RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.35■■□□□ 1.97
VARS-216ENST00000428445 KIF14Q15058 1648 aa27.33■■□□□ 1.97
VARS-216ENST00000428445 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.32■■□□□ 1.96
VARS-216ENST00000428445 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
VARS-216ENST00000428445 HSPA2P54652 639 aa27.31■■□□□ 1.96
VARS-216ENST00000428445 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.3■■□□□ 1.96
VARS-216ENST00000428445 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.3■■□□□ 1.96
VARS-216ENST00000428445 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.3■■□□□ 1.96
VARS-216ENST00000428445 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.29■■□□□ 1.96
VARS-216ENST00000428445 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
VARS-216ENST00000428445 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.26■■□□□ 1.95
VARS-216ENST00000428445 AFAP1Q8N556 730 aa27.24■■□□□ 1.95
VARS-216ENST00000428445 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
VARS-216ENST00000428445 FBXO41Q8TF61 875 aa27.22■■□□□ 1.95
VARS-216ENST00000428445 ATP10AO60312 1499 aa27.2■■□□□ 1.95
VARS-216ENST00000428445 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.2■■□□□ 1.95
VARS-216ENST00000428445 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.2■■□□□ 1.94
VARS-216ENST00000428445 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
VARS-216ENST00000428445 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.18■■□□□ 1.94
VARS-216ENST00000428445 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.16■■□□□ 1.94
VARS-216ENST00000428445 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.15■■□□□ 1.94
VARS-216ENST00000428445 CLIP1P30622 1438 aa27.15■■□□□ 1.94
VARS-216ENST00000428445 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.11■■□□□ 1.93
VARS-216ENST00000428445 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.11■■□□□ 1.93
VARS-216ENST00000428445 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.08■■□□□ 1.93
VARS-216ENST00000428445 KDM5CP41229 1560 aa27.08■■□□□ 1.93
VARS-216ENST00000428445 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.07■■□□□ 1.92
VARS-216ENST00000428445 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.05■■□□□ 1.92
VARS-216ENST00000428445 PREX2Q70Z35 1606 aa27.02■■□□□ 1.92
VARS-216ENST00000428445 ABCA6Q8N139 1617 aa27.02■■□□□ 1.92
VARS-216ENST00000428445 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27■■□□□ 1.91
VARS-216ENST00000428445 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
VARS-216ENST00000428445 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.99■■□□□ 1.91
VARS-216ENST00000428445 ABCC1P33527 1531 aa26.99■■□□□ 1.91
VARS-216ENST00000428445 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.98■■□□□ 1.91
VARS-216ENST00000428445 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.98■■□□□ 1.91
VARS-216ENST00000428445 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.96■■□□□ 1.91
VARS-216ENST00000428445 CERKQ8TCT0 537 aa26.94■■□□□ 1.9
VARS-216ENST00000428445 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.93■■□□□ 1.9
VARS-216ENST00000428445 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.93■■□□□ 1.9
VARS-216ENST00000428445 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
VARS-216ENST00000428445 REREQ9P2R6 1566 aa26.91■■□□□ 1.9
VARS-216ENST00000428445 STRCQ7RTU9 1775 aa26.89■■□□□ 1.9
VARS-216ENST00000428445 C3P01024 1663 aa26.89■■□□□ 1.9
VARS-216ENST00000428445 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.88■■□□□ 1.89
VARS-216ENST00000428445 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
VARS-216ENST00000428445 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
VARS-216ENST00000428445 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
VARS-216ENST00000428445 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.86■■□□□ 1.89
VARS-216ENST00000428445 AGLP35573 1532 aa26.85■■□□□ 1.89
VARS-216ENST00000428445 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.85■■□□□ 1.89
VARS-216ENST00000428445 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
VARS-216ENST00000428445 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
VARS-216ENST00000428445 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
VARS-216ENST00000428445 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.77■■□□□ 1.88
VARS-216ENST00000428445 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
VARS-216ENST00000428445 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.76■■□□□ 1.87
VARS-216ENST00000428445 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.74■■□□□ 1.87
VARS-216ENST00000428445 ZMYM3Q14202 1370 aa26.71■■□□□ 1.87
VARS-216ENST00000428445 ATP7AQ04656 1500 aa26.71■■□□□ 1.87
VARS-216ENST00000428445 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.7■■□□□ 1.86
VARS-216ENST00000428445 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.7■■□□□ 1.86
VARS-216ENST00000428445 GGT6Q6P531 493 aa26.69■■□□□ 1.86
VARS-216ENST00000428445 A2MP01023 1474 aa26.67■■□□□ 1.86
VARS-216ENST00000428445 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
VARS-216ENST00000428445 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
VARS-216ENST00000428445 PTPRTO14522 1441 aa26.65■■□□□ 1.86
VARS-216ENST00000428445 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.65■■□□□ 1.86
VARS-216ENST00000428445 TIAM1Q13009 1591 aa26.65■■□□□ 1.86
VARS-216ENST00000428445 MROH2AA6NES4 1674 aa26.63■■□□□ 1.85
VARS-216ENST00000428445 NCOA1Q15788 1441 aa26.63■■□□□ 1.85
VARS-216ENST00000428445 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.63■■□□□ 1.85
VARS-216ENST00000428445 PLXNC1O60486 1568 aa26.63■■□□□ 1.85
VARS-216ENST00000428445 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.61■■□□□ 1.85
VARS-216ENST00000428445 CEP162Q5TB80 1403 aa26.6■■□□□ 1.85
VARS-216ENST00000428445 MBD5Q9P267 1494 aa26.6■■□□□ 1.85
VARS-216ENST00000428445 NPATQ14207 1427 aa26.59■■□□□ 1.85
VARS-216ENST00000428445 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.58■■□□□ 1.85
VARS-216ENST00000428445 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.57■■□□□ 1.84
VARS-216ENST00000428445 PTPRKQ15262 1439 aa26.56■■□□□ 1.84
VARS-216ENST00000428445 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.54■■□□□ 1.84
VARS-216ENST00000428445 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.51■■□□□ 1.83
VARS-216ENST00000428445 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.5■■□□□ 1.83
VARS-216ENST00000428445 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
VARS-216ENST00000428445 NCOA2Q15596 1464 aa26.49■■□□□ 1.83
VARS-216ENST00000428445 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
VARS-216ENST00000428445 KIF3BO15066 747 aa26.48■■□□□ 1.83
VARS-216ENST00000428445 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
VARS-216ENST00000428445 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.47■■□□□ 1.83
VARS-216ENST00000428445 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
VARS-216ENST00000428445 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.45■■□□□ 1.82
VARS-216ENST00000428445 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.45■■□□□ 1.82
VARS-216ENST00000428445 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
VARS-216ENST00000428445 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.44■■□□□ 1.82
VARS-216ENST00000428445 ILDR2Q71H61 639 aa26.43■■□□□ 1.82
VARS-216ENST00000428445 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.42■■□□□ 1.82
VARS-216ENST00000428445 PKD2Q13563 968 aa26.41■■□□□ 1.82
VARS-216ENST00000428445 PLA2R1Q13018 1463 aa26.38■■□□□ 1.81
VARS-216ENST00000428445 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
VARS-216ENST00000428445 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
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