RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479495.5

QARS-215, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 4

Gene QARS, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-215	ENST00000479495	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		15.36	■□□□□ 0.05
QARS-215	ENST00000479495	STRC	Q7RTU9	1775 aa		15.36	■□□□□ 0.05
QARS-215	ENST00000479495	HECW1	Q76N89	1606 aa		15.35	■□□□□ 0.05
QARS-215	ENST00000479495	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	15.35	■□□□□ 0.05
QARS-215	ENST00000479495	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.05
QARS-215	ENST00000479495	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
QARS-215	ENST00000479495	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		15.31	■□□□□ 0.04
QARS-215	ENST00000479495	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
QARS-215	ENST00000479495	ATP10A	O60312	1499 aa		15.29	■□□□□ 0.04
QARS-215	ENST00000479495	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		15.29	■□□□□ 0.04
QARS-215	ENST00000479495	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		15.29	■□□□□ 0.04
QARS-215	ENST00000479495	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		15.28	■□□□□ 0.04
QARS-215	ENST00000479495	PTPRT	O14522	1441 aa		15.25	■□□□□ 0.03
QARS-215	ENST00000479495	PLCH2	O75038	1416 aa		15.24	■□□□□ 0.03
QARS-215	ENST00000479495	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		15.23	■□□□□ 0.03
QARS-215	ENST00000479495	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		15.23	■□□□□ 0.03
QARS-215	ENST00000479495	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		15.22	■□□□□ 0.03
QARS-215	ENST00000479495	C3	P01024	1663 aa		15.21	■□□□□ 0.03
QARS-215	ENST00000479495	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		15.2	■□□□□ 0.02
QARS-215	ENST00000479495	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		15.2	■□□□□ 0.02
QARS-215	ENST00000479495	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		15.2	■□□□□ 0.02
QARS-215	ENST00000479495	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
QARS-215	ENST00000479495	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
QARS-215	ENST00000479495	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		15.18	■□□□□ 0.02
QARS-215	ENST00000479495	AFAP1	Q8N556	730 aa		15.14	■□□□□ 0.01
QARS-215	ENST00000479495	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
QARS-215	ENST00000479495	KDM5C	P41229	1560 aa		15.14	■□□□□ 0.01
QARS-215	ENST00000479495	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		15.14	■□□□□ 0.01
QARS-215	ENST00000479495	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		15.13	■□□□□ 0.01
QARS-215	ENST00000479495	RERE	Q9P2R6	1566 aa		15.12	■□□□□ 0.01
QARS-215	ENST00000479495	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	15.12	■□□□□ 0.01
QARS-215	ENST00000479495	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		15.12	■□□□□ 0.01
QARS-215	ENST00000479495	NCOA1	Q15788	1441 aa		15.11	■□□□□ 0.01
QARS-215	ENST00000479495	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		15.11	■□□□□ 0.01
QARS-215	ENST00000479495	KIF14	Q15058	1648 aa		15.1	■□□□□ 0.01
QARS-215	ENST00000479495	ABCA6	Q8N139	1617 aa		15.1	■□□□□ 0.01
QARS-215	ENST00000479495	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		15.1	■□□□□ 0.01
QARS-215	ENST00000479495	AGL	P35573	1532 aa		15.08	■□□□□ 0.01
QARS-215	ENST00000479495	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	15.08	■□□□□ 0
QARS-215	ENST00000479495	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		15.07	■□□□□ 0
QARS-215	ENST00000479495	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		15.07	■□□□□ 0
QARS-215	ENST00000479495	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		15.06	■□□□□ 0
QARS-215	ENST00000479495	EEA1	Q15075	1411 aa		15.06	■□□□□ 0
QARS-215	ENST00000479495	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
QARS-215	ENST00000479495	MROH2A	A6NES4	1674 aa		15.04	■□□□□ -0
QARS-215	ENST00000479495	CLIP1	P30622	1438 aa		15.04	■□□□□ -0
QARS-215	ENST00000479495	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		15.04	■□□□□ -0
QARS-215	ENST00000479495	FMN1	Q68DA7	1419 aa		15.03	■□□□□ -0
QARS-215	ENST00000479495	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
QARS-215	ENST00000479495	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		15.02	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		15.02	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	NPAT	Q14207	1427 aa		15.01	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	PKD2	Q13563	968 aa		15	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	PREX2	Q70Z35	1606 aa		14.99	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	ABCC1	P33527	1531 aa		14.99	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	ZMYM3	Q14202	1370 aa		14.98	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		14.97	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	PLA2R1	Q13018	1463 aa		14.97	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		14.97	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	HSPA1L	P34931	641 aa		14.96	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	PIP4K2B	P78356	416 aa		14.96	□□□□□ -0.01
QARS-215	ENST00000479495	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
QARS-215	ENST00000479495	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		14.95	□□□□□ -0.02
QARS-215	ENST00000479495	TOM1	O60784	492 aa		14.94	□□□□□ -0.02
QARS-215	ENST00000479495	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
QARS-215	ENST00000479495	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
QARS-215	ENST00000479495	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		14.93	□□□□□ -0.02
QARS-215	ENST00000479495	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		14.93	□□□□□ -0.02
QARS-215	ENST00000479495	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
QARS-215	ENST00000479495	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		14.93	□□□□□ -0.02
QARS-215	ENST00000479495	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		14.92	□□□□□ -0.02
QARS-215	ENST00000479495	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
QARS-215	ENST00000479495	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
QARS-215	ENST00000479495	PTPRK	Q15262	1439 aa		14.89	□□□□□ -0.03
QARS-215	ENST00000479495	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
QARS-215	ENST00000479495	GGT6	Q6P531	493 aa		14.88	□□□□□ -0.03
QARS-215	ENST00000479495	CPS1	P31327	1500 aa		14.87	□□□□□ -0.03
QARS-215	ENST00000479495	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
QARS-215	ENST00000479495	ATP7A	Q04656	1500 aa		14.86	□□□□□ -0.03
QARS-215	ENST00000479495	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		14.86	□□□□□ -0.03
QARS-215	ENST00000479495	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		14.85	□□□□□ -0.03
QARS-215	ENST00000479495	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		14.85	□□□□□ -0.03
QARS-215	ENST00000479495	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	14.85	□□□□□ -0.03
QARS-215	ENST00000479495	A2M	P01023	1474 aa		14.84	□□□□□ -0.03
QARS-215	ENST00000479495	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		14.84	□□□□□ -0.03
QARS-215	ENST00000479495	PLXNC1	O60486	1568 aa		14.84	□□□□□ -0.03
QARS-215	ENST00000479495	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
QARS-215	ENST00000479495	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		14.81	□□□□□ -0.04
QARS-215	ENST00000479495	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		14.81	□□□□□ -0.04
QARS-215	ENST00000479495	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		14.79	□□□□□ -0.04
QARS-215	ENST00000479495	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
QARS-215	ENST00000479495	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
QARS-215	ENST00000479495	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		14.78	□□□□□ -0.04
QARS-215	ENST00000479495	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		14.78	□□□□□ -0.04
QARS-215	ENST00000479495	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		14.77	□□□□□ -0.04
QARS-215	ENST00000479495	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 261.4 ms