RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460258.5

NOP56-204, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene NOP56, Length 837 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-204ENST00000460258 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.32■■□□□ 1.16
NOP56-204ENST00000460258 HSPA1LP34931 641 aa22.31■■□□□ 1.16
NOP56-204ENST00000460258 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.3■■□□□ 1.16
NOP56-204ENST00000460258 NCOA1Q15788 1441 aa22.27■■□□□ 1.16
NOP56-204ENST00000460258 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.27■■□□□ 1.16
NOP56-204ENST00000460258 HECW1Q76N89 1606 aa22.27■■□□□ 1.16
NOP56-204ENST00000460258 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NOP56-204ENST00000460258 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NOP56-204ENST00000460258 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NOP56-204ENST00000460258 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NOP56-204ENST00000460258 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NOP56-204ENST00000460258 ATP10AO60312 1499 aa22.22■■□□□ 1.15
NOP56-204ENST00000460258 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.21■■□□□ 1.15
NOP56-204ENST00000460258 C3P01024 1663 aa22.18■■□□□ 1.14
NOP56-204ENST00000460258 PIP4K2BP78356 416 aa22.17■■□□□ 1.14
NOP56-204ENST00000460258 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.14■■□□□ 1.14
NOP56-204ENST00000460258 P3H3Q8IVL6 736 aa22.13■■□□□ 1.13
NOP56-204ENST00000460258 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.13■■□□□ 1.13
NOP56-204ENST00000460258 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.11■■□□□ 1.13
NOP56-204ENST00000460258 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.1■■□□□ 1.13
NOP56-204ENST00000460258 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.09■■□□□ 1.13
NOP56-204ENST00000460258 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.134e-11■□□□□ 9.1
NOP56-204ENST00000460258 TOM1O60784 492 aa22.07■■□□□ 1.12
NOP56-204ENST00000460258 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.03■■□□□ 1.12
NOP56-204ENST00000460258 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NOP56-204ENST00000460258 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NOP56-204ENST00000460258 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NOP56-204ENST00000460258 PKD2Q13563 968 aa21.98■■□□□ 1.11
NOP56-204ENST00000460258 PLA2R1Q13018 1463 aa21.93■■□□□ 1.1
NOP56-204ENST00000460258 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.93■■□□□ 1.1
NOP56-204ENST00000460258 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NOP56-204ENST00000460258 PLCH2O75038 1416 aa21.92■■□□□ 1.1
NOP56-204ENST00000460258 REREQ9P2R6 1566 aa21.91■■□□□ 1.1
NOP56-204ENST00000460258 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.91■■□□□ 1.1
NOP56-204ENST00000460258 NPATQ14207 1427 aa21.91■■□□□ 1.1
NOP56-204ENST00000460258 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NOP56-204ENST00000460258 AGLP35573 1532 aa21.9■■□□□ 1.1
NOP56-204ENST00000460258 SAMD9Q5K651 1589 aa21.9■■□□□ 1.1
NOP56-204ENST00000460258 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.89■■□□□ 1.1
NOP56-204ENST00000460258 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
NOP56-204ENST00000460258 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.89■■□□□ 1.09
NOP56-204ENST00000460258 CPS1P31327 1500 aa21.89■■□□□ 1.09
NOP56-204ENST00000460258 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.89■■□□□ 1.09
NOP56-204ENST00000460258 KDM5CP41229 1560 aa21.87■■□□□ 1.09
NOP56-204ENST00000460258 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
NOP56-204ENST00000460258 AFAP1Q8N556 730 aa21.86■■□□□ 1.09
NOP56-204ENST00000460258 ALKQ9UM73 1620 aa21.86■■□□□ 1.09
NOP56-204ENST00000460258 PTPRKQ15262 1439 aa21.86■■□□□ 1.09
NOP56-204ENST00000460258 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.84■■□□□ 1.09
NOP56-204ENST00000460258 ABCA6Q8N139 1617 aa21.84■■□□□ 1.09
NOP56-204ENST00000460258 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.82■■□□□ 1.08
NOP56-204ENST00000460258 MROH2AA6NES4 1674 aa21.82■■□□□ 1.08
NOP56-204ENST00000460258 POTEAQ6S8J7 498 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-204ENST00000460258 PRXQ9BXM0 1461 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-204ENST00000460258 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
NOP56-204ENST00000460258 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.8■■□□□ 1.08
NOP56-204ENST00000460258 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.79■■□□□ 1.08
NOP56-204ENST00000460258 ZMYM3Q14202 1370 aa21.78■■□□□ 1.08
NOP56-204ENST00000460258 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.78■■□□□ 1.08
NOP56-204ENST00000460258 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
NOP56-204ENST00000460258 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.74■■□□□ 1.07
NOP56-204ENST00000460258 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
NOP56-204ENST00000460258 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
NOP56-204ENST00000460258 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.67■■□□□ 1.06
NOP56-204ENST00000460258 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.67■■□□□ 1.06
NOP56-204ENST00000460258 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.66■■□□□ 1.06
NOP56-204ENST00000460258 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
NOP56-204ENST00000460258 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
NOP56-204ENST00000460258 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
NOP56-204ENST00000460258 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.62■■□□□ 1.05
NOP56-204ENST00000460258 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.61■■□□□ 1.05
NOP56-204ENST00000460258 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
NOP56-204ENST00000460258 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NOP56-204ENST00000460258 KIF14Q15058 1648 aa21.58■■□□□ 1.05
NOP56-204ENST00000460258 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.55■■□□□ 1.04
NOP56-204ENST00000460258 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-204ENST00000460258 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-204ENST00000460258 ABCC1P33527 1531 aa21.52■■□□□ 1.04
NOP56-204ENST00000460258 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.52■■□□□ 1.03
NOP56-204ENST00000460258 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-204ENST00000460258 SYNMO15061 1565 aa21.49■■□□□ 1.03
NOP56-204ENST00000460258 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NOP56-204ENST00000460258 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NOP56-204ENST00000460258 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
NOP56-204ENST00000460258 MED14O60244 1454 aa21.45■■□□□ 1.03
NOP56-204ENST00000460258 GGT6Q6P531 493 aa21.44■■□□□ 1.02
NOP56-204ENST00000460258 DEPDC5O75140 1603 aa21.43■■□□□ 1.02
NOP56-204ENST00000460258 IQGAP1P46940 1657 aa21.43■■□□□ 1.02
NOP56-204ENST00000460258 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NOP56-204ENST00000460258 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NOP56-204ENST00000460258 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-204ENST00000460258 PREX2Q70Z35 1606 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-204ENST00000460258 PLXNC1O60486 1568 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-204ENST00000460258 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.39■■□□□ 1.02
NOP56-204ENST00000460258 TNRQ92752 1358 aa21.39■■□□□ 1.02
NOP56-204ENST00000460258 TRIM52Q96A61 297 aa21.39■■□□□ 1.01
NOP56-204ENST00000460258 CLIP1P30622 1438 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-204ENST00000460258 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NOP56-204ENST00000460258 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NOP56-204ENST00000460258 A2MP01023 1474 aa21.35■■□□□ 1.01
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