RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 PLCH2O75038 1416 aa36.84■■■■□ 3.49
NME4-209ENST00000460297 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
NME4-209ENST00000460297 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.8■■■■□ 3.48
NME4-209ENST00000460297 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.8■■■■□ 3.48
NME4-209ENST00000460297 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
NME4-209ENST00000460297 DIP2BQ9P265 1576 aa36.78■■■■□ 3.48
NME4-209ENST00000460297 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.77■■■■□ 3.48
NME4-209ENST00000460297 GLI2P10070 1586 aa36.76■■■■□ 3.48
NME4-209ENST00000460297 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.75■■■■□ 3.47
NME4-209ENST00000460297 ITGAEP38570 1179 aa36.74■■■■□ 3.47
NME4-209ENST00000460297 CD109Q6YHK3 1445 aa36.72■■■■□ 3.47
NME4-209ENST00000460297 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.71■■■■□ 3.47
NME4-209ENST00000460297 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.67■■■■□ 3.46
NME4-209ENST00000460297 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
NME4-209ENST00000460297 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.66■■■■□ 3.46
NME4-209ENST00000460297 PTPRKQ15262 1439 aa36.66■■■■□ 3.46
NME4-209ENST00000460297 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.65■■■■□ 3.46
NME4-209ENST00000460297 FANCAO15360 1455 aa36.64■■■■□ 3.46
NME4-209ENST00000460297 DAPK1P53355 1430 aa36.61■■■■□ 3.45
NME4-209ENST00000460297 ABCC5O15440 1437 aa36.6■■■■□ 3.45
NME4-209ENST00000460297 MBD5Q9P267 1494 aa36.6■■■■□ 3.45
NME4-209ENST00000460297 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.59■■■■□ 3.45
NME4-209ENST00000460297 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.58■■■■□ 3.45
NME4-209ENST00000460297 ABCC1P33527 1531 aa36.57■■■■□ 3.45
NME4-209ENST00000460297 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.57■■■■□ 3.44
NME4-209ENST00000460297 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.57■■■■□ 3.44
NME4-209ENST00000460297 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.57■■■■□ 3.44
NME4-209ENST00000460297 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.56■■■■□ 3.44
NME4-209ENST00000460297 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.55■■■■□ 3.44
NME4-209ENST00000460297 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.53■■■■□ 3.44
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NME4-209ENST00000460297 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
NME4-209ENST00000460297 AKNAQ7Z591 1439 aa36.49■■■■□ 3.43
NME4-209ENST00000460297 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.48■■■■□ 3.43
NME4-209ENST00000460297 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.47■■■■□ 3.43
NME4-209ENST00000460297 ADGRL1O94910 1474 aa36.47■■■■□ 3.43
NME4-209ENST00000460297 NEO1Q92859 1461 aa36.45■■■■□ 3.43
NME4-209ENST00000460297 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.45■■■■□ 3.42
NME4-209ENST00000460297 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.43■■■■□ 3.42
NME4-209ENST00000460297 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.42■■■■□ 3.42
NME4-209ENST00000460297 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.41■■■■□ 3.42
NME4-209ENST00000460297 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.39■■■■□ 3.42
NME4-209ENST00000460297 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.38■■■■□ 3.41
NME4-209ENST00000460297 ROCK1Q13464 1354 aa36.37■■■■□ 3.41
NME4-209ENST00000460297 HFM1A2PYH4 1435 aa36.36■■■■□ 3.41
NME4-209ENST00000460297 TSPY4P0CV99 314 aa36.36■■■■□ 3.41
NME4-209ENST00000460297 TSPY10P0CW01 314 aa36.36■■■■□ 3.41
NME4-209ENST00000460297 ADGRL2O95490 1459 aa36.35■■■■□ 3.41
NME4-209ENST00000460297 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.35■■■■□ 3.41
NME4-209ENST00000460297 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.34■■■■□ 3.41
NME4-209ENST00000460297 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.34■■■■□ 3.41
NME4-209ENST00000460297 NAIPQ13075 1403 aa36.34■■■■□ 3.41
NME4-209ENST00000460297 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.34■■■■□ 3.41
NME4-209ENST00000460297 AFAP1Q8N556 730 aa36.32■■■■□ 3.4
NME4-209ENST00000460297 NCOA1Q15788 1441 aa36.31■■■■□ 3.4
NME4-209ENST00000460297 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.31■■■■□ 3.4
NME4-209ENST00000460297 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.27■■■■□ 3.4
NME4-209ENST00000460297 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.27■■■■□ 3.4
NME4-209ENST00000460297 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.26■■■■□ 3.4
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NME4-209ENST00000460297 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
NME4-209ENST00000460297 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.21■■■■□ 3.39
NME4-209ENST00000460297 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
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NME4-209ENST00000460297 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.19■■■■□ 3.38
NME4-209ENST00000460297 RAPGEF3O95398 923 aa36.17■■■■□ 3.38
NME4-209ENST00000460297 ATP7AQ04656 1500 aa36.16■■■■□ 3.38
NME4-209ENST00000460297 KIF15Q9NS87 1388 aa36.15■■■■□ 3.38
NME4-209ENST00000460297 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.15■■■■□ 3.38
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NME4-209ENST00000460297 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.09■■■■□ 3.37
NME4-209ENST00000460297 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
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NME4-209ENST00000460297 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.03■■■■□ 3.36
NME4-209ENST00000460297 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.02■■■■□ 3.36
NME4-209ENST00000460297 ABCA6Q8N139 1617 aa35.97■■■■□ 3.35
NME4-209ENST00000460297 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
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NME4-209ENST00000460297 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
NME4-209ENST00000460297 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.91■■■■□ 3.34
NME4-209ENST00000460297 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.91■■■■□ 3.34
NME4-209ENST00000460297 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.89■■■■□ 3.34
NME4-209ENST00000460297 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.34
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NME4-209ENST00000460297 A2MP01023 1474 aa35.87■■■■□ 3.33
NME4-209ENST00000460297 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
NME4-209ENST00000460297 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
NME4-209ENST00000460297 UNC13BO14795 1591 aa35.81■■■■□ 3.32
NME4-209ENST00000460297 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.76■■■■□ 3.32
NME4-209ENST00000460297 PZPP20742 1482 aa35.75■■■■□ 3.31
NME4-209ENST00000460297 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.75■■■■□ 3.31
NME4-209ENST00000460297 DEPDC5O75140 1603 aa35.75■■■■□ 3.31
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