RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486115.1

C7orf49-210, humanhuman

TSL 2

Gene C7orf49, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-210ENST00000486115 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.23■■■□□ 2.11
C7orf49-210ENST00000486115 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
C7orf49-210ENST00000486115 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.21■■■□□ 2.11
C7orf49-210ENST00000486115 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.2■■■□□ 2.1
C7orf49-210ENST00000486115 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
C7orf49-210ENST00000486115 AKNAQ7Z591 1439 aa28.17■■■□□ 2.1
C7orf49-210ENST00000486115 KDM6BO15054 1643 aa28.16■■■□□ 2.1
C7orf49-210ENST00000486115 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.15■■■□□ 2.1
C7orf49-210ENST00000486115 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.12■■■□□ 2.09
C7orf49-210ENST00000486115 ADGRL1O94910 1474 aa28.12■■■□□ 2.09
C7orf49-210ENST00000486115 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.08■■■□□ 2.09
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
C7orf49-210ENST00000486115 MIA2Q96PC5 1412 aa28.08■■■□□ 2.09
C7orf49-210ENST00000486115 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
C7orf49-210ENST00000486115 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.06■■■□□ 2.08
C7orf49-210ENST00000486115 ABCC1P33527 1531 aa28.05■■■□□ 2.08
C7orf49-210ENST00000486115 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.04■■■□□ 2.08
C7orf49-210ENST00000486115 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
C7orf49-210ENST00000486115 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
C7orf49-210ENST00000486115 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.01■■■□□ 2.08
C7orf49-210ENST00000486115 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.01■■■□□ 2.07
C7orf49-210ENST00000486115 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28■■■□□ 2.07
C7orf49-210ENST00000486115 FGD6Q6ZV73 1430 aa28■■■□□ 2.07
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.98■■■□□ 2.07
C7orf49-210ENST00000486115 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.97■■■□□ 2.07
C7orf49-210ENST00000486115 RAPGEF3O95398 923 aa27.96■■■□□ 2.07
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
C7orf49-210ENST00000486115 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.95■■■□□ 2.07
C7orf49-210ENST00000486115 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.94■■■□□ 2.06
C7orf49-210ENST00000486115 RICTORQ6R327 1708 aa27.94■■■□□ 2.06
C7orf49-210ENST00000486115 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.92■■■□□ 2.06
C7orf49-210ENST00000486115 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
C7orf49-210ENST00000486115 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
C7orf49-210ENST00000486115 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.91■■■□□ 2.06
C7orf49-210ENST00000486115 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.91■■■□□ 2.06
C7orf49-210ENST00000486115 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.89■■■□□ 2.06
C7orf49-210ENST00000486115 KDM5CP41229 1560 aa27.89■■■□□ 2.05
C7orf49-210ENST00000486115 MBD5Q9P267 1494 aa27.89■■■□□ 2.05
C7orf49-210ENST00000486115 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.88■■■□□ 2.05
C7orf49-210ENST00000486115 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.87■■■□□ 2.05
C7orf49-210ENST00000486115 AFAP1Q8N556 730 aa27.87■■■□□ 2.05
C7orf49-210ENST00000486115 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.87■■■□□ 2.05
C7orf49-210ENST00000486115 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.82■■■□□ 2.04
C7orf49-210ENST00000486115 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
C7orf49-210ENST00000486115 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.82■■■□□ 2.04
C7orf49-210ENST00000486115 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.81■■■□□ 2.04
C7orf49-210ENST00000486115 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
C7orf49-210ENST00000486115 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.81■■■□□ 2.04
