RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495518.1

SLC22A18-211, Transcript of solute carrier family 22 member 18, humanhuman

TSL 2

Gene SLC22A18, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A18-211ENST00000495518 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.55■■□□□ 1.68
SLC22A18-211ENST00000495518 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.54■■□□□ 1.68
SLC22A18-211ENST00000495518 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.54■■□□□ 1.68
SLC22A18-211ENST00000495518 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.54■■□□□ 1.68
SLC22A18-211ENST00000495518 RICTORQ6R327 1708 aa25.54■■□□□ 1.68
SLC22A18-211ENST00000495518 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.54■■□□□ 1.68
SLC22A18-211ENST00000495518 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SLC22A18-211ENST00000495518 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SLC22A18-211ENST00000495518 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.53■■□□□ 1.68
SLC22A18-211ENST00000495518 AFAP1Q8N556 730 aa25.52■■□□□ 1.68
SLC22A18-211ENST00000495518 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.49■■□□□ 1.67
SLC22A18-211ENST00000495518 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.49■■□□□ 1.67
SLC22A18-211ENST00000495518 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.48■■□□□ 1.67
SLC22A18-211ENST00000495518 PREX2Q70Z35 1606 aa25.48■■□□□ 1.67
SLC22A18-211ENST00000495518 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SLC22A18-211ENST00000495518 APLP2Q06481 763 aa25.47■■□□□ 1.67
SLC22A18-211ENST00000495518 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.46■■□□□ 1.67
SLC22A18-211ENST00000495518 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.44■■□□□ 1.66
SLC22A18-211ENST00000495518 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC22A18-211ENST00000495518 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC22A18-211ENST00000495518 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC22A18-211ENST00000495518 ATP10AO60312 1499 aa25.41■■□□□ 1.66
SLC22A18-211ENST00000495518 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
SLC22A18-211ENST00000495518 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.4■■□□□ 1.66
SLC22A18-211ENST00000495518 TIAM1Q13009 1591 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC22A18-211ENST00000495518 ABCC1P33527 1531 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC22A18-211ENST00000495518 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC22A18-211ENST00000495518 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC22A18-211ENST00000495518 MAP3K1Q13233 1512 aa25.36■■□□□ 1.65
SLC22A18-211ENST00000495518 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.35■■□□□ 1.65
SLC22A18-211ENST00000495518 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.35■■□□□ 1.65
SLC22A18-211ENST00000495518 KDM5CP41229 1560 aa25.35■■□□□ 1.65
SLC22A18-211ENST00000495518 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SLC22A18-211ENST00000495518 MLECQ14165 292 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC22A18-211ENST00000495518 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC22A18-211ENST00000495518 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC22A18-211ENST00000495518 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SLC22A18-211ENST00000495518 NCOA2Q15596 1464 aa25.32■■□□□ 1.64
SLC22A18-211ENST00000495518 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SLC22A18-211ENST00000495518 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC22A18-211ENST00000495518 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SLC22A18-211ENST00000495518 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC22A18-211ENST00000495518 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC22A18-211ENST00000495518 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC22A18-211ENST00000495518 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC22A18-211ENST00000495518 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC22A18-211ENST00000495518 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.27■■□□□ 1.64
SLC22A18-211ENST00000495518 PTPRMP28827 1452 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC22A18-211ENST00000495518 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SLC22A18-211ENST00000495518 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.2■■□□□ 1.62
SLC22A18-211ENST00000495518 TSPY4P0CV99 314 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC22A18-211ENST00000495518 TSPY10P0CW01 314 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC22A18-211ENST00000495518 MADDQ8WXG6 1647 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC22A18-211ENST00000495518 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC22A18-211ENST00000495518 REREQ9P2R6 1566 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC22A18-211ENST00000495518 MBD5Q9P267 1494 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC22A18-211ENST00000495518 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.16■■□□□ 1.62
SLC22A18-211ENST00000495518 ABCA6Q8N139 1617 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC22A18-211ENST00000495518 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.14■■□□□ 1.62
SLC22A18-211ENST00000495518 AGLP35573 1532 aa25.14■■□□□ 1.62
SLC22A18-211ENST00000495518 ATP7AQ04656 1500 aa25.14■■□□□ 1.62
SLC22A18-211ENST00000495518 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.14■■□□□ 1.61
SLC22A18-211ENST00000495518 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.14■■□□□ 1.61
SLC22A18-211ENST00000495518 MIA2Q96PC5 1412 aa25.13■■□□□ 1.61
SLC22A18-211ENST00000495518 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC22A18-211ENST00000495518 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SLC22A18-211ENST00000495518 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC22A18-211ENST00000495518 A2MP01023 1474 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC22A18-211ENST00000495518 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC22A18-211ENST00000495518 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SLC22A18-211ENST00000495518 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC22A18-211ENST00000495518 GGT6Q6P531 493 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC22A18-211ENST00000495518 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SLC22A18-211ENST00000495518 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC22A18-211ENST00000495518 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SLC22A18-211ENST00000495518 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC22A18-211ENST00000495518 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC22A18-211ENST00000495518 KIF3BO15066 747 aa24.98■■□□□ 1.59
SLC22A18-211ENST00000495518 PLXNC1O60486 1568 aa24.95■■□□□ 1.58
SLC22A18-211ENST00000495518 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.95■■□□□ 1.58
SLC22A18-211ENST00000495518 ZMYM3Q14202 1370 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC22A18-211ENST00000495518 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SLC22A18-211ENST00000495518 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC22A18-211ENST00000495518 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC22A18-211ENST00000495518 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SLC22A18-211ENST00000495518 HSPA2P54652 639 aa24.88■■□□□ 1.57
SLC22A18-211ENST00000495518 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.88■■□□□ 1.57
SLC22A18-211ENST00000495518 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.87■■□□□ 1.57
SLC22A18-211ENST00000495518 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SLC22A18-211ENST00000495518 ABCC5O15440 1437 aa24.86■■□□□ 1.57
SLC22A18-211ENST00000495518 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.85■■□□□ 1.57
SLC22A18-211ENST00000495518 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.85■■□□□ 1.57
SLC22A18-211ENST00000495518 C3P01024 1663 aa24.84■■□□□ 1.57
SLC22A18-211ENST00000495518 DAPK1P53355 1430 aa24.82■■□□□ 1.56
SLC22A18-211ENST00000495518 NPATQ14207 1427 aa24.82■■□□□ 1.56
SLC22A18-211ENST00000495518 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.82■■□□□ 1.56
SLC22A18-211ENST00000495518 MROH2AA6NES4 1674 aa24.81■■□□□ 1.56
SLC22A18-211ENST00000495518 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.81■■□□□ 1.56
SLC22A18-211ENST00000495518 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.8■■□□□ 1.56
SLC22A18-211ENST00000495518 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms