RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478021.1

TRAF4-211, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 718 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-211ENST00000478021 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.28■■■■□ 3.4
TRAF4-211ENST00000478021 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.25■■■■□ 3.39
TRAF4-211ENST00000478021 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.25■■■■□ 3.39
TRAF4-211ENST00000478021 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.25■■■■□ 3.39
TRAF4-211ENST00000478021 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.25■■■■□ 3.39
TRAF4-211ENST00000478021 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.18■■■■□ 3.38
TRAF4-211ENST00000478021 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.18■■■■□ 3.38
TRAF4-211ENST00000478021 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.16■■■■□ 3.38
TRAF4-211ENST00000478021 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.14■■■■□ 3.38
TRAF4-211ENST00000478021 TIAM1Q13009 1591 aa36.13■■■■□ 3.37
TRAF4-211ENST00000478021 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
TRAF4-211ENST00000478021 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.08■■■■□ 3.37
TRAF4-211ENST00000478021 ABCC1P33527 1531 aa36.08■■■■□ 3.37
TRAF4-211ENST00000478021 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.08■■■■□ 3.37
TRAF4-211ENST00000478021 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.07■■■■□ 3.36
TRAF4-211ENST00000478021 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.06■■■■□ 3.36
TRAF4-211ENST00000478021 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
TRAF4-211ENST00000478021 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.05■■■■□ 3.36
TRAF4-211ENST00000478021 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.03■■■■□ 3.36
TRAF4-211ENST00000478021 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.03■■■■□ 3.36
TRAF4-211ENST00000478021 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.03■■■■□ 3.36
TRAF4-211ENST00000478021 AFAP1Q8N556 730 aa36.02■■■■□ 3.36
TRAF4-211ENST00000478021 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
TRAF4-211ENST00000478021 KDM5CP41229 1560 aa36■■■■□ 3.35
TRAF4-211ENST00000478021 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
TRAF4-211ENST00000478021 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.99■■■■□ 3.35
TRAF4-211ENST00000478021 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
TRAF4-211ENST00000478021 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.96■■■■□ 3.35
TRAF4-211ENST00000478021 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.95■■■■□ 3.35
TRAF4-211ENST00000478021 NCOA2Q15596 1464 aa35.95■■■■□ 3.35
TRAF4-211ENST00000478021 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.94■■■■□ 3.34
TRAF4-211ENST00000478021 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.94■■■■□ 3.34
TRAF4-211ENST00000478021 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.94■■■■□ 3.34
TRAF4-211ENST00000478021 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.93■■■■□ 3.34
TRAF4-211ENST00000478021 MAP3K1Q13233 1512 aa35.92■■■■□ 3.34
TRAF4-211ENST00000478021 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.9■■■■□ 3.34
TRAF4-211ENST00000478021 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
TRAF4-211ENST00000478021 ATP10AO60312 1499 aa35.87■■■■□ 3.33
TRAF4-211ENST00000478021 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.87■■■■□ 3.33
TRAF4-211ENST00000478021 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.85■■■■□ 3.33
TRAF4-211ENST00000478021 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.85■■■■□ 3.33
TRAF4-211ENST00000478021 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.84■■■■□ 3.33
TRAF4-211ENST00000478021 ABCA6Q8N139 1617 aa35.84■■■■□ 3.33
TRAF4-211ENST00000478021 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.84■■■■□ 3.33
TRAF4-211ENST00000478021 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
TRAF4-211ENST00000478021 MADDQ8WXG6 1647 aa35.83■■■■□ 3.33
TRAF4-211ENST00000478021 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.82■■■■□ 3.32
TRAF4-211ENST00000478021 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.81■■■■□ 3.32
TRAF4-211ENST00000478021 APLP2Q06481 763 aa35.79■■■■□ 3.32
TRAF4-211ENST00000478021 MLECQ14165 292 aa35.76■■■■□ 3.32
TRAF4-211ENST00000478021 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
TRAF4-211ENST00000478021 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
TRAF4-211ENST00000478021 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.73■■■■□ 3.31
TRAF4-211ENST00000478021 PTPRMP28827 1452 aa35.71■■■■□ 3.31
TRAF4-211ENST00000478021 REREQ9P2R6 1566 aa35.69■■■■□ 3.3
TRAF4-211ENST00000478021 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
TRAF4-211ENST00000478021 ATP7AQ04656 1500 aa35.69■■■■□ 3.3
TRAF4-211ENST00000478021 MBD5Q9P267 1494 aa35.69■■■■□ 3.3
TRAF4-211ENST00000478021 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.66■■■■□ 3.3
TRAF4-211ENST00000478021 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.62■■■■□ 3.29
TRAF4-211ENST00000478021 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.58■■■■□ 3.29
TRAF4-211ENST00000478021 AGLP35573 1532 aa35.57■■■■□ 3.29
TRAF4-211ENST00000478021 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.55■■■■□ 3.28
TRAF4-211ENST00000478021 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.54■■■■□ 3.28
TRAF4-211ENST00000478021 MIA2Q96PC5 1412 aa35.53■■■■□ 3.28
TRAF4-211ENST00000478021 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.51■■■■□ 3.28
TRAF4-211ENST00000478021 A2MP01023 1474 aa35.5■■■■□ 3.27
TRAF4-211ENST00000478021 PLXNC1O60486 1568 aa35.49■■■■□ 3.27
TRAF4-211ENST00000478021 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.49■■■■□ 3.27
TRAF4-211ENST00000478021 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.47■■■■□ 3.27
TRAF4-211ENST00000478021 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.44■■■■□ 3.26
TRAF4-211ENST00000478021 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.4■■■■□ 3.26
TRAF4-211ENST00000478021 TSPY4P0CV99 314 aa35.39■■■■□ 3.26
TRAF4-211ENST00000478021 TSPY10P0CW01 314 aa35.39■■■■□ 3.26
TRAF4-211ENST00000478021 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
TRAF4-211ENST00000478021 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.35■■■■□ 3.25
TRAF4-211ENST00000478021 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
TRAF4-211ENST00000478021 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
TRAF4-211ENST00000478021 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
TRAF4-211ENST00000478021 C3P01024 1663 aa35.32■■■■□ 3.24
TRAF4-211ENST00000478021 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.31■■■■□ 3.24
TRAF4-211ENST00000478021 GGT6Q6P531 493 aa35.3■■■■□ 3.24
TRAF4-211ENST00000478021 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.28■■■■□ 3.24
TRAF4-211ENST00000478021 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
TRAF4-211ENST00000478021 ABCC5O15440 1437 aa35.26■■■■□ 3.24
TRAF4-211ENST00000478021 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.26■■■■□ 3.24
TRAF4-211ENST00000478021 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
TRAF4-211ENST00000478021 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
TRAF4-211ENST00000478021 MROH2AA6NES4 1674 aa35.24■■■■□ 3.23
TRAF4-211ENST00000478021 DAPK1P53355 1430 aa35.23■■■■□ 3.23
TRAF4-211ENST00000478021 KIF3BO15066 747 aa35.22■■■■□ 3.23
TRAF4-211ENST00000478021 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.2■■■■□ 3.23
TRAF4-211ENST00000478021 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.19■■■■□ 3.22
TRAF4-211ENST00000478021 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
TRAF4-211ENST00000478021 ZMYM3Q14202 1370 aa35.14■■■■□ 3.22
TRAF4-211ENST00000478021 HSPA2P54652 639 aa35.13■■■■□ 3.21
TRAF4-211ENST00000478021 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.11■■■■□ 3.21
TRAF4-211ENST00000478021 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.11■■■■□ 3.21
TRAF4-211ENST00000478021 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.1■■■■□ 3.21
TRAF4-211ENST00000478021 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
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