RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462392.5

IMP4-210, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene IMP4, Length 1,793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-210ENST00000462392 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.42■■■□□ 2.46
IMP4-210ENST00000462392 ABCC5O15440 1437 aa30.41■■■□□ 2.46
IMP4-210ENST00000462392 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.41■■■□□ 2.46
IMP4-210ENST00000462392 NAIPQ13075 1403 aa30.39■■■□□ 2.46
IMP4-210ENST00000462392 PREX2Q70Z35 1606 aa30.38■■■□□ 2.45
IMP4-210ENST00000462392 AKNAQ7Z591 1439 aa30.35■■■□□ 2.45
IMP4-210ENST00000462392 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.34■■■□□ 2.45
IMP4-210ENST00000462392 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.34■■■□□ 2.45
IMP4-210ENST00000462392 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.34■■■□□ 2.45
IMP4-210ENST00000462392 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.33■■■□□ 2.45
IMP4-210ENST00000462392 ROCK1Q13464 1354 aa30.3■■■□□ 2.44
IMP4-210ENST00000462392 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.29■■■□□ 2.44
IMP4-210ENST00000462392 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.29■■■□□ 2.44
IMP4-210ENST00000462392 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.29■■■□□ 2.44
IMP4-210ENST00000462392 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.28■■■□□ 2.44
IMP4-210ENST00000462392 ASXL2Q76L83 1435 aa30.28■■■□□ 2.44
IMP4-210ENST00000462392 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.27■■■□□ 2.44
IMP4-210ENST00000462392 PLCH2O75038 1416 aa30.25■■■□□ 2.43
IMP4-210ENST00000462392 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.24■■■□□ 2.43
IMP4-210ENST00000462392 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.23■■■□□ 2.43
IMP4-210ENST00000462392 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.23■■■□□ 2.43
IMP4-210ENST00000462392 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.23■■■□□ 2.43
IMP4-210ENST00000462392 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.21■■■□□ 2.43
IMP4-210ENST00000462392 MBD5Q9P267 1494 aa30.21■■■□□ 2.43
IMP4-210ENST00000462392 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.2■■■□□ 2.42
IMP4-210ENST00000462392 MAPKBP1O60336 1514 aa30.18■■■□□ 2.42
IMP4-210ENST00000462392 ADGRL2O95490 1459 aa30.18■■■□□ 2.42
IMP4-210ENST00000462392 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.18■■■□□ 2.42
IMP4-210ENST00000462392 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.18■■■□□ 2.42
IMP4-210ENST00000462392 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.17■■■□□ 2.42
IMP4-210ENST00000462392 NCOA1Q15788 1441 aa30.17■■■□□ 2.42
IMP4-210ENST00000462392 KDM6BO15054 1643 aa30.16■■■□□ 2.42
IMP4-210ENST00000462392 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.15■■■□□ 2.42
IMP4-210ENST00000462392 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.14■■■□□ 2.42
IMP4-210ENST00000462392 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.14■■■□□ 2.42
IMP4-210ENST00000462392 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.14■■■□□ 2.42
IMP4-210ENST00000462392 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.14■■■□□ 2.42
IMP4-210ENST00000462392 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.14■■■□□ 2.42
IMP4-210ENST00000462392 TSPY4P0CV99 314 aa30.13■■■□□ 2.41
IMP4-210ENST00000462392 TSPY10P0CW01 314 aa30.13■■■□□ 2.41
IMP4-210ENST00000462392 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.13■■■□□ 2.41
IMP4-210ENST00000462392 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.13■■■□□ 2.41
IMP4-210ENST00000462392 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.12■■■□□ 2.41
IMP4-210ENST00000462392 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.12■■■□□ 2.41
IMP4-210ENST00000462392 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.05■■■□□ 2.4
IMP4-210ENST00000462392 TRIM52Q96A61 297 aa30.04■■■□□ 2.4
IMP4-210ENST00000462392 ABCC1P33527 1531 aa30.03■■■□□ 2.4
IMP4-210ENST00000462392 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
IMP4-210ENST00000462392 FANCAO15360 1455 aa30■■■□□ 2.39
IMP4-210ENST00000462392 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.98■■■□□ 2.39
IMP4-210ENST00000462392 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.98■■■□□ 2.39
IMP4-210ENST00000462392 KIF15Q9NS87 1388 aa29.97■■■□□ 2.39
IMP4-210ENST00000462392 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.94■■■□□ 2.38
IMP4-210ENST00000462392 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.93■■■□□ 2.38
IMP4-210ENST00000462392 CD109Q6YHK3 1445 aa29.93■■■□□ 2.38
IMP4-210ENST00000462392 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.92■■■□□ 2.38
IMP4-210ENST00000462392 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
IMP4-210ENST00000462392 NEUROD1Q13562 356 aa29.88■■■□□ 2.37
IMP4-210ENST00000462392 ADGRL1O94910 1474 aa29.88■■■□□ 2.37
IMP4-210ENST00000462392 PLXNC1O60486 1568 aa29.87■■■□□ 2.37
IMP4-210ENST00000462392 AFAP1Q8N556 730 aa29.85■■■□□ 2.37
IMP4-210ENST00000462392 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.85■■■□□ 2.37
IMP4-210ENST00000462392 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
IMP4-210ENST00000462392 PZPP20742 1482 aa29.82■■■□□ 2.36
IMP4-210ENST00000462392 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
IMP4-210ENST00000462392 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.8■■■□□ 2.36
IMP4-210ENST00000462392 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.79■■■□□ 2.36
IMP4-210ENST00000462392 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.77■■■□□ 2.36
IMP4-210ENST00000462392 GLI2P10070 1586 aa29.77■■■□□ 2.36
IMP4-210ENST00000462392 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.76■■■□□ 2.36
IMP4-210ENST00000462392 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.76■■■□□ 2.36
IMP4-210ENST00000462392 FOXD1Q16676 465 aa29.76■■■□□ 2.35
IMP4-210ENST00000462392 NUP155O75694 1391 aa29.75■■■□□ 2.35
IMP4-210ENST00000462392 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.74■■■□□ 2.35
IMP4-210ENST00000462392 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.73■■■□□ 2.35
IMP4-210ENST00000462392 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
IMP4-210ENST00000462392 NEO1Q92859 1461 aa29.71■■■□□ 2.35
IMP4-210ENST00000462392 ERBINQ96RT1 1412 aa29.71■■■□□ 2.35
IMP4-210ENST00000462392 ATP7AQ04656 1500 aa29.7■■■□□ 2.35
IMP4-210ENST00000462392 DIP2BQ9P265 1576 aa29.7■■■□□ 2.35
IMP4-210ENST00000462392 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.69■■■□□ 2.34
IMP4-210ENST00000462392 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.69■■■□□ 2.34
IMP4-210ENST00000462392 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.69■■■□□ 2.34
IMP4-210ENST00000462392 TONSLQ96HA7 1378 aa29.67■■■□□ 2.34
IMP4-210ENST00000462392 PKD2Q13563 968 aa29.66■■■□□ 2.34
IMP4-210ENST00000462392 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.65■■■□□ 2.34
IMP4-210ENST00000462392 UNC13BO14795 1591 aa29.65■■■□□ 2.34
IMP4-210ENST00000462392 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.64■■■□□ 2.34
IMP4-210ENST00000462392 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
IMP4-210ENST00000462392 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.61■■■□□ 2.33
IMP4-210ENST00000462392 KDM5CP41229 1560 aa29.6■■■□□ 2.33
IMP4-210ENST00000462392 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
IMP4-210ENST00000462392 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.59■■■□□ 2.33
IMP4-210ENST00000462392 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.58■■■□□ 2.332e-7■■■□□ 17.7
IMP4-210ENST00000462392 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.57■■■□□ 2.32
IMP4-210ENST00000462392 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
IMP4-210ENST00000462392 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.54■■■□□ 2.32
IMP4-210ENST00000462392 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
IMP4-210ENST00000462392 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.53■■■□□ 2.32
IMP4-210ENST00000462392 RAPGEF3O95398 923 aa29.53■■■□□ 2.32
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