RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445811.5

PRPF31-205, Transcript of pre-mRNA processing factor 31, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF31, Length 928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31-205ENST00000445811 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
PRPF31-205ENST00000445811 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
PRPF31-205ENST00000445811 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.11■■■□□ 2.41
PRPF31-205ENST00000445811 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.11■■■□□ 2.41
PRPF31-205ENST00000445811 CLIP1P30622 1438 aa30.1■■■□□ 2.41
PRPF31-205ENST00000445811 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.1■■■□□ 2.41
PRPF31-205ENST00000445811 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.08■■■□□ 2.41
PRPF31-205ENST00000445811 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.06■■■□□ 2.4
PRPF31-205ENST00000445811 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.06■■■□□ 2.4
PRPF31-205ENST00000445811 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.05■■■□□ 2.4
PRPF31-205ENST00000445811 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.05■■■□□ 2.4
PRPF31-205ENST00000445811 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.03■■■□□ 2.4
PRPF31-205ENST00000445811 PREX2Q70Z35 1606 aa30.01■■■□□ 2.39
PRPF31-205ENST00000445811 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.01■■■□□ 2.39
PRPF31-205ENST00000445811 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.98■■■□□ 2.39
PRPF31-205ENST00000445811 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.96■■■□□ 2.39
PRPF31-205ENST00000445811 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.96■■■□□ 2.39
PRPF31-205ENST00000445811 KDM5CP41229 1560 aa29.95■■■□□ 2.39
PRPF31-205ENST00000445811 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.92■■■□□ 2.38
PRPF31-205ENST00000445811 ATP10AO60312 1499 aa29.92■■■□□ 2.38
PRPF31-205ENST00000445811 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.91■■■□□ 2.38
PRPF31-205ENST00000445811 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
PRPF31-205ENST00000445811 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.89■■■□□ 2.38
PRPF31-205ENST00000445811 ABCC1P33527 1531 aa29.89■■■□□ 2.38
PRPF31-205ENST00000445811 MLECQ14165 292 aa29.87■■■□□ 2.37
PRPF31-205ENST00000445811 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.86■■■□□ 2.37
PRPF31-205ENST00000445811 ABCA6Q8N139 1617 aa29.85■■■□□ 2.37
PRPF31-205ENST00000445811 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.85■■■□□ 2.37
PRPF31-205ENST00000445811 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.84■■■□□ 2.37
PRPF31-205ENST00000445811 AFAP1Q8N556 730 aa29.83■■■□□ 2.37
PRPF31-205ENST00000445811 REREQ9P2R6 1566 aa29.79■■■□□ 2.36
PRPF31-205ENST00000445811 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.79■■■□□ 2.36
PRPF31-205ENST00000445811 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.78■■■□□ 2.36
PRPF31-205ENST00000445811 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.77■■■□□ 2.36
PRPF31-205ENST00000445811 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.77■■■□□ 2.36
PRPF31-205ENST00000445811 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.76■■■□□ 2.35
PRPF31-205ENST00000445811 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.72■■■□□ 2.35
PRPF31-205ENST00000445811 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.71■■■□□ 2.35
PRPF31-205ENST00000445811 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
PRPF31-205ENST00000445811 HSPA2P54652 639 aa29.67■■■□□ 2.34
PRPF31-205ENST00000445811 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
PRPF31-205ENST00000445811 AGLP35573 1532 aa29.66■■■□□ 2.34
PRPF31-205ENST00000445811 CEP162Q5TB80 1403 aa29.64■■■□□ 2.34
PRPF31-205ENST00000445811 C3P01024 1663 aa29.64■■■□□ 2.34
PRPF31-205ENST00000445811 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.64■■■□□ 2.33
PRPF31-205ENST00000445811 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.62■■■□□ 2.33
PRPF31-205ENST00000445811 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
PRPF31-205ENST00000445811 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.6■■■□□ 2.33
PRPF31-205ENST00000445811 TIAM1Q13009 1591 aa29.6■■■□□ 2.33
PRPF31-205ENST00000445811 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
PRPF31-205ENST00000445811 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
PRPF31-205ENST00000445811 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.57■■■□□ 2.32
PRPF31-205ENST00000445811 ATP7AQ04656 1500 aa29.56■■■□□ 2.32
PRPF31-205ENST00000445811 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.32
PRPF31-205ENST00000445811 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
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PRPF31-205ENST00000445811 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.54■■■□□ 2.32
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PRPF31-205ENST00000445811 MROH2AA6NES4 1674 aa29.5■■■□□ 2.31
PRPF31-205ENST00000445811 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.49■■■□□ 2.31
PRPF31-205ENST00000445811 FBXO41Q8TF61 875 aa29.49■■■□□ 2.31
PRPF31-205ENST00000445811 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
PRPF31-205ENST00000445811 PLXNC1O60486 1568 aa29.47■■■□□ 2.31
PRPF31-205ENST00000445811 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.47■■■□□ 2.31
PRPF31-205ENST00000445811 STRCQ7RTU9 1775 aa29.47■■■□□ 2.31
PRPF31-205ENST00000445811 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.45■■■□□ 2.31
PRPF31-205ENST00000445811 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
PRPF31-205ENST00000445811 A2MP01023 1474 aa29.42■■■□□ 2.3
PRPF31-205ENST00000445811 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
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PRPF31-205ENST00000445811 MBD5Q9P267 1494 aa29.38■■■□□ 2.29
PRPF31-205ENST00000445811 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.33■■■□□ 2.29
PRPF31-205ENST00000445811 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.32■■■□□ 2.28
PRPF31-205ENST00000445811 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.31■■■□□ 2.28
PRPF31-205ENST00000445811 NPATQ14207 1427 aa29.29■■■□□ 2.28
PRPF31-205ENST00000445811 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.29■■■□□ 2.28
PRPF31-205ENST00000445811 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.28■■■□□ 2.28
PRPF31-205ENST00000445811 ZMYM3Q14202 1370 aa29.28■■■□□ 2.28
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PRPF31-205ENST00000445811 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
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PRPF31-205ENST00000445811 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.25■■■□□ 2.27
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PRPF31-205ENST00000445811 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.25■■■□□ 2.27
PRPF31-205ENST00000445811 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.22■■■□□ 2.27
PRPF31-205ENST00000445811 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.22■■■□□ 2.27
PRPF31-205ENST00000445811 NCOA1Q15788 1441 aa29.2■■■□□ 2.27
PRPF31-205ENST00000445811 PTPRTO14522 1441 aa29.2■■■□□ 2.26
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PRPF31-205ENST00000445811 PTPRKQ15262 1439 aa29.18■■■□□ 2.26
PRPF31-205ENST00000445811 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
PRPF31-205ENST00000445811 MAP3K1Q13233 1512 aa29.16■■■□□ 2.26
PRPF31-205ENST00000445811 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.13■■■□□ 2.25
PRPF31-205ENST00000445811 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.13■■■□□ 2.25
PRPF31-205ENST00000445811 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.11■■■□□ 2.25
PRPF31-205ENST00000445811 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.1■■■□□ 2.25
PRPF31-205ENST00000445811 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.1■■■□□ 2.25
PRPF31-205ENST00000445811 KIF3BO15066 747 aa29.09■■■□□ 2.25
PRPF31-205ENST00000445811 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
PRPF31-205ENST00000445811 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.06■■■□□ 2.24
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