RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355904.8

GTF2E2-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E2, Length 1,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2-201ENST00000355904 AKNAQ7Z591 1439 aa36.2■■■■□ 3.39
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GTF2E2-201ENST00000355904 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.16■■■■□ 3.38
GTF2E2-201ENST00000355904 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.16■■■■□ 3.38
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GTF2E2-201ENST00000355904 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.14■■■■□ 3.38
GTF2E2-201ENST00000355904 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.14■■■■□ 3.38
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GTF2E2-201ENST00000355904 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.1■■■■□ 3.37
GTF2E2-201ENST00000355904 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.09■■■■□ 3.37
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GTF2E2-201ENST00000355904 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.06■■■■□ 3.36
GTF2E2-201ENST00000355904 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.06■■■■□ 3.36
GTF2E2-201ENST00000355904 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.06■■■■□ 3.36
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GTF2E2-201ENST00000355904 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36■■■■□ 3.35
GTF2E2-201ENST00000355904 ADGRL2O95490 1459 aa35.98■■■■□ 3.35
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GTF2E2-201ENST00000355904 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.96■■■■□ 3.35
GTF2E2-201ENST00000355904 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.96■■■■□ 3.35
GTF2E2-201ENST00000355904 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.94■■■■□ 3.34
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GTF2E2-201ENST00000355904 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.91■■■■□ 3.34
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GTF2E2-201ENST00000355904 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.9■■■■□ 3.34
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GTF2E2-201ENST00000355904 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.86■■■■□ 3.33
GTF2E2-201ENST00000355904 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.84■■■■□ 3.33
GTF2E2-201ENST00000355904 ABCC1P33527 1531 aa35.82■■■■□ 3.33
GTF2E2-201ENST00000355904 TSPY4P0CV99 314 aa35.82■■■■□ 3.33
GTF2E2-201ENST00000355904 TSPY10P0CW01 314 aa35.82■■■■□ 3.33
GTF2E2-201ENST00000355904 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.78■■■■□ 3.32
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GTF2E2-201ENST00000355904 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.78■■■■□ 3.32
GTF2E2-201ENST00000355904 FANCAO15360 1455 aa35.73■■■■□ 3.31
GTF2E2-201ENST00000355904 TRIM52Q96A61 297 aa35.68■■■■□ 3.3
GTF2E2-201ENST00000355904 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.68■■■■□ 3.3
GTF2E2-201ENST00000355904 KIF15Q9NS87 1388 aa35.67■■■■□ 3.3
GTF2E2-201ENST00000355904 PLXNC1O60486 1568 aa35.65■■■■□ 3.3
GTF2E2-201ENST00000355904 CD109Q6YHK3 1445 aa35.63■■■■□ 3.29
GTF2E2-201ENST00000355904 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.63■■■■□ 3.29
GTF2E2-201ENST00000355904 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.6■■■■□ 3.29
GTF2E2-201ENST00000355904 ADGRL1O94910 1474 aa35.59■■■■□ 3.29
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GTF2E2-201ENST00000355904 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.5■■■■□ 3.27
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GTF2E2-201ENST00000355904 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.5■■■■□ 3.27
GTF2E2-201ENST00000355904 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.49■■■■□ 3.27
GTF2E2-201ENST00000355904 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.48■■■■□ 3.27
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GTF2E2-201ENST00000355904 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.46■■■■□ 3.27
GTF2E2-201ENST00000355904 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
GTF2E2-201ENST00000355904 NEUROD1Q13562 356 aa35.45■■■■□ 3.27
GTF2E2-201ENST00000355904 DIP2BQ9P265 1576 aa35.44■■■■□ 3.26
GTF2E2-201ENST00000355904 NEO1Q92859 1461 aa35.43■■■■□ 3.26
GTF2E2-201ENST00000355904 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
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GTF2E2-201ENST00000355904 ERBINQ96RT1 1412 aa35.41■■■■□ 3.26
GTF2E2-201ENST00000355904 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.41■■■■□ 3.26
GTF2E2-201ENST00000355904 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.39■■■■□ 3.26
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GTF2E2-201ENST00000355904 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.35■■■■□ 3.25
GTF2E2-201ENST00000355904 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.32■■■■□ 3.24
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GTF2E2-201ENST00000355904 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.3■■■■□ 3.24
GTF2E2-201ENST00000355904 TONSLQ96HA7 1378 aa35.29■■■■□ 3.24
GTF2E2-201ENST00000355904 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.26■■■■□ 3.24
GTF2E2-201ENST00000355904 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.26■■■■□ 3.24
GTF2E2-201ENST00000355904 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.26■■■■□ 3.24
GTF2E2-201ENST00000355904 PKD2Q13563 968 aa35.24■■■■□ 3.23
GTF2E2-201ENST00000355904 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.22■■■■□ 3.23
GTF2E2-201ENST00000355904 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.22■■■■□ 3.23
GTF2E2-201ENST00000355904 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.21■■■■□ 3.23
GTF2E2-201ENST00000355904 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.21■■■■□ 3.23
GTF2E2-201ENST00000355904 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
GTF2E2-201ENST