RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.53■■□□□ 1.52
HERC3-206ENST00000431413 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.52■■□□□ 1.52
HERC3-206ENST00000431413 PTPRMP28827 1452 aa24.51■■□□□ 1.51
HERC3-206ENST00000431413 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
HERC3-206ENST00000431413 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.5■■□□□ 1.51
HERC3-206ENST00000431413 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.5■■□□□ 1.51
HERC3-206ENST00000431413 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.5■■□□□ 1.51
HERC3-206ENST00000431413 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.48■■□□□ 1.51
HERC3-206ENST00000431413 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.48■■□□□ 1.51
HERC3-206ENST00000431413 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.45■■□□□ 1.5
HERC3-206ENST00000431413 MADDQ8WXG6 1647 aa24.43■■□□□ 1.5
HERC3-206ENST00000431413 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.42■■□□□ 1.5
HERC3-206ENST00000431413 ATP10AO60312 1499 aa24.42■■□□□ 1.5
HERC3-206ENST00000431413 AFAP1Q8N556 730 aa24.4■■□□□ 1.5
HERC3-206ENST00000431413 MLECQ14165 292 aa24.39■■□□□ 1.49
HERC3-206ENST00000431413 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.38■■□□□ 1.49
HERC3-206ENST00000431413 PREX2Q70Z35 1606 aa24.35■■□□□ 1.49
HERC3-206ENST00000431413 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.35■■□□□ 1.49
HERC3-206ENST00000431413 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
HERC3-206ENST00000431413 KDM5CP41229 1560 aa24.34■■□□□ 1.49
HERC3-206ENST00000431413 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.31■■□□□ 1.48
HERC3-206ENST00000431413 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
HERC3-206ENST00000431413 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.3■■□□□ 1.48
HERC3-206ENST00000431413 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.3■■□□□ 1.48
HERC3-206ENST00000431413 ABCC1P33527 1531 aa24.3■■□□□ 1.48
HERC3-206ENST00000431413 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.29■■□□□ 1.48
HERC3-206ENST00000431413 CEP162Q5TB80 1403 aa24.28■■□□□ 1.48
HERC3-206ENST00000431413 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.27■■□□□ 1.48
HERC3-206ENST00000431413 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.27■■□□□ 1.48
HERC3-206ENST00000431413 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.27■■□□□ 1.48
HERC3-206ENST00000431413 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.26■■□□□ 1.47
HERC3-206ENST00000431413 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
HERC3-206ENST00000431413 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
HERC3-206ENST00000431413 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.24■■□□□ 1.47
HERC3-206ENST00000431413 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.24■■□□□ 1.47
HERC3-206ENST00000431413 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.23■■□□□ 1.47
HERC3-206ENST00000431413 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.23■■□□□ 1.47
HERC3-206ENST00000431413 REREQ9P2R6 1566 aa24.22■■□□□ 1.47
HERC3-206ENST00000431413 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.21■■□□□ 1.47
HERC3-206ENST00000431413 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
HERC3-206ENST00000431413 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
HERC3-206ENST00000431413 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
HERC3-206ENST00000431413 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.18■■□□□ 1.46
HERC3-206ENST00000431413 ABCA6Q8N139 1617 aa24.18■■□□□ 1.46
HERC3-206ENST00000431413 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HERC3-206ENST00000431413 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.17■■□□□ 1.46
HERC3-206ENST00000431413 AGLP35573 1532 aa24.16■■□□□ 1.46
HERC3-206ENST00000431413 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.16■■□□□ 1.46
