RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489850.5

NOM1-208, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, human

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOM1-208	ENST00000489850	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.27	■■■□□ 2.76
NOM1-208	ENST00000489850	APLP2	Q06481	763 aa		32.27	■■■□□ 2.76
NOM1-208	ENST00000489850	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.26	■■■□□ 2.75
NOM1-208	ENST00000489850	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.26	■■■□□ 2.75
NOM1-208	ENST00000489850	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.25	■■■□□ 2.75
NOM1-208	ENST00000489850	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.24	■■■□□ 2.75
NOM1-208	ENST00000489850	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
NOM1-208	ENST00000489850	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.24	■■■□□ 2.75
NOM1-208	ENST00000489850	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
NOM1-208	ENST00000489850	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.21	■■■□□ 2.75
NOM1-208	ENST00000489850	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.2	■■■□□ 2.74
NOM1-208	ENST00000489850	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.19	■■■□□ 2.74
NOM1-208	ENST00000489850	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.17	■■■□□ 2.74
NOM1-208	ENST00000489850	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
NOM1-208	ENST00000489850	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.15	■■■□□ 2.74
NOM1-208	ENST00000489850	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.15	■■■□□ 2.74
NOM1-208	ENST00000489850	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.14	■■■□□ 2.74
NOM1-208	ENST00000489850	ABCC1	P33527	1531 aa		32.12	■■■□□ 2.73
NOM1-208	ENST00000489850	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.12	■■■□□ 2.73
NOM1-208	ENST00000489850	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
NOM1-208	ENST00000489850	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.1	■■■□□ 2.73
NOM1-208	ENST00000489850	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
NOM1-208	ENST00000489850	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.07	■■■□□ 2.72
NOM1-208	ENST00000489850	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.06	■■■□□ 2.72
NOM1-208	ENST00000489850	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.05	■■■□□ 2.72
NOM1-208	ENST00000489850	KDM5C	P41229	1560 aa		32.03	■■■□□ 2.72
NOM1-208	ENST00000489850	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.03	■■■□□ 2.72
NOM1-208	ENST00000489850	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.02	■■■□□ 2.72
NOM1-208	ENST00000489850	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.02	■■■□□ 2.72
NOM1-208	ENST00000489850	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32	■■■□□ 2.71
NOM1-208	ENST00000489850	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.99	■■■□□ 2.71
NOM1-208	ENST00000489850	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		31.95	■■■□□ 2.71
NOM1-208	ENST00000489850	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31.95	■■■□□ 2.71
NOM1-208	ENST00000489850	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.95	■■■□□ 2.7
NOM1-208	ENST00000489850	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.94	■■■□□ 2.7
NOM1-208	ENST00000489850	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		31.93	■■■□□ 2.7
NOM1-208	ENST00000489850	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.93	■■■□□ 2.7
NOM1-208	ENST00000489850	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
NOM1-208	ENST00000489850	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.92	■■■□□ 2.7
NOM1-208	ENST00000489850	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		31.9	■■■□□ 2.7
NOM1-208	ENST00000489850	ATP10A	O60312	1499 aa		31.9	■■■□□ 2.7
NOM1-208	ENST00000489850	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.9	■■■□□ 2.7
NOM1-208	ENST00000489850	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
NOM1-208	ENST00000489850	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.87	■■■□□ 2.69
NOM1-208	ENST00000489850	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.87	■■■□□ 2.69
NOM1-208	ENST00000489850	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
NOM1-208	ENST00000489850	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.87	■■■□□ 2.69
NOM1-208	ENST00000489850	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
NOM1-208	ENST00000489850	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.81	■■■□□ 2.68
NOM1-208	ENST00000489850	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.8	■■■□□ 2.68
NOM1-208	ENST00000489850	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.79	■■■□□ 2.68
NOM1-208	ENST00000489850	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.78	■■■□□ 2.68
NOM1-208	ENST00000489850	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.78	■■■□□ 2.68
NOM1-208	ENST00000489850	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.78	■■■□□ 2.68
NOM1-208	ENST00000489850	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.78	■■■□□ 2.68
NOM1-208	ENST00000489850	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
NOM1-208	ENST00000489850	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.75	■■■□□ 2.67
NOM1-208	ENST00000489850	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		31.75	■■■□□ 2.67
NOM1-208	ENST00000489850	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.74	■■■□□ 2.67
NOM1-208	ENST00000489850	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.71	■■■□□ 2.67
NOM1-208	ENST00000489850	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.71	■■■□□ 2.67
NOM1-208	ENST00000489850	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		31.71	■■■□□ 2.67
NOM1-208	ENST00000489850	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.7	■■■□□ 2.66
NOM1-208	ENST00000489850	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.69	■■■□□ 2.66
NOM1-208	ENST00000489850	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
NOM1-208	ENST00000489850	AGL	P35573	1532 aa		31.67	■■■□□ 2.66
NOM1-208	ENST00000489850	A2M	P01023	1474 aa		31.63	■■■□□ 2.65
NOM1-208	ENST00000489850	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.62	■■■□□ 2.65
NOM1-208	ENST00000489850	MLEC	Q14165	292 aa		31.6	■■■□□ 2.65
NOM1-208	ENST00000489850	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.6	■■■□□ 2.65
NOM1-208	ENST00000489850	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		31.6	■■■□□ 2.65
NOM1-208	ENST00000489850	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.59	■■■□□ 2.65
NOM1-208	ENST00000489850	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		31.57	■■■□□ 2.64
NOM1-208	ENST00000489850	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
NOM1-208	ENST00000489850	PTPRM	P28827	1452 aa		31.54	■■■□□ 2.64
NOM1-208	ENST00000489850	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
NOM1-208	ENST00000489850	ABCC5	O15440	1437 aa		31.54	■■■□□ 2.64
NOM1-208	ENST00000489850	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
NOM1-208	ENST00000489850	DAPK1	P53355	1430 aa		31.53	■■■□□ 2.64
NOM1-208	ENST00000489850	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
NOM1-208	ENST00000489850	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		31.51	■■■□□ 2.63
NOM1-208	ENST00000489850	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.51	■■■□□ 2.63
NOM1-208	ENST00000489850	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
NOM1-208	ENST00000489850	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
NOM1-208	ENST00000489850	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.43	■■■□□ 2.62
NOM1-208	ENST00000489850	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.43	■■■□□ 2.62
NOM1-208	ENST00000489850	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	31.42	■■■□□ 2.62
NOM1-208	ENST00000489850	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		31.4	■■■□□ 2.62
NOM1-208	ENST00000489850	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		31.39	■■■□□ 2.62
NOM1-208	ENST00000489850	KIF15	Q9NS87	1388 aa		31.39	■■■□□ 2.62
NOM1-208	ENST00000489850	KIF3B	O15066	747 aa		31.38	■■■□□ 2.61
NOM1-208	ENST00000489850	GGT6	Q6P531	493 aa		31.38	■■■□□ 2.61
NOM1-208	ENST00000489850	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	31.34	■■■□□ 2.61
NOM1-208	ENST00000489850	ADGRL2	O95490	1459 aa		31.33	■■■□□ 2.61
NOM1-208	ENST00000489850	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
NOM1-208	ENST00000489850	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		31.33	■■■□□ 2.61
NOM1-208	ENST00000489850	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		31.33	■■■□□ 2.61
NOM1-208	ENST00000489850	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.32	■■■□□ 2.61
NOM1-208	ENST00000489850	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		31.32	■■■□□ 2.61
NOM1-208	ENST00000489850	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.32	■■■□□ 2.6

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