RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445482.2

VGF-202, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VGF, Length 2,477 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-202ENST00000445482 ANP32CO43423 234 aa30.06■■■□□ 2.4
VGF-202ENST00000445482 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.04■■■□□ 2.4
VGF-202ENST00000445482 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
VGF-202ENST00000445482 CEP170Q5SW79 1584 aa30.02■■■□□ 2.4
VGF-202ENST00000445482 AKNAQ7Z591 1439 aa30.01■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 DAPK1P53355 1430 aa30■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 PLB1Q6P1J6 1458 aa30■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 SYNJ2O15056 1496 aa29.98■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 ABCC5O15440 1437 aa29.96■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
VGF-202ENST00000445482 JPH4Q96JJ6 628 aa29.94■■■□□ 2.38
VGF-202ENST00000445482 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
VGF-202ENST00000445482 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
VGF-202ENST00000445482 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
VGF-202ENST00000445482 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.37
VGF-202ENST00000445482 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.88■■■□□ 2.37
VGF-202ENST00000445482 ROCK1Q13464 1354 aa29.86■■■□□ 2.37
VGF-202ENST00000445482 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
VGF-202ENST00000445482 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.84■■■□□ 2.37
VGF-202ENST00000445482 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
VGF-202ENST00000445482 KIF14Q15058 1648 aa29.83■■■□□ 2.37
VGF-202ENST00000445482 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.82■■■□□ 2.36
VGF-202ENST00000445482 NUP160Q12769 1436 aa29.8■■■□□ 2.36
VGF-202ENST00000445482 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
VGF-202ENST00000445482 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.77■■■□□ 2.36
VGF-202ENST00000445482 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.77■■■□□ 2.36
VGF-202ENST00000445482 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.76■■■□□ 2.36
VGF-202ENST00000445482 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.73■■■□□ 2.35
VGF-202ENST00000445482 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.71■■■□□ 2.35
VGF-202ENST00000445482 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.7■■■□□ 2.35
VGF-202ENST00000445482 NCOA1Q15788 1441 aa29.7■■■□□ 2.34
VGF-202ENST00000445482 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
VGF-202ENST00000445482 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
VGF-202ENST00000445482 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.66■■■□□ 2.34
VGF-202ENST00000445482 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.64■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 ATP10BO94823 1461 aa29.63■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 PZPP20742 1482 aa29.63■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.63■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.62■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 ABCA8O94911 1581 aa29.62■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.59■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.58■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 PKD2Q13563 968 aa29.57■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.57■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 ADGRL2O95490 1459 aa29.54■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 MSH5O43196 834 aa29.54■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.54■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.53■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.52■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 PTPRGP23470 1445 aa29.52■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.51■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 CCDC7Q96M83 1385 aa29.51■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.5■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.5■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 TSPY4P0CV99 314 aa29.49■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 TSPY10P0CW01 314 aa29.49■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.49■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 NUP155O75694 1391 aa29.46■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 CCDC184Q52MB2 194 aa29.46■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.44■■■□□ 2.3
VGF-202ENST00000445482 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.43■■■□□ 2.3
VGF-202ENST00000445482 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.41■■■□□ 2.3
VGF-202ENST00000445482 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.4■■■□□ 2.3
VGF-202ENST00000445482 CHD1O14646 1710 aa29.4■■■□□ 2.3
VGF-202ENST00000445482 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.39■■■□□ 2.3
VGF-202ENST00000445482 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
VGF-202ENST00000445482 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
VGF-202ENST00000445482 KIF15Q9NS87 1388 aa29.37■■■□□ 2.29
VGF-202ENST00000445482 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.36■■■□□ 2.29
VGF-202ENST00000445482 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.35■■■□□ 2.29
VGF-202ENST00000445482 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.33■■■□□ 2.29
VGF-202ENST00000445482 MBD5Q9P267 1494 aa29.33■■■□□ 2.29
VGF-202ENST00000445482 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.31■■■□□ 2.28
VGF-202ENST00000445482 USP47Q96K76 1375 aa29.31■■■□□ 2.28
VGF-202ENST00000445482 MRS2Q9HD23 443 aa29.3■■■□□ 2.28
VGF-202ENST00000445482 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.3■■■□□ 2.28
VGF-202ENST00000445482 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.29■■■□□ 2.28
VGF-202ENST00000445482 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.25■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.25■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.24■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 PREX2Q70Z35 1606 aa29.24■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.22■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.21■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.2■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.2■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.2■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.2■■■□□ 2.26
VGF-202ENST00000445482 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.2■■■□□ 2.26
VGF-202ENST00000445482 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.19■■■□□ 2.26
VGF-202ENST00000445482 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.18■■■□□ 2.26
VGF-202ENST00000445482 KDM5CP41229 1560 aa29.16■■■□□ 2.26
VGF-202ENST00000445482 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.15■■■□□ 2.26
VGF-202ENST00000445482 SHROOM2Q13796 1616 aa29.15■■■□□ 2.26
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