RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381223.9

ZBED1-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED1, Length 4,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-203ENST00000381223 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.14■□□□□ 0.65
ZBED1-203ENST00000381223 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
ZBED1-203ENST00000381223 MLECQ14165 292 aa19.12■□□□□ 0.65
ZBED1-203ENST00000381223 KIF3BO15066 747 aa19.1■□□□□ 0.65
ZBED1-203ENST00000381223 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
ZBED1-203ENST00000381223 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.1■□□□□ 0.65
ZBED1-203ENST00000381223 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
ZBED1-203ENST00000381223 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
ZBED1-203ENST00000381223 STK26Q9P289 416 aa19.08■□□□□ 0.65
ZBED1-203ENST00000381223 TOP2BQ02880 1626 aa19.08■□□□□ 0.64
ZBED1-203ENST00000381223 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
ZBED1-203ENST00000381223 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
ZBED1-203ENST00000381223 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
ZBED1-203ENST00000381223 POGKQ9P215 609 aa19.06■□□□□ 0.64
ZBED1-203ENST00000381223 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
ZBED1-203ENST00000381223 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
ZBED1-203ENST00000381223 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.04■□□□□ 0.64
ZBED1-203ENST00000381223 ZBTB7CA1YPR0 619 aa19.04■□□□□ 0.64
ZBED1-203ENST00000381223 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.04■□□□□ 0.64
ZBED1-203ENST00000381223 CFAP53Q96M91 514 aa19.03■□□□□ 0.64
ZBED1-203ENST00000381223 C14orf37Q86TY3 774 aa19.03■□□□□ 0.64
ZBED1-203ENST00000381223 NCOA2Q15596 1464 aa19.01■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 SOX12O15370 315 aa18.99■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.98■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 RCAN3Q9UKA8 241 aa18.98■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 PTPRGP23470 1445 aa18.98■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 CCDC146Q8IYE0 955 aa18.97■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 MORC1Q86VD1 984 aa18.97■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 UACAQ9BZF9 1416 aa18.97■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 KANK1Q14678 1352 aa18.97■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 USP47Q96K76 1375 aa18.96■□□□□ 0.63
ZBED1-203ENST00000381223 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
ZBED1-203ENST00000381223 PANK3Q9H999 370 aa18.95■□□□□ 0.62
ZBED1-203ENST00000381223 TOPBP1Q92547 1522 aa18.95■□□□□ 0.62
ZBED1-203ENST00000381223 NUDCQ9Y266 331 aa18.94■□□□□ 0.62
ZBED1-203ENST00000381223 RALBP1Q15311 655 aa18.94■□□□□ 0.62
ZBED1-203ENST00000381223 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.94■□□□□ 0.62
ZBED1-203ENST00000381223 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.93■□□□□ 0.62
ZBED1-203ENST00000381223 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.92■□□□□ 0.62
ZBED1-203ENST00000381223 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.92■□□□□ 0.62
ZBED1-203ENST00000381223 NLRP13Q86W25 1043 aa18.92■□□□□ 0.62
ZBED1-203ENST00000381223 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
ZBED1-203ENST00000381223 PLIN1O60240 522 aa18.91■□□□□ 0.62
ZBED1-203ENST00000381223 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.91■□□□□ 0.62
ZBED1-203ENST00000381223 HMGXB3Q12766 1538 aa18.89■□□□□ 0.62
ZBED1-203ENST00000381223 CCDC184Q52MB2 194 aa18.89■□□□□ 0.61
ZBED1-203ENST00000381223 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.89■□□□□ 0.61
ZBED1-203ENST00000381223 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.87■□□□□ 0.61
ZBED1-203ENST00000381223 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
ZBED1-203ENST00000381223 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.86■□□□□ 0.61
ZBED1-203ENST00000381223 CCDC7Q96M83 1385 aa18.86■□□□□ 0.61
ZBED1-203ENST00000381223 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
ZBED1-203ENST00000381223 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.85■□□□□ 0.61
ZBED1-203ENST00000381223 TIAM1Q13009 1591 aa18.85■□□□□ 0.61
ZBED1-203ENST00000381223 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
ZBED1-203ENST00000381223 KIF15Q9NS87 1388 aa18.84■□□□□ 0.61
ZBED1-203ENST00000381223 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.83■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 WDR97A6NE52 1622 aa18.82■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 PRDM2Q13029 1718 aa18.82■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.82■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 CLUAP1Q96AJ1 413 aa18.82■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 AFAP1Q8N556 730 aa18.82■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.81■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.8■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 NBPF1Q3BBV0 1214 aa18.8■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.79■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 DDRGK1Q96HY6 314 aa18.79■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.79■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 GRIN2BQ13224 1484 aa18.79■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.78■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 NUTM2FA1L443 756 aa18.78■□□□□ 0.6
ZBED1-203ENST00000381223 GOLGA2Q08379 1002 aa18.77■□□□□ 0.59
ZBED1-203ENST00000381223 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
ZBED1-203ENST00000381223 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.76■□□□□ 0.59
ZBED1-203ENST00000381223 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.76■□□□□ 0.59
ZBED1-203ENST00000381223 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.75■□□□□ 0.59
ZBED1-203ENST00000381223 HFM1A2PYH4 1435 aa18.75■□□□□ 0.59
ZBED1-203ENST00000381223 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
ZBED1-203ENST00000381223 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
ZBED1-203ENST00000381223 NAIPQ13075 1403 aa18.74■□□□□ 0.59
ZBED1-203ENST00000381223 BECN1Q14457 450 aa18.74■□□□□ 0.59
ZBED1-203ENST00000381223 APAF1O14727 1248 aa18.72■□□□□ 0.59
ZBED1-203ENST00000381223 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.72■□□□□ 0.59
ZBED1-203ENST00000381223 A0A0G2JS52 829 aa18.71■□□□□ 0.59
ZBED1-203ENST00000381223 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
ZBED1-203ENST00000381223 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.7■□□□□ 0.58
ZBED1-203ENST00000381223 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
ZBED1-203ENST00000381223 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.7■□□□□ 0.58
ZBED1-203ENST00000381223 CDCA7LQ96GN5 454 aa18.69■□□□□ 0.58
ZBED1-203ENST00000381223 APBB1O00213 710 aa18.69■□□□□ 0.58
ZBED1-203ENST00000381223 TPRNQ4KMQ1 711 aa18.69■□□□□ 0.58
ZBED1-203ENST00000381223 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.68■□□□□ 0.58
ZBED1-203ENST00000381223 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms