RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 KDM6BO15054 1643 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-211ENST00000469733 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-211ENST00000469733 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-211ENST00000469733 MIER1Q8N108 512 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-211ENST00000469733 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-211ENST00000469733 TONSLQ96HA7 1378 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-211ENST00000469733 TRIM52Q96A61 297 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-211ENST00000469733 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-211ENST00000469733 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-211ENST00000469733 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-211ENST00000469733 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-211ENST00000469733 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.66■■□□□ 1.54
FAAP20-211ENST00000469733 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
FAAP20-211ENST00000469733 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
FAAP20-211ENST00000469733 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-211ENST00000469733 ADGRL2O95490 1459 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-211ENST00000469733 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-211ENST00000469733 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-211ENST00000469733 NCOA1Q15788 1441 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-211ENST00000469733 ABCC2Q92887 1545 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-211ENST00000469733 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.54■■□□□ 1.52
FAAP20-211ENST00000469733 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.54■■□□□ 1.52
FAAP20-211ENST00000469733 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-211ENST00000469733 PREX2Q70Z35 1606 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-211ENST00000469733 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-211ENST00000469733 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-211ENST00000469733 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-211ENST00000469733 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-211ENST00000469733 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-211ENST00000469733 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-211ENST00000469733 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-211ENST00000469733 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-211ENST00000469733 FOXD1Q16676 465 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-211ENST00000469733 PZPP20742 1482 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-211ENST00000469733 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-211ENST00000469733 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-211ENST00000469733 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-211ENST00000469733 TSPY4P0CV99 314 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-211ENST00000469733 TSPY10P0CW01 314 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-211ENST00000469733 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.55e-8■■■□□ 16
FAAP20-211ENST00000469733 MBD5Q9P267 1494 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-211ENST00000469733 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-211ENST00000469733 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-211ENST00000469733 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-211ENST00000469733 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-211ENST00000469733 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-211ENST00000469733 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-211ENST00000469733 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-211ENST00000469733 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-211ENST00000469733 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-211ENST00000469733 KIF15Q9NS87 1388 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-211ENST00000469733 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-211ENST00000469733 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-211ENST00000469733 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-211ENST00000469733 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-211ENST00000469733 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-211ENST00000469733 KCNH8Q96L42 1107 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-211ENST00000469733 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-211ENST00000469733 NUP155O75694 1391 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-211ENST00000469733 PKD2Q13563 968 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-211ENST00000469733 PLCH2O75038 1416 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-211ENST00000469733 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-211ENST00000469733 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-211ENST00000469733 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-211ENST00000469733 PLXNC1O60486 1568 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-211ENST00000469733 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-211ENST00000469733 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-211ENST00000469733 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-211ENST00000469733 ABCC1P33527 1531 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-211ENST00000469733 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-211ENST00000469733 UNC13BO14795 1591 aa24.14■■□□□ 1.46
FAAP20-211ENST00000469733 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.14■■□□□ 1.46
FAAP20-211ENST00000469733 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-211ENST00000469733 ANP32CO43423 234 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-211ENST00000469733 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-211ENST00000469733 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-211ENST00000469733 OSCARQ8IYS5 282 aa24.08■■□□□ 1.44
FAAP20-211ENST00000469733 ERBINQ96RT1 1412 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-211ENST00000469733 CCER2I3L3R5 266 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-211ENST00000469733 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-211ENST00000469733 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-211ENST00000469733 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-211ENST00000469733 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-211ENST00000469733 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-211ENST00000469733 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-211ENST00000469733 ASXL2Q76L83 1435 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-211ENST00000469733 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
FAAP20-211ENST00000469733 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC7Q96M83 1385 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-211ENST00000469733 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-211ENST00000469733 FANCAO15360 1455 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
FAAP20-211ENST00000469733 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
FAAP20-211ENST00000469733 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.98■■□□□ 1.43
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.96■■□□□ 1.43
FAAP20-211ENST00000469733 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.96■■□□□ 1.43
FAAP20-211ENST00000469733 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.96■■□□□ 1.43
FAAP20-211ENST00000469733 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms