RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.16■□□□□ 0.5
NISCH-211ENST00000488243 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.15■□□□□ 0.5
NISCH-211ENST00000488243 HSPA2P54652 639 aa18.15■□□□□ 0.5
NISCH-211ENST00000488243 CERKQ8TCT0 537 aa18.15■□□□□ 0.5
NISCH-211ENST00000488243 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
NISCH-211ENST00000488243 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.14■□□□□ 0.49
NISCH-211ENST00000488243 ILDR2Q71H61 639 aa18.13■□□□□ 0.49
NISCH-211ENST00000488243 SOCS7O14512 581 aa18.12■□□□□ 0.49
NISCH-211ENST00000488243 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
NISCH-211ENST00000488243 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-211ENST00000488243 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-211ENST00000488243 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NISCH-211ENST00000488243 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
NISCH-211ENST00000488243 RICTORQ6R327 1708 aa18.06■□□□□ 0.48
NISCH-211ENST00000488243 AKNAQ7Z591 1439 aa18.06■□□□□ 0.48
NISCH-211ENST00000488243 KIF14Q15058 1648 aa18.05■□□□□ 0.48
NISCH-211ENST00000488243 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
NISCH-211ENST00000488243 FANCAO15360 1455 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-211ENST00000488243 MLECQ14165 292 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-211ENST00000488243 NCOA2Q15596 1464 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-211ENST00000488243 CFAP74Q9C0B2 1584 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-211ENST00000488243 POGZQ7Z3K3 1410 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-211ENST00000488243 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
NISCH-211ENST00000488243 YEATS2Q9ULM3 1422 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-211ENST00000488243 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-211ENST00000488243 TTC37Q6PGP7 1564 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-211ENST00000488243 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa17.99■□□□□ 0.47
NISCH-211ENST00000488243 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-211ENST00000488243 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-211ENST00000488243 MIA2Q96PC5 1412 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-211ENST00000488243 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-211ENST00000488243 MYOM3Q5VTT5 1437 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-211ENST00000488243 PLCH2O75038 1416 aa17.92■□□□□ 0.46
NISCH-211ENST00000488243 SCAPERQ9BY12 1400 aa17.92■□□□□ 0.46
NISCH-211ENST00000488243 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
NISCH-211ENST00000488243 MAGI2Q86UL8 1455 aa17.92■□□□□ 0.46
NISCH-211ENST00000488243 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17.92■□□□□ 0.46
NISCH-211ENST00000488243 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
NISCH-211ENST00000488243 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa17.9■□□□□ 0.46
NISCH-211ENST00000488243 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP17.89■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 MYO5CQ9NQX4 1742 aa17.88■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 FGD6Q6ZV73 1430 aa17.88■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 PREX2Q70Z35 1606 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 PREX1Q8TCU6 1659 aa17.87■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 ATP10AO60312 1499 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 STRCQ7RTU9 1775 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.84■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.83■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
NISCH-211ENST00000488243 MYT1LQ9UL68 1186 aa17.82■□□□□ 0.44
NISCH-211ENST00000488243 RSPH4AQ5TD94 716 aa17.81■□□□□ 0.44
NISCH-211ENST00000488243 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa17.81■□□□□ 0.44
NISCH-211ENST00000488243 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.81■□□□□ 0.44
NISCH-211ENST00000488243 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
NISCH-211ENST00000488243 PTPN23Q9H3S7 1636 aa17.8■□□□□ 0.44
NISCH-211ENST00000488243 AFAP1Q8N556 730 aa17.78■□□□□ 0.44
NISCH-211ENST00000488243 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
NISCH-211ENST00000488243 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa17.77■□□□□ 0.44
NISCH-211ENST00000488243 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.77■□□□□ 0.44
NISCH-211ENST00000488243 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-211ENST00000488243 PTPRTO14522 1441 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-211ENST00000488243 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
NISCH-211ENST00000488243 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
NISCH-211ENST00000488243 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-211ENST00000488243 KDM5CP41229 1560 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-211ENST00000488243 ABCC1P33527 1531 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-211ENST00000488243 ARHGEF5Q12774 1597 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-211ENST00000488243 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-211ENST00000488243 LTBP4Q8N2S1 1624 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-211ENST00000488243 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 MBD5Q9P267 1494 aa17.7■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 ABCA6Q8N139 1617 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 C3P01024 1663 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 IQSEC2Q5JU85 1478 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.68■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 TSPY4P0CV99 314 aa17.67■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 TSPY10P0CW01 314 aa17.67■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 SHANK2Q9UPX8 1470 aa17.67■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.67■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 DAPK1P53355 1430 aa17.66■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.66■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 REREQ9P2R6 1566 aa17.66■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 ABCC5O15440 1437 aa17.65■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.64■□□□□ 0.42
NISCH-211ENST00000488243 MLH3Q9UHC1 1453 aa17.64■□□□□ 0.41
NISCH-211ENST00000488243 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.64■□□□□ 0.41
NISCH-211ENST00000488243 MAST1Q9Y2H9 1570 aa17.62■□□□□ 0.41
NISCH-211ENST00000488243 ROCK1Q13464 1354 aa17.62■□□□□ 0.41
NISCH-211ENST00000488243 NCOA1Q15788 1441 aa17.61■□□□□ 0.41
NISCH-211ENST00000488243 AGLP35573 1532 aa17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms