RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HDLBP-222	ENST00000449504	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDLBP-222	ENST00000449504	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDLBP-222	ENST00000449504	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDLBP-222	ENST00000449504	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDLBP-222	ENST00000449504	STRC	Q7RTU9	1775 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HDLBP-222	ENST00000449504	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HDLBP-222	ENST00000449504	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDLBP-222	ENST00000449504	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDLBP-222	ENST00000449504	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDLBP-222	ENST00000449504	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDLBP-222	ENST00000449504	PTPRT	O14522	1441 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDLBP-222	ENST00000449504	HECW1	Q76N89	1606 aa		12.33	□□□□□ -0.43
HDLBP-222	ENST00000449504	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HDLBP-222	ENST00000449504	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HDLBP-222	ENST00000449504	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
HDLBP-222	ENST00000449504	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HDLBP-222	ENST00000449504	ATP10A	O60312	1499 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HDLBP-222	ENST00000449504	PRX	Q9BXM0	1461 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HDLBP-222	ENST00000449504	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HDLBP-222	ENST00000449504	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	12.31	□□□□□ -0.44	3e-6	■■■■■ 29.2
HDLBP-222	ENST00000449504	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HDLBP-222	ENST00000449504	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HDLBP-222	ENST00000449504	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
HDLBP-222	ENST00000449504	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
HDLBP-222	ENST00000449504	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		12.27	□□□□□ -0.45
HDLBP-222	ENST00000449504	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		12.26	□□□□□ -0.45
HDLBP-222	ENST00000449504	SAMD9	Q5K651	1589 aa		12.26	□□□□□ -0.45
HDLBP-222	ENST00000449504	AFAP1	Q8N556	730 aa		12.25	□□□□□ -0.45
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	12.25	□□□□□ -0.45
HDLBP-222	ENST00000449504	PLCH2	O75038	1416 aa		12.24	□□□□□ -0.45
HDLBP-222	ENST00000449504	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		12.24	□□□□□ -0.45
HDLBP-222	ENST00000449504	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
HDLBP-222	ENST00000449504	NCOA1	Q15788	1441 aa		12.22	□□□□□ -0.45
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		12.22	□□□□□ -0.45
HDLBP-222	ENST00000449504	HSPA1L	P34931	641 aa		12.22	□□□□□ -0.45
HDLBP-222	ENST00000449504	PIP4K2B	P78356	416 aa		12.22	□□□□□ -0.45
HDLBP-222	ENST00000449504	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
HDLBP-222	ENST00000449504	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		12.19	□□□□□ -0.46
HDLBP-222	ENST00000449504	C3	P01024	1663 aa		12.19	□□□□□ -0.46
HDLBP-222	ENST00000449504	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
HDLBP-222	ENST00000449504	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		12.18	□□□□□ -0.46
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		12.17	□□□□□ -0.46
HDLBP-222	ENST00000449504	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
HDLBP-222	ENST00000449504	TOM1	O60784	492 aa		12.14	□□□□□ -0.47
HDLBP-222	ENST00000449504	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		12.13	□□□□□ -0.47
HDLBP-222	ENST00000449504	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		12.13	□□□□□ -0.47
HDLBP-222	ENST00000449504	PKD2	Q13563	968 aa		12.13	□□□□□ -0.47
HDLBP-222	ENST00000449504	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
HDLBP-222	ENST00000449504	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		12.11	□□□□□ -0.47
HDLBP-222	ENST00000449504	ZMYM3	Q14202	1370 aa		12.11	□□□□□ -0.47
HDLBP-222	ENST00000449504	KDM5C	P41229	1560 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDLBP-222	ENST00000449504	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDLBP-222	ENST00000449504	ABCA6	Q8N139	1617 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDLBP-222	ENST00000449504	AGL	P35573	1532 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDLBP-222	ENST00000449504	RERE	Q9P2R6	1566 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-222	ENST00000449504	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-222	ENST00000449504	NPAT	Q14207	1427 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-222	ENST00000449504	KIF14	Q15058	1648 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-222	ENST00000449504	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDLBP-222	ENST00000449504	PLA2R1	Q13018	1463 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HDLBP-222	ENST00000449504	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HDLBP-222	ENST00000449504	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HDLBP-222	ENST00000449504	GGT6	Q6P531	493 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HDLBP-222	ENST00000449504	CLIP1	P30622	1438 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HDLBP-222	ENST00000449504	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	PTPRK	Q15262	1439 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	FMN1	Q68DA7	1419 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	CPS1	P31327	1500 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	MROH2A	A6NES4	1674 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	11.99	□□□□□ -0.49	1e-10	■□□□□ 10.4
HDLBP-222	ENST00000449504	ABCC1	P33527	1531 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-222	ENST00000449504	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		11.96	□□□□□ -0.5
HDLBP-222	ENST00000449504	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-222	ENST00000449504	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-222	ENST00000449504	EEA1	Q15075	1411 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDLBP-222	ENST00000449504	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDLBP-222	ENST00000449504	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HDLBP-222	ENST00000449504	PREX2	Q70Z35	1606 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDLBP-222	ENST00000449504	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5	2e-7	■□□□□ 8.8
HDLBP-222	ENST00000449504	POTEA	Q6S8J7	498 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDLBP-222	ENST00000449504	A2M	P01023	1474 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDLBP-222	ENST00000449504	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDLBP-222	ENST00000449504	ALK	Q9UM73	1620 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDLBP-222	ENST00000449504	TNR	Q92752	1358 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDLBP-222	ENST00000449504	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HDLBP-222	ENST00000449504	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDLBP-222	ENST00000449504	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		11.9	□□□□□ -0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms