RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485623.5

ATG16L1-216, Transcript of autophagy related 16 like 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATG16L1, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1-216ENST00000485623 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.62■■□□□ 1.37
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ATG16L1-216ENST00000485623 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
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ATG16L1-216ENST00000485623 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.44■■□□□ 1.34
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ATG16L1-216ENST00000485623 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.03■■□□□ 1.28
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ATG16L1-216ENST00000485623 C3P01024 1663 aa22.93■■□□□ 1.26
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ATG16L1-216ENST00000485623 MROH2AA6NES4 1674 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG16L1-216ENST00000485623 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ATG16L1-216ENST00000485623 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG16L1-216ENST00000485623 NPATQ14207 1427 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG16L1-216ENST00000485623 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ATG16L1-216ENST00000485623 KIF15Q9NS87 1388 aa22.89■■□□□ 1.25
ATG16L1-216ENST00000485623 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.88■■□□□ 1.25
ATG16L1-216ENST00000485623 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ATG16L1-216ENST00000485623 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.87■■□□□ 1.25
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