RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487064.1

RPS3AP50-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 50, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP50, Length 803 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP50-201ENST00000487064 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.02□□□□□ -0.97
RPS3AP50-201ENST00000487064 PPP1R37O75864 691 aa9.01□□□□□ -0.97
RPS3AP50-201ENST00000487064 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RPS3AP50-201ENST00000487064 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RPS3AP50-201ENST00000487064 TMEM92Q6UXU6 159 aa9□□□□□ -0.97
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RPS3AP50-201ENST00000487064 C2orf72A6NCS6 295 aa8.98□□□□□ -0.97
RPS3AP50-201ENST00000487064 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RPS3AP50-201ENST00000487064 EMP3P54852 163 aa8.98□□□□□ -0.97
RPS3AP50-201ENST00000487064 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RPS3AP50-201ENST00000487064 KIF3CO14782 793 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3AP50-201ENST00000487064 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RPS3AP50-201ENST00000487064 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RPS3AP50-201ENST00000487064 MARVELD3Q96A59 401 aa8.93□□□□□ -0.98
RPS3AP50-201ENST00000487064 PDE4AP27815 886 aa8.92□□□□□ -0.98
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLC34A2O95436 690 aa8.91□□□□□ -0.98
RPS3AP50-201ENST00000487064 FOXK1P85037 733 aa8.91□□□□□ -0.98
RPS3AP50-201ENST00000487064 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.91□□□□□ -0.98
RPS3AP50-201ENST00000487064 ERBB3P21860 1342 aa8.9□□□□□ -0.98
RPS3AP50-201ENST00000487064 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.9□□□□□ -0.98
RPS3AP50-201ENST00000487064 TBC1D12O60347 775 aa8.89□□□□□ -0.99
RPS3AP50-201ENST00000487064 FAM205CA6NFA0 338 aa8.88□□□□□ -0.99
RPS3AP50-201ENST00000487064 PLPP6Q8IY26 295 aa8.88□□□□□ -0.99
RPS3AP50-201ENST00000487064 GPR153Q6NV75 609 aa8.87□□□□□ -0.99
RPS3AP50-201ENST00000487064 ARSIQ5FYB1 569 aa8.86□□□□□ -0.99
RPS3AP50-201ENST00000487064 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.86□□□□□ -0.99
RPS3AP50-201ENST00000487064 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.86□□□□□ -0.99
RPS3AP50-201ENST00000487064 DSG2Q14126 1118 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3AP50-201ENST00000487064 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3AP50-201ENST00000487064 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3AP50-201ENST00000487064 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
RPS3AP50-201ENST00000487064 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
RPS3AP50-201ENST00000487064 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RPS3AP50-201ENST00000487064 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RPS3AP50-201ENST00000487064 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RPS3AP50-201ENST00000487064 CFAP44Q96MT7 982 aa8.81□□□□□ -1
RPS3AP50-201ENST00000487064 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RPS3AP50-201ENST00000487064 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.8□□□□□ -1
RPS3AP50-201ENST00000487064 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.8□□□□□ -1
RPS3AP50-201ENST00000487064 NUDT7P0C024 238 aa8.78□□□□□ -1
RPS3AP50-201ENST00000487064 MFSD10Q14728 455 aa8.78□□□□□ -1
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.77□□□□□ -1.01
RPS3AP50-201ENST00000487064 OXER1Q8TDS5 423 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3AP50-201ENST00000487064 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
RPS3AP50-201ENST00000487064 PBX2P40425 430 aa8.74□□□□□ -1.01
RPS3AP50-201ENST00000487064 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
RPS3AP50-201ENST00000487064 WDR70Q9NW82 654 aa8.73□□□□□ -1.01
RPS3AP50-201ENST00000487064 LHX6Q9UPM6 363 aa8.73□□□□□ -1.01
RPS3AP50-201ENST00000487064 POTEB3A0JP26 581 aa8.72□□□□□ -1.01
RPS3AP50-201ENST00000487064 MAP3K9P80192 1104 aa8.72□□□□□ -1.01
RPS3AP50-201ENST00000487064 POTEBQ6S5H4 581 aa8.72□□□□□ -1.01
RPS3AP50-201ENST00000487064 KCNH8Q96L42 1107 aa8.72□□□□□ -1.01
RPS3AP50-201ENST00000487064 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.71□□□□□ -1.02
RPS3AP50-201ENST00000487064 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.71□□□□□ -1.02
RPS3AP50-201ENST00000487064 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.68□□□□□ -1.02
RPS3AP50-201ENST00000487064 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.68□□□□□ -1.02
RPS3AP50-201ENST00000487064 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.67□□□□□ -1.02
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLC24A1O60721 1099 aa8.67□□□□□ -1.02
RPS3AP50-201ENST00000487064 PTGER2P43116 358 aa8.67□□□□□ -1.02
RPS3AP50-201ENST00000487064 EVI5O60447 810 aa8.66□□□□□ -1.02
RPS3AP50-201ENST00000487064 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.66□□□□□ -1.02
RPS3AP50-201ENST00000487064 CAMK2BQ13554 666 aa8.65□□□□□ -1.02
RPS3AP50-201ENST00000487064 ARHGAP33O14559 1287 aa8.64□□□□□ -1.03
RPS3AP50-201ENST00000487064 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.63□□□□□ -1.03
RPS3AP50-201ENST00000487064 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
RPS3AP50-201ENST00000487064 E2F4Q16254 413 aa8.62□□□□□ -1.03
RPS3AP50-201ENST00000487064 JPH4Q96JJ6 628 aa8.62□□□□□ -1.03
RPS3AP50-201ENST00000487064 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.62□□□□□ -1.03
RPS3AP50-201ENST00000487064 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.61□□□□□ -1.03
RPS3AP50-201ENST00000487064 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RPS3AP50-201ENST00000487064 FOSBP53539 338 aa8.59□□□□□ -1.03
RPS3AP50-201ENST00000487064 MMRN1Q13201 1228 aa8.59□□□□□ -1.03
RPS3AP50-201ENST00000487064 DPYSL4O14531 572 aa8.58□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 FBXW7Q969H0 707 aa8.58□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.58□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 TK2O00142 265 aa8.57□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 PTPREP23469 700 aa8.57□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 PLCB2Q00722 1185 aa8.57□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 STAC3Q96MF2 364 aa8.57□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.57□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 KCNK17Q96T54 332 aa8.56□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 EPAS1Q99814 870 aa8.56□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.56□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.56□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.56□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 PHF14O94880 888 aa8.55□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.55□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 PDIA6Q15084 440 aa8.53□□□□□ -1.04
RPS3AP50-201ENST00000487064 PSEN2P49810 448 aa8.52□□□□□ -1.05
RPS3AP50-201ENST00000487064 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.52□□□□□ -1.05
RPS3AP50-201ENST00000487064 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RPS3AP50-201ENST00000487064 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.51□□□□□ -1.05
RPS3AP50-201ENST00000487064 P3H3Q8IVL6 736 aa8.51□□□□□ -1.05
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.51□□□□□ -1.05
RPS3AP50-201ENST00000487064 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.51□□□□□ -1.05
RPS3AP50-201ENST00000487064 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms