RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465199.5

C1orf35-202, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 5

Gene C1orf35, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-202ENST00000465199 PLCH2O75038 1416 aa34.42■■■■□ 3.1
C1orf35-202ENST00000465199 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.41■■■■□ 3.1
C1orf35-202ENST00000465199 NCOA2Q15596 1464 aa34.4■■■■□ 3.1
C1orf35-202ENST00000465199 AKNAQ7Z591 1439 aa34.39■■■■□ 3.1
C1orf35-202ENST00000465199 RICTORQ6R327 1708 aa34.39■■■■□ 3.1
C1orf35-202ENST00000465199 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
C1orf35-202ENST00000465199 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
C1orf35-202ENST00000465199 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
C1orf35-202ENST00000465199 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.32■■■■□ 3.08
C1orf35-202ENST00000465199 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
C1orf35-202ENST00000465199 PREX2Q70Z35 1606 aa34.3■■■■□ 3.08
C1orf35-202ENST00000465199 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.3■■■■□ 3.08
C1orf35-202ENST00000465199 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.29■■■■□ 3.08
C1orf35-202ENST00000465199 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.26■■■■□ 3.08
C1orf35-202ENST00000465199 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.24■■■■□ 3.07
C1orf35-202ENST00000465199 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.2■■■■□ 3.07
C1orf35-202ENST00000465199 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
C1orf35-202ENST00000465199 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.19■■■■□ 3.06
C1orf35-202ENST00000465199 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.17■■■■□ 3.06
C1orf35-202ENST00000465199 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.16■■■■□ 3.06
C1orf35-202ENST00000465199 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
C1orf35-202ENST00000465199 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.14■■■■□ 3.06
C1orf35-202ENST00000465199 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.14■■■■□ 3.06
C1orf35-202ENST00000465199 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
C1orf35-202ENST00000465199 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.13■■■■□ 3.05
C1orf35-202ENST00000465199 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.13■■■■□ 3.05
C1orf35-202ENST00000465199 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.13■■■■□ 3.05
C1orf35-202ENST00000465199 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
C1orf35-202ENST00000465199 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.11■■■■□ 3.05
C1orf35-202ENST00000465199 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.1■■■■□ 3.05
C1orf35-202ENST00000465199 ABCC1P33527 1531 aa34.09■■■■□ 3.05
C1orf35-202ENST00000465199 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.06■■■■□ 3.04
C1orf35-202ENST00000465199 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.06■■■■□ 3.04
C1orf35-202ENST00000465199 MIA2Q96PC5 1412 aa34.05■■■■□ 3.04
C1orf35-202ENST00000465199 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.03■■■■□ 3.04
C1orf35-202ENST00000465199 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.02■■■■□ 3.04
C1orf35-202ENST00000465199 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.02■■■■□ 3.04
C1orf35-202ENST00000465199 MADDQ8WXG6 1647 aa34.02■■■■□ 3.04
C1orf35-202ENST00000465199 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.01■■■■□ 3.04
C1orf35-202ENST00000465199 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.01■■■■□ 3.03
C1orf35-202ENST00000465199 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.01■■■■□ 3.03
C1orf35-202ENST00000465199 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.01■■■■□ 3.03
C1orf35-202ENST00000465199 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34■■■■□ 3.03
C1orf35-202ENST00000465199 MBD5Q9P267 1494 aa33.98■■■■□ 3.03
C1orf35-202ENST00000465199 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.97■■■■□ 3.03
C1orf35-202ENST00000465199 AFAP1Q8N556 730 aa33.97■■■■□ 3.03
C1orf35-202ENST00000465199 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
C1orf35-202ENST00000465199 KDM5CP41229 1560 aa33.95■■■■□ 3.03
C1orf35-202ENST00000465199 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
C1orf35-202ENST00000465199 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.94■■■■□ 3.02
C1orf35-202ENST00000465199 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.93■■■■□ 3.02
C1orf35-202ENST00000465199 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.93■■■■□ 3.02
C1orf35-202ENST00000465199 PTPRMP28827 1452 aa33.93■■■■□ 3.02
C1orf35-202ENST00000465199 ATP10AO60312 1499 aa33.9■■■■□ 3.02
C1orf35-202ENST00000465199 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.87■■■■□ 3.01
C1orf35-202ENST00000465199 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.87■■■■□ 3.01
C1orf35-202ENST00000465199 MLECQ14165 292 aa33.85■■■■□ 3.01
C1orf35-202ENST00000465199 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa33.84■■■■□ 3.01
C1orf35-202ENST00000465199 ABCA6Q8N139 1617 aa33.83■■■■□ 3.01
C1orf35-202ENST00000465199 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.82■■■■□ 3
C1orf35-202ENST00000465199 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.81■■■■□ 3
C1orf35-202ENST00000465199 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
C1orf35-202ENST00000465199 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
C1orf35-202ENST00000465199 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.79■■■■□ 3
C1orf35-202ENST00000465199 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.79■■■■□ 3
C1orf35-202ENST00000465199 ABCC5O15440 1437 aa33.77■■■■□ 3
C1orf35-202ENST00000465199 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.76■■■□□ 2.99
C1orf35-202ENST00000465199 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.75■■■□□ 2.99
C1orf35-202ENST00000465199 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
C1orf35-202ENST00000465199 REREQ9P2R6 1566 aa33.72■■■□□ 2.99
C1orf35-202ENST00000465199 DAPK1P53355 1430 aa33.71■■■□□ 2.99
C1orf35-202ENST00000465199 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
C1orf35-202ENST00000465199 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
C1orf35-202ENST00000465199 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.71■■■□□ 2.99
C1orf35-202ENST00000465199 ATP7AQ04656 1500 aa33.68■■■□□ 2.98
C1orf35-202ENST00000465199 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.66■■■□□ 2.98
C1orf35-202ENST00000465199 PTPRKQ15262 1439 aa33.66■■■□□ 2.98
C1orf35-202ENST00000465199 TSPY4P0CV99 314 aa33.64■■■□□ 2.98
C1orf35-202ENST00000465199 TSPY10P0CW01 314 aa33.64■■■□□ 2.98
C1orf35-202ENST00000465199 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.64■■■□□ 2.98
C1orf35-202ENST00000465199 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.63■■■□□ 2.97
C1orf35-202ENST00000465199 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.63■■■□□ 2.97
C1orf35-202ENST00000465199 AGLP35573 1532 aa33.58■■■□□ 2.97
C1orf35-202ENST00000465199 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.58■■■□□ 2.97
C1orf35-202ENST00000465199 ITGAEP38570 1179 aa33.55■■■□□ 2.96
C1orf35-202ENST00000465199 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.54■■■□□ 2.96
C1orf35-202ENST00000465199 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.51■■■□□ 2.95
C1orf35-202ENST00000465199 ADGRL2O95490 1459 aa33.5■■■□□ 2.95
C1orf35-202ENST00000465199 PLXNC1O60486 1568 aa33.49■■■□□ 2.95
C1orf35-202ENST00000465199 A2MP01023 1474 aa33.49■■■□□ 2.95
C1orf35-202ENST00000465199 NCOA1Q15788 1441 aa33.48■■■□□ 2.95
C1orf35-202ENST00000465199 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
C1orf35-202ENST00000465199 C3P01024 1663 aa33.48■■■□□ 2.95
C1orf35-202ENST00000465199 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
C1orf35-202ENST00000465199 PREX1Q8TCU6 1659 aa33.47■■■□□ 2.95
C1orf35-202ENST00000465199 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.46■■■□□ 2.95
C1orf35-202ENST00000465199 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
C1orf35-202ENST00000465199 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.44■■■□□ 2.94
C1orf35-202ENST00000465199 KIF15Q9NS87 1388 aa33.44■■■□□ 2.94
C1orf35-202ENST00000465199 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.9 ms