C7orf49-210ENST00000486115 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.79■■■□□ 2.04
C7orf49-210ENST00000486115 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
C7orf49-210ENST00000486115 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
C7orf49-210ENST00000486115 TSPY4P0CV99 314 aa27.77■■■□□ 2.04
C7orf49-210ENST00000486115 TSPY10P0CW01 314 aa27.77■■■□□ 2.04
C7orf49-210ENST00000486115 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
C7orf49-210ENST00000486115 ATP7AQ04656 1500 aa27.75■■■□□ 2.03
C7orf49-210ENST00000486115 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.75■■■□□ 2.03
C7orf49-210ENST00000486115 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
C7orf49-210ENST00000486115 DAPK1P53355 1430 aa27.74■■■□□ 2.03
C7orf49-210ENST00000486115 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.74■■■□□ 2.03
C7orf49-210ENST00000486115 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.73■■■□□ 2.03
C7orf49-210ENST00000486115 ABCC5O15440 1437 aa27.72■■■□□ 2.03
C7orf49-210ENST00000486115 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.7■■■□□ 2.03
C7orf49-210ENST00000486115 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.7■■■□□ 2.03
C7orf49-210ENST00000486115 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.69■■■□□ 2.02
C7orf49-210ENST00000486115 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.69■■■□□ 2.02
C7orf49-210ENST00000486115 ATP10AO60312 1499 aa27.69■■■□□ 2.02
C7orf49-210ENST00000486115 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.68■■■□□ 2.02
C7orf49-210ENST00000486115 ABCA6Q8N139 1617 aa27.67■■■□□ 2.02
C7orf49-210ENST00000486115 REREQ9P2R6 1566 aa27.62■■■□□ 2.01
C7orf49-210ENST00000486115 PLXNC1O60486 1568 aa27.6■■■□□ 2.01
C7orf49-210ENST00000486115 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.6■■■□□ 2.01
C7orf49-210ENST00000486115 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.59■■■□□ 2.01
C7orf49-210ENST00000486115 A2MP01023 1474 aa27.58■■■□□ 2.01
C7orf49-210ENST00000486115 ADGRL2O95490 1459 aa27.57■■■□□ 2
C7orf49-210ENST00000486115 ITGAEP38570 1179 aa27.56■■■□□ 2
C7orf49-210ENST00000486115 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.56■■■□□ 2
C7orf49-210ENST00000486115 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
C7orf49-210ENST00000486115 KIF15Q9NS87 1388 aa27.54■■■□□ 2
C7orf49-210ENST00000486115 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
C7orf49-210ENST00000486115 AGLP35573 1532 aa27.52■■■□□ 2
C7orf49-210ENST00000486115 PTPRKQ15262 1439 aa27.52■■■□□ 2
C7orf49-210ENST00000486115 ROCK1Q13464 1354 aa27.52■■■□□ 2
C7orf49-210ENST00000486115 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.51■■■□□ 2
C7orf49-210ENST00000486115 NCOA1Q15788 1441 aa27.51■■□□□ 1.99
C7orf49-210ENST00000486115 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.49■■□□□ 1.99
C7orf49-210ENST00000486115 ERBINQ96RT1 1412 aa27.45■■□□□ 1.98
C7orf49-210ENST00000486115 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.44■■□□□ 1.98
C7orf49-210ENST00000486115 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
C7orf49-210ENST00000486115 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.41■■□□□ 1.98
C7orf49-210ENST00000486115 KIF3BO15066 747 aa27.38■■□□□ 1.97
C7orf49-210ENST00000486115 MLECQ14165 292 aa27.38■■□□□ 1.97
C7orf49-210ENST00000486115 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.37■■□□□ 1.97
C7orf49-210ENST00000486115 HFM1A2PYH4 1435 aa27.33■■□□□ 1.97
C7orf49-210ENST00000486115 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
C7orf49-210ENST00000486115 GGT6Q6P531 493 aa27.32■■□□□ 1.96
C7orf49-210ENST00000486115 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.32■■□□□ 1.96
C7orf49-210ENST00000486115 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.32■■□□□ 1.96
C7orf49-210ENST00000486115 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
C7orf49-210ENST00000486115 NAIPQ13075 1403 aa27.3■■□□□ 1.96
C7orf49-210ENST00000486115 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.3■■□□□ 1.96
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