RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 NCOA1Q15788 1441 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 KDM6BO15054 1643 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 ARID3CA6NKF2 412 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 IFT140Q96RY7 1462 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 PBRM1Q86U86 1689 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-206ENST00000469947 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 NUDCQ9Y266 331 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 GRIN2BQ13224 1484 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 HECW1Q76N89 1606 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-206ENST00000469947 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 ADAMTS12P58397 1594 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 IL27Q8NEV9 243 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 SAMD9Q5K651 1589 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGEF11O15085 1522 aa18.21■□□□□ 0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 TMC1Q8TDI8 760 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 FBLN2P98095 1184 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 USP47Q96K76 1375 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 NEFMP07197 916 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 SKAP1Q86WV1 359 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 GRIN2AQ12879 1464 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 IQGAP2Q13576 1575 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 RRP1P56182 461 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 PDE4AP27815 886 aa18.08■□□□□ 0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 DAPK1P53355 1430 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 MIA2Q96PC5 1412 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 SYNJ2O15056 1496 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCC5O15440 1437 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 RCAN3Q9UKA8 241 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 USP35Q9P2H5 1018 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 PLIN1O60240 522 aa18.02■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 BACH2Q9BYV9 841 aa18.02■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 CEP170Q5SW79 1584 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 PZPP20742 1482 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 ROCK1Q13464 1354 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 PKD2Q13563 968 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 CDCA7LQ96GN5 454 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 CARD11Q9BXL7 1154 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 MBD5Q9P267 1494 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC4A3P48751 1232 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 KIF15Q9NS87 1388 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 DISP1Q96F81 1524 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 BRPF3Q9ULD4 1205 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 KDM5CP41229 1560 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 NUP160Q12769 1436 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 MS4A1P11836 297 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms