000496124 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.22■■□□□ 1.15
PRDM15-216ENST00000496124 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.22■■□□□ 1.15
PRDM15-216ENST00000496124 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.21■■□□□ 1.15
PRDM15-216ENST00000496124 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.21■■□□□ 1.15
PRDM15-216ENST00000496124 REREQ9P2R6 1566 aa22.2■■□□□ 1.14
PRDM15-216ENST00000496124 MADDQ8WXG6 1647 aa22.2■■□□□ 1.14
PRDM15-216ENST00000496124 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.19■■□□□ 1.14
PRDM15-216ENST00000496124 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PRDM15-216ENST00000496124 PLXNC1O60486 1568 aa22.18■■□□□ 1.14
PRDM15-216ENST00000496124 KIF15Q9NS87 1388 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM15-216ENST00000496124 PTPRKQ15262 1439 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM15-216ENST00000496124 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PRDM15-216ENST00000496124 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM15-216ENST00000496124 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PRDM15-216ENST00000496124 AGLP35573 1532 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM15-216ENST00000496124 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PRDM15-216ENST00000496124 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM15-216ENST00000496124 GGT6Q6P531 493 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM15-216ENST00000496124 KIF3BO15066 747 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM15-216ENST00000496124 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM15-216ENST00000496124 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM15-216ENST00000496124 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PRDM15-216ENST00000496124 ADGRL2O95490 1459 aa22.08■■□□□ 1.12
PRDM15-216ENST00000496124 NCOA1Q15788 1441 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM15-216ENST00000496124 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
PRDM15-216ENST00000496124 PTPRMP28827 1452 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM15-216ENST00000496124 ERBINQ96RT1 1412 aa22.03■■□□□ 1.12
PRDM15-216ENST00000496124 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
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