RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.85□□□□□ -0.67
RABGGTB-203ENST00000459697 DOK7Q18PE1 504 aa10.84□□□□□ -0.67
RABGGTB-203ENST00000459697 MICALL2Q8IY33 904 aa10.84□□□□□ -0.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.83□□□□□ -0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.83□□□□□ -0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 POTEB3A0JP26 581 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 MMRN1Q13201 1228 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 POTEBQ6S5H4 581 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 RIMBP2O15034 1052 aa10.79□□□□□ -0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-203ENST00000459697 NLRP6P59044 892 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM92Q6UXU6 159 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-203ENST00000459697 STK24Q9Y6E0 443 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-203ENST00000459697 MYO15BQ96JP2 1530 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-203ENST00000459697 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-203ENST00000459697 ERBB3P21860 1342 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-203ENST00000459697 NESP48681 1621 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-203ENST00000459697 SCRIBQ14160 1630 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-203ENST00000459697 STK25O00506 426 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-203ENST00000459697 SMARCA2P51531 1590 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXO22Q8NEZ5 403 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-203ENST00000459697 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-203ENST00000459697 CYB5RLQ6IPT4 315 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGGTB-203ENST00000459697 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
RABGGTB-203ENST00000459697 MFRPQ9BY79 579 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGEF11O15085 1522 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-203ENST00000459697 PKD2Q13563 968 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-203ENST00000459697 GPR153Q6NV75 609 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-203ENST00000459697 RGL2O15211 777 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ARSIQ5FYB1 569 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGGTB-203ENST00000459697 C2orf72A6NCS6 295 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-203ENST00000459697 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-203ENST00000459697 KIF3CO14782 793 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-203ENST00000459697 LMTK3Q96Q04 1460 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-203ENST00000459697 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.54□□□□□ -0.727e-8■■□□□ 12.7
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
RABGGTB-203ENST00000459697 TMC2Q8TDI7 906 aa10.52□□□□□ -0.73
RABGGTB-203ENST00000459697 SOCS7O14512 581 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP1R37O75864 691 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGGTB-203ENST00000459697 NCAPD3P42695 1498 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGGTB-203ENST00000459697 ARAP1Q96P48 1450 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGGTB-203ENST00000459697 NUDT7P0C024 238 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGGTB-203ENST00000459697 MYT1LQ9UL68 1186 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC34A2O95436 690 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.46□□□□□ -0.73
RABGGTB-203ENST00000459697 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-203ENST00000459697 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-203ENST00000459697 PTGER2P43116 358 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-203ENST00000459697 HS6ST3Q8IZP7 471 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXO41Q8TF61 875 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-203ENST00000459697 LHX6Q9UPM6 363 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-203ENST00000459697 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR62O43379 1518 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-203ENST00000459697 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.746e-9■■□□□ 13.5
RABGGTB-203ENST00000459697 PBX2P40425 430 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGGTB-203ENST00000459697 ILDR2Q71H61 639 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGGTB-203ENST00000459697 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-203ENST00000459697 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXK1P85037 733 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-203ENST00000459697 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-203ENST00000459697 PLPP6Q8IY26 295 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-203ENST00000459697 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-203ENST00000459697 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-203ENST00000459697 POTEEQ6S8J3 1075 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ERCC6L2Q5T890 1561 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-203ENST00000459697 HMGXB3Q12766 1538 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-203ENST00000459697 DSG2Q14126 1118 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGAP33O14559 1287 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-203ENST00000459697 TBC1D12O60347 775 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-203ENST00000459697 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-203ENST00000459697 DISP3Q9P2K9 1392 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-203ENST00000459697 ADGRD1Q6QNK2 874 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-203ENST00000459697 HECW2Q9P2P5 1572 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-203ENST00000459697 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGGTB-203ENST00000459697 PSEN2P49810 448 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGGTB-203ENST00000459697 TK2O00142 265 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-203ENST00000459697 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-203ENST00000459697 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-203ENST00000459697 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-203ENST00000459697 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-203ENST00000459697 OXER1Q8TDS5 423 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-203ENST00000459697 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-203ENST00000459697 HCSTQ9UBK5 93 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms