RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488196.5

STRADB-209, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-209ENST00000488196 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.19■■■■□ 3.54
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STRADB-209ENST00000488196 PREX2Q70Z35 1606 aa37.14■■■■□ 3.54
STRADB-209ENST00000488196 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.13■■■■□ 3.54
STRADB-209ENST00000488196 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.1■■■■□ 3.53
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STRADB-209ENST00000488196 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.83■■■■□ 3.49
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STRADB-209ENST00000488196 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.8■■■■□ 3.48
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STRADB-209ENST00000488196 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
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STRADB-209ENST00000488196 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.76■■■■□ 3.48
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STRADB-209ENST00000488196 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.74■■■■□ 3.47
STRADB-209ENST00000488196 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.72■■■■□ 3.47
STRADB-209ENST00000488196 ABCA6Q8N139 1617 aa36.7■■■■□ 3.47
STRADB-209ENST00000488196 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.7■■■■□ 3.47
STRADB-209ENST00000488196 MLECQ14165 292 aa36.69■■■■□ 3.46
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STRADB-209ENST00000488196 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
STRADB-209ENST00000488196 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.53■■■■□ 3.44
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STRADB-209ENST00000488196 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.44■■■■□ 3.42
STRADB-209ENST00000488196 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.42■■■■□ 3.42
STRADB-209ENST00000488196 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.42■■■■□ 3.42
STRADB-209ENST00000488196 A2MP01023 1474 aa36.41■■■■□ 3.42
STRADB-209ENST00000488196 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.37■■■■□ 3.41
STRADB-209ENST00000488196 PLXNC1O60486 1568 aa36.36■■■■□ 3.41
STRADB-209ENST00000488196 TSPY4P0CV99 314 aa36.34■■■■□ 3.41
STRADB-209ENST00000488196 TSPY10P0CW01 314 aa36.34■■■■□ 3.41
STRADB-209ENST00000488196 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.32■■■■□ 3.4
STRADB-209ENST00000488196 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
STRADB-209ENST00000488196 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.3■■■■□ 3.4
STRADB-209ENST00000488196 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
STRADB-209ENST00000488196 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
STRADB-209ENST00000488196 GGT6Q6P531 493 aa36.23■■■■□ 3.39
STRADB-209ENST00000488196 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.22■■■■□ 3.39
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STRADB-209ENST00000488196 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
STRADB-209ENST00000488196 ABCC5O15440 1437 aa36.18■■■■□ 3.38
STRADB-209ENST00000488196 C3P01024 1663 aa36.17■■■■□ 3.38
STRADB-209ENST00000488196 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.17■■■■□ 3.38
STRADB-209ENST00000488196 KIF3BO15066 747 aa36.16■■■■□ 3.38
STRADB-209ENST00000488196 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.16■■■■□ 3.38
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STRADB-209ENST00000488196 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.13■■■■□ 3.37
STRADB-209ENST00000488196 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
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STRADB-209ENST00000488196 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
STRADB-209ENST00000488196 MROH2AA6NES4 1674 aa36.08■■■■□ 3.37
STRADB-209ENST00000488196 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.08■■■■□ 3.37
STRADB-209ENST00000488196 ZMYM3Q14202 1370 aa36.08■■■■□ 3.37
STRADB-209ENST00000488196 HSPA2P54652 639 aa36.06■■■■□ 3.36
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STRADB-209ENST00000488196 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.04■■■■□ 3.36
STRADB-209ENST00000488196 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.03■■■■□ 3.36
STRADB-209ENST00000488196 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.02■■■■□ 3.36
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