RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460020.5

PFKL-203, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 5

Gene PFKL, Length 890 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-203ENST00000460020 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.17■■■■□ 3.38
PFKL-203ENST00000460020 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.15■■■■□ 3.38
PFKL-203ENST00000460020 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.13■■■■□ 3.38
PFKL-203ENST00000460020 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.11■■■■□ 3.37
PFKL-203ENST00000460020 TIAM1Q13009 1591 aa36.1■■■■□ 3.37
PFKL-203ENST00000460020 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
PFKL-203ENST00000460020 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.08■■■■□ 3.37
PFKL-203ENST00000460020 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.08■■■■□ 3.37
PFKL-203ENST00000460020 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.06■■■■□ 3.36
PFKL-203ENST00000460020 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.04■■■■□ 3.36
PFKL-203ENST00000460020 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
PFKL-203ENST00000460020 ABCC1P33527 1531 aa36■■■■□ 3.35
PFKL-203ENST00000460020 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.98■■■■□ 3.35
PFKL-203ENST00000460020 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
PFKL-203ENST00000460020 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.97■■■■□ 3.35
PFKL-203ENST00000460020 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.97■■■■□ 3.35
PFKL-203ENST00000460020 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.95■■■■□ 3.35
PFKL-203ENST00000460020 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.95■■■■□ 3.35
PFKL-203ENST00000460020 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.95■■■■□ 3.35
PFKL-203ENST00000460020 MAP3K1Q13233 1512 aa35.94■■■■□ 3.34
PFKL-203ENST00000460020 KDM5CP41229 1560 aa35.93■■■■□ 3.34
PFKL-203ENST00000460020 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.92■■■■□ 3.34
PFKL-203ENST00000460020 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.91■■■■□ 3.34
PFKL-203ENST00000460020 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.91■■■■□ 3.34
PFKL-203ENST00000460020 NCOA2Q15596 1464 aa35.89■■■■□ 3.34
PFKL-203ENST00000460020 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
PFKL-203ENST00000460020 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
PFKL-203ENST00000460020 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.85■■■■□ 3.33
PFKL-203ENST00000460020 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.85■■■■□ 3.33
PFKL-203ENST00000460020 AFAP1Q8N556 730 aa35.85■■■■□ 3.33
PFKL-203ENST00000460020 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.84■■■■□ 3.33
PFKL-203ENST00000460020 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.81■■■■□ 3.32
PFKL-203ENST00000460020 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.8■■■■□ 3.32
PFKL-203ENST00000460020 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.8■■■■□ 3.32
PFKL-203ENST00000460020 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
PFKL-203ENST00000460020 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.77■■■■□ 3.32
PFKL-203ENST00000460020 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.76■■■■□ 3.32
PFKL-203ENST00000460020 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.76■■■■□ 3.32
PFKL-203ENST00000460020 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.31
PFKL-203ENST00000460020 ATP10AO60312 1499 aa35.75■■■■□ 3.31
PFKL-203ENST00000460020 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.74■■■■□ 3.31
PFKL-203ENST00000460020 ABCA6Q8N139 1617 aa35.74■■■■□ 3.31
PFKL-203ENST00000460020 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.73■■■■□ 3.31
PFKL-203ENST00000460020 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.72■■■■□ 3.31
PFKL-203ENST00000460020 APLP2Q06481 763 aa35.72■■■■□ 3.31
PFKL-203ENST00000460020 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.71■■■■□ 3.319e-8■■□□□ 13.3
PFKL-203ENST00000460020 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.71■■■■□ 3.31
PFKL-203ENST00000460020 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
PFKL-203ENST00000460020 MADDQ8WXG6 1647 aa35.67■■■■□ 3.3
PFKL-203ENST00000460020 REREQ9P2R6 1566 aa35.65■■■■□ 3.3
PFKL-203ENST00000460020 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.64■■■■□ 3.3
PFKL-203ENST00000460020 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
PFKL-203ENST00000460020 MBD5Q9P267 1494 aa35.62■■■■□ 3.29
PFKL-203ENST00000460020 ATP7AQ04656 1500 aa35.6■■■■□ 3.29
PFKL-203ENST00000460020 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
PFKL-203ENST00000460020 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
PFKL-203ENST00000460020 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.57■■■■□ 3.28
PFKL-203ENST00000460020 PTPRMP28827 1452 aa35.54■■■■□ 3.28
PFKL-203ENST00000460020 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.54■■■■□ 3.28
PFKL-203ENST00000460020 MLECQ14165 292 aa35.52■■■■□ 3.28
PFKL-203ENST00000460020 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.51■■■■□ 3.28
PFKL-203ENST00000460020 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.51■■■■□ 3.27
PFKL-203ENST00000460020 MIA2Q96PC5 1412 aa35.5■■■■□ 3.27
PFKL-203ENST00000460020 AGLP35573 1532 aa35.5■■■■□ 3.27
PFKL-203ENST00000460020 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.46■■■■□ 3.27
PFKL-203ENST00000460020 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.43■■■■□ 3.26
PFKL-203ENST00000460020 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.43■■■■□ 3.26
PFKL-203ENST00000460020 PLXNC1O60486 1568 aa35.42■■■■□ 3.26
PFKL-203ENST00000460020 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.4■■■■□ 3.26
PFKL-203ENST00000460020 A2MP01023 1474 aa35.4■■■■□ 3.26
PFKL-203ENST00000460020 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.34■■■■□ 3.25
PFKL-203ENST00000460020 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.33■■■■□ 3.25
PFKL-203ENST00000460020 TSPY4P0CV99 314 aa35.29■■■■□ 3.24
PFKL-203ENST00000460020 TSPY10P0CW01 314 aa35.29■■■■□ 3.24
PFKL-203ENST00000460020 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
PFKL-203ENST00000460020 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.28■■■■□ 3.24
PFKL-203ENST00000460020 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.25■■■■□ 3.23
PFKL-203ENST00000460020 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
PFKL-203ENST00000460020 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
PFKL-203ENST00000460020 C3P01024 1663 aa35.2■■■■□ 3.23
PFKL-203ENST00000460020 ABCC5O15440 1437 aa35.19■■■■□ 3.22
PFKL-203ENST00000460020 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.18■■■■□ 3.22
PFKL-203ENST00000460020 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
PFKL-203ENST00000460020 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.17■■■■□ 3.22
PFKL-203ENST00000460020 MROH2AA6NES4 1674 aa35.17■■■■□ 3.22
PFKL-203ENST00000460020 DAPK1P53355 1430 aa35.16■■■■□ 3.22
PFKL-203ENST00000460020 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
PFKL-203ENST00000460020 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
PFKL-203ENST00000460020 GGT6Q6P531 493 aa35.12■■■■□ 3.21
PFKL-203ENST00000460020 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.1■■■■□ 3.21
PFKL-203ENST00000460020 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
PFKL-203ENST00000460020 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.08■■■■□ 3.21
PFKL-203ENST00000460020 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
PFKL-203ENST00000460020 KIF3BO15066 747 aa35.07■■■■□ 3.2
PFKL-203ENST00000460020 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
PFKL-203ENST00000460020 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.05■■■■□ 3.2
PFKL-203ENST00000460020 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
PFKL-203ENST00000460020 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.03■■■■□ 3.2
PFKL-203ENST00000460020 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
PFKL-203ENST00000460020 ZMYM3Q14202 1370 aa35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.6 ms