RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.72■■■□□ 2.67
HOXA4-202ENST00000428284 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
HOXA4-202ENST00000428284 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
HOXA4-202ENST00000428284 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXA4-202ENST00000428284 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.66■■■□□ 2.66
HOXA4-202ENST00000428284 FANCAO15360 1455 aa31.65■■■□□ 2.66
HOXA4-202ENST00000428284 MIA2Q96PC5 1412 aa31.65■■■□□ 2.66
HOXA4-202ENST00000428284 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.64■■■□□ 2.66
HOXA4-202ENST00000428284 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
HOXA4-202ENST00000428284 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.61■■■□□ 2.65
HOXA4-202ENST00000428284 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.61■■■□□ 2.65
HOXA4-202ENST00000428284 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.57■■■□□ 2.64
HOXA4-202ENST00000428284 NEO1Q92859 1461 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXA4-202ENST00000428284 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
HOXA4-202ENST00000428284 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
HOXA4-202ENST00000428284 AKNAQ7Z591 1439 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXA4-202ENST00000428284 ABCC1P33527 1531 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXA4-202ENST00000428284 ADGRL1O94910 1474 aa31.51■■■□□ 2.63
HOXA4-202ENST00000428284 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
HOXA4-202ENST00000428284 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.5■■■□□ 2.63
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.5■■■□□ 2.63
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.44■■■□□ 2.62
HOXA4-202ENST00000428284 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.43■■■□□ 2.62
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXA4-202ENST00000428284 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.41■■■□□ 2.62
HOXA4-202ENST00000428284 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.4■■■□□ 2.62
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.4■■■□□ 2.62
HOXA4-202ENST00000428284 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
HOXA4-202ENST00000428284 MBD5Q9P267 1494 aa31.38■■■□□ 2.61
HOXA4-202ENST00000428284 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXA4-202ENST00000428284 RICTORQ6R327 1708 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXA4-202ENST00000428284 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXA4-202ENST00000428284 KDM6BO15054 1643 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXA4-202ENST00000428284 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXA4-202ENST00000428284 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXA4-202ENST00000428284 DAPK1P53355 1430 aa31.33■■■□□ 2.61
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.32■■■□□ 2.6
HOXA4-202ENST00000428284 ITGAEP38570 1179 aa31.3■■■□□ 2.6
HOXA4-202ENST00000428284 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.3■■■□□ 2.6
HOXA4-202ENST00000428284 ABCC5O15440 1437 aa31.3■■■□□ 2.6
HOXA4-202ENST00000428284 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.3■■■□□ 2.6
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
HOXA4-202ENST00000428284 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
HOXA4-202ENST00000428284 RAPGEF3O95398 923 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXA4-202ENST00000428284 AFAP1Q8N556 730 aa31.27■■■□□ 2.6
HOXA4-202ENST00000428284 KDM5CP41229 1560 aa31.27■■■□□ 2.6
HOXA4-202ENST00000428284 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.24■■■□□ 2.59
HOXA4-202ENST00000428284 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.24■■■□□ 2.59
HOXA4-202ENST00000428284 TSPY4P0CV99 314 aa31.22■■■□□ 2.59
HOXA4-202ENST00000428284 TSPY10P0CW01 314 aa31.22■■■□□ 2.59
HOXA4-202ENST00000428284 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.22■■■□□ 2.59
HOXA4-202ENST00000428284 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXA4-202ENST00000428284 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXA4-202ENST00000428284 PTPRKQ15262 1439 aa31.2■■■□□ 2.59
HOXA4-202ENST00000428284 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
HOXA4-202ENST00000428284 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.19■■■□□ 2.58
HOXA4-202ENST00000428284 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
HOXA4-202ENST00000428284 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.19■■■□□ 2.58
HOXA4-202ENST00000428284 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXA4-202ENST00000428284 ATP7AQ04656 1500 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXA4-202ENST00000428284 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXA4-202ENST00000428284 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXA4-202ENST00000428284 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXA4-202ENST00000428284 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXA4-202ENST00000428284 PLXNC1O60486 1568 aa31.11■■■□□ 2.57
HOXA4-202ENST00000428284 ADGRL2O95490 1459 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXA4-202ENST00000428284 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.09■■■□□ 2.57
HOXA4-202ENST00000428284 ABCA6Q8N139 1617 aa31.09■■■□□ 2.57
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXA4-202ENST00000428284 ROCK1Q13464 1354 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXA4-202ENST00000428284 NCOA1Q15788 1441 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXA4-202ENST00000428284 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXA4-202ENST00000428284 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXA4-202ENST00000428284 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXA4-202ENST00000428284 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXA4-202ENST00000428284 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.02■■■□□ 2.56
HOXA4-202ENST00000428284 KIF15Q9NS87 1388 aa31.01■■■□□ 2.55
HOXA4-202ENST00000428284 HFM1A2PYH4 1435 aa30.96■■■□□ 2.55
HOXA4-202ENST00000428284 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.96■■■□□ 2.55
HOXA4-202ENST00000428284 NAIPQ13075 1403 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXA4-202ENST00000428284 ATP10AO60312 1499 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXA4-202ENST00000428284 A2MP01023 1474 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXA4-202ENST00000428284 REREQ9P2R6 1566 aa30.89■■■□□ 2.53
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXA4-202ENST00000428284 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
HOXA4-202ENST00000428284 ERBINQ96RT1 1412 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXA4-202ENST00000428284 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXA4-202ENST00000428284 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXA4-202ENST00000428284 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXA4-202ENST00000428284 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXA4-202ENST00000428284 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXA4-202ENST00000428284 AGLP35573 1532 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXA4-202ENST00000428284 KIF3BO15066 747 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXA4-202ENST00000428284 DEPDC5O75140 1603 aa30.73■■■□□ 2.51
HOXA4-202ENST00000428284 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
HOXA4-202ENST00000428284 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
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