RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 MADDQ8WXG6 1647 aa27.1■■□□□ 1.93
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PTPRK-208ENST00000392449 AFAP1Q8N556 730 aa26.92■■□□□ 1.9
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PTPRK-208ENST00000392449 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRK-208ENST00000392449 REREQ9P2R6 1566 aa26.7■■□□□ 1.87
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PTPRK-208ENST00000392449 STRCQ7RTU9 1775 aa26.42■■□□□ 1.82
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PTPRK-208ENST00000392449 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.22■■□□□ 1.79
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PTPRK-208ENST00000392449 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRK-208ENST00000392449 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRK-208ENST00000392449 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PTPRK-208ENST00000392449 TSPY4P0CV99 314 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRK-208ENST00000392449 TSPY10P0CW01 314 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRK-208ENST00000392449 PTPRTO14522 1441 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRK-208ENST00000392449 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
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