RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
PXDC1-202ENST00000380283 MIA2Q96PC5 1412 aa37.4■■■■□ 3.58
PXDC1-202ENST00000380283 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
PXDC1-202ENST00000380283 SIN3AQ96ST3 1273 aa37.39■■■■□ 3.58
PXDC1-202ENST00000380283 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.37■■■■□ 3.57
PXDC1-202ENST00000380283 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
PXDC1-202ENST00000380283 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.33■■■■□ 3.57
PXDC1-202ENST00000380283 CCER2I3L3R5 266 aa37.31■■■■□ 3.56
PXDC1-202ENST00000380283 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
PXDC1-202ENST00000380283 ANP32EQ9BTT0 268 aa37.3■■■■□ 3.56
PXDC1-202ENST00000380283 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
PXDC1-202ENST00000380283 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.26■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.26■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.26■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.24■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.23■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 FKBP8Q14318 412 aa37.23■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.22■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.2■■■■□ 3.55
PXDC1-202ENST00000380283 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.18■■■■□ 3.54
PXDC1-202ENST00000380283 PTPRKQ15262 1439 aa37.17■■■■□ 3.54
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
PXDC1-202ENST00000380283 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.15■■■■□ 3.54
PXDC1-202ENST00000380283 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.12■■■■□ 3.53
PXDC1-202ENST00000380283 ASXL2Q76L83 1435 aa37.12■■■■□ 3.53
PXDC1-202ENST00000380283 BCANQ96GW7 911 aa37.12■■■■□ 3.53
PXDC1-202ENST00000380283 ANP32CO43423 234 aa37.11■■■■□ 3.53
PXDC1-202ENST00000380283 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.1■■■■□ 3.53
PXDC1-202ENST00000380283 NEFLP07196 543 aa37.07■■■■□ 3.52
PXDC1-202ENST00000380283 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.05■■■■□ 3.52
PXDC1-202ENST00000380283 PREX2Q70Z35 1606 aa37.04■■■■□ 3.52
PXDC1-202ENST00000380283 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.01■■■■□ 3.52
PXDC1-202ENST00000380283 DAPK1P53355 1430 aa37.01■■■■□ 3.52
PXDC1-202ENST00000380283 HFM1A2PYH4 1435 aa37■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 ABCC5O15440 1437 aa37■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.99■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 TONSLQ96HA7 1378 aa36.98■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 PLCH2O75038 1416 aa36.97■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.96■■■■□ 3.51
PXDC1-202ENST00000380283 TRIM52Q96A61 297 aa36.93■■■■□ 3.5
PXDC1-202ENST00000380283 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.91■■■■□ 3.5
PXDC1-202ENST00000380283 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.9■■■■□ 3.5
PXDC1-202ENST00000380283 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.89■■■■□ 3.52e-6■■■□□ 18.1
PXDC1-202ENST00000380283 NAIPQ13075 1403 aa36.89■■■■□ 3.5
PXDC1-202ENST00000380283 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.88■■■■□ 3.49
PXDC1-202ENST00000380283 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
PXDC1-202ENST00000380283 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.87■■■■□ 3.49
PXDC1-202ENST00000380283 AKNAQ7Z591 1439 aa36.84■■■■□ 3.49
PXDC1-202ENST00000380283 MBD5Q9P267 1494 aa36.84■■■■□ 3.49
PXDC1-202ENST00000380283 ROCK1Q13464 1354 aa36.83■■■■□ 3.49
PXDC1-202ENST00000380283 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.81■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.79■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.78■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 TSPY4P0CV99 314 aa36.77■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 TSPY10P0CW01 314 aa36.77■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.77■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.77■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.77■■■■□ 3.48
PXDC1-202ENST00000380283 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.76■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 NCOA1Q15788 1441 aa36.73■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.72■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.72■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.72■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.7■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 FANCAO15360 1455 aa36.7■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 ADGRL2O95490 1459 aa36.7■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.7■■■■□ 3.47
PXDC1-202ENST00000380283 CD109Q6YHK3 1445 aa36.69■■■■□ 3.46
PXDC1-202ENST00000380283 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.68■■■■□ 3.46
PXDC1-202ENST00000380283 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.67■■■■□ 3.46
PXDC1-202ENST00000380283 ABCC1P33527 1531 aa36.66■■■■□ 3.46
PXDC1-202ENST00000380283 KDM6BO15054 1643 aa36.62■■■■□ 3.45
PXDC1-202ENST00000380283 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.58■■■■□ 3.45
PXDC1-202ENST00000380283 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP36.54■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 ADGRL1O94910 1474 aa36.53■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 GLI2P10070 1586 aa36.53■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.53■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 AFAP1Q8N556 730 aa36.53■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.53■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.52■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.52■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 ERICH6BQ5W0A0 696 aa36.51■■■■□ 3.44
PXDC1-202ENST00000380283 KIF15Q9NS87 1388 aa36.5■■■■□ 3.43
PXDC1-202ENST00000380283 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.49■■■■□ 3.43
PXDC1-202ENST00000380283 DIP2BQ9P265 1576 aa36.48■■■■□ 3.43
PXDC1-202ENST00000380283 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.48■■■■□ 3.43
PXDC1-202ENST00000380283 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
PXDC1-202ENST00000380283 FANCIQ9NVI1 1328 aa36.46■■■■□ 3.43
PXDC1-202ENST00000380283 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.44■■■■□ 3.42
PXDC1-202ENST00000380283 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
PXDC1-202ENST00000380283 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.43■■■■□ 3.42
PXDC1-202ENST00000380283 MSH5O43196 834 aa36.4■■■■□ 3.42
PXDC1-202ENST00000380283 NEO1Q92859 1461 aa36.39■■■■□ 3.42
PXDC1-202ENST00000380283 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.38■■■■□ 3.41
PXDC1-202ENST00000380283 PLXNC1O60486 1568 aa36.38■■■■□ 3.41
PXDC1-202ENST00000380283 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.37■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms