RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375850.3

C9orf47-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 47, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene C9orf47, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47-202ENST00000375850 CLIP1P30622 1438 aa38.11■■■■□ 3.69
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C9orf47-202ENST00000375850 ABCA6Q8N139 1617 aa37.59■■■■□ 3.61
C9orf47-202ENST00000375850 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.57■■■■□ 3.61
C9orf47-202ENST00000375850 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.56■■■■□ 3.6
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C9orf47-202ENST00000375850 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.48■■■■□ 3.59
C9orf47-202ENST00000375850 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.48■■■■□ 3.59
C9orf47-202ENST00000375850 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.48■■■■□ 3.59
C9orf47-202ENST00000375850 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.47■■■■□ 3.59
C9orf47-202ENST00000375850 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.46■■■■□ 3.59
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C9orf47-202ENST00000375850 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.43■■■■□ 3.58
C9orf47-202ENST00000375850 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.42■■■■□ 3.58
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C9orf47-202ENST00000375850 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.28■■■■□ 3.56
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C9orf47-202ENST00000375850 MROH2AA6NES4 1674 aa37.25■■■■□ 3.55
C9orf47-202ENST00000375850 PTPRTO14522 1441 aa37.24■■■■□ 3.55
C9orf47-202ENST00000375850 STRCQ7RTU9 1775 aa37.24■■■■□ 3.55
C9orf47-202ENST00000375850 PLXNC1O60486 1568 aa37.23■■■■□ 3.55
C9orf47-202ENST00000375850 CEP162Q5TB80 1403 aa37.23■■■■□ 3.55
C9orf47-202ENST00000375850 ZMYM3Q14202 1370 aa37.21■■■■□ 3.55
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C9orf47-202ENST00000375850 TIAM1Q13009 1591 aa37.19■■■■□ 3.54
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C9orf47-202ENST00000375850 MBD5Q9P267 1494 aa37.13■■■■□ 3.54
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C9orf47-202ENST00000375850 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.1■■■■□ 3.53
C9orf47-202ENST00000375850 GGT6Q6P531 493 aa37.09■■■■□ 3.53
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C9orf47-202ENST00000375850 PTPRKQ15262 1439 aa37.02■■■■□ 3.52
C9orf47-202ENST00000375850 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.01■■■■□ 3.51
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C9orf47-202ENST00000375850 PLA2R1Q13018 1463 aa36.96■■■■□ 3.51
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C9orf47-202ENST00000375850 PKD2Q13563 968 aa36.95■■■■□ 3.51
C9orf47-202ENST00000375850 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.94■■■■□ 3.5
C9orf47-202ENST00000375850 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
C9orf47-202ENST00000375850 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.94■■■■□ 3.5
C9orf47-202ENST00000375850 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.92■■■■□ 3.5
C9orf47-202ENST00000375850 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.92■■■■□ 3.5
C9orf47-202ENST00000375850 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
C9orf47-202ENST00000375850 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.89■■■■□ 3.5
C9orf47-202ENST00000375850 KIF3BO15066 747 aa36.87■■■■□ 3.49
C9orf47-202ENST00000375850 TSPY4P0CV99 314 aa36.86■■■■□ 3.49
C9orf47-202ENST00000375850 TSPY10P0CW01 314 aa36.86■■■■□ 3.49
C9orf47-202ENST00000375850 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.85■■■■□ 3.49
C9orf47-202ENST00000375850 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.85■■■■□ 3.49
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