HERC3-206ENST00000431413 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.16■■□□□ 1.46
HERC3-206ENST00000431413 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
HERC3-206ENST00000431413 HSPA2P54652 639 aa24.14■■□□□ 1.45
HERC3-206ENST00000431413 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.13■■□□□ 1.45
HERC3-206ENST00000431413 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.1■■□□□ 1.45
HERC3-206ENST00000431413 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.07■■□□□ 1.44
HERC3-206ENST00000431413 TIAM1Q13009 1591 aa24.07■■□□□ 1.44
HERC3-206ENST00000431413 ATP7AQ04656 1500 aa24.06■■□□□ 1.44
HERC3-206ENST00000431413 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HERC3-206ENST00000431413 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.04■■□□□ 1.44
HERC3-206ENST00000431413 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.03■■□□□ 1.44
HERC3-206ENST00000431413 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.03■■□□□ 1.44
HERC3-206ENST00000431413 NCOA2Q15596 1464 aa24.01■■□□□ 1.43
HERC3-206ENST00000431413 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
HERC3-206ENST00000431413 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
HERC3-206ENST00000431413 A2MP01023 1474 aa24■■□□□ 1.43
HERC3-206ENST00000431413 RSPH4AQ5TD94 716 aa24■■□□□ 1.43
HERC3-206ENST00000431413 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
HERC3-206ENST00000431413 FBXO41Q8TF61 875 aa23.99■■□□□ 1.43
HERC3-206ENST00000431413 MBD5Q9P267 1494 aa23.99■■□□□ 1.43
HERC3-206ENST00000431413 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.97■■□□□ 1.43
HERC3-206ENST00000431413 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.97■■□□□ 1.43
HERC3-206ENST00000431413 C3P01024 1663 aa23.96■■□□□ 1.43
HERC3-206ENST00000431413 GGT6Q6P531 493 aa23.95■■□□□ 1.42
HERC3-206ENST00000431413 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.95■■□□□ 1.42
HERC3-206ENST00000431413 PLXNC1O60486 1568 aa23.95■■□□□ 1.42
HERC3-206ENST00000431413 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.94■■□□□ 1.42
HERC3-206ENST00000431413 ZMYM3Q14202 1370 aa23.93■■□□□ 1.42
HERC3-206ENST00000431413 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.92■■□□□ 1.42
HERC3-206ENST00000431413 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.92■■□□□ 1.42
HERC3-206ENST00000431413 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.92■■□□□ 1.42
HERC3-206ENST00000431413 NPATQ14207 1427 aa23.91■■□□□ 1.42
HERC3-206ENST00000431413 MAP3K1Q13233 1512 aa23.9■■□□□ 1.42
HERC3-206ENST00000431413 TSPY4P0CV99 314 aa23.9■■□□□ 1.42
HERC3-206ENST00000431413 TSPY10P0CW01 314 aa23.9■■□□□ 1.42
HERC3-206ENST00000431413 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
HERC3-206ENST00000431413 MROH2AA6NES4 1674 aa23.89■■□□□ 1.42
HERC3-206ENST00000431413 APLP2Q06481 763 aa23.88■■□□□ 1.41
HERC3-206ENST00000431413 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
HERC3-206ENST00000431413 KIF3BO15066 747 aa23.83■■□□□ 1.41
HERC3-206ENST00000431413 CERKQ8TCT0 537 aa23.83■■□□□ 1.41
HERC3-206ENST00000431413 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.4
HERC3-206ENST00000431413 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.82■■□□□ 1.4
HERC3-206ENST00000431413 MIA2Q96PC5 1412 aa23.8■■□□□ 1.4
HERC3-206ENST00000431413 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.79■■□□□ 1.4
HERC3-206ENST00000431413 STRCQ7RTU9 1775 aa23.79■■□□□ 1.4
HERC3-206ENST00000431413 PTPRTO14522 1441 aa23.78■■□□□ 1.4
HERC3-206ENST00000431413 PTPRKQ15262 1439 aa23.78■■□□□ 1.4
HERC3-206ENST00000431413 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.75■■□□□ 1.39
HERC3-206ENST00000431413 NCOA1Q15788 1441 aa23.75■■□□□ 1.39
HERC3-206ENST00000431413 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.74■■□□□ 1.39
HERC3-206ENST00000431413 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.71■■□□□ 1.39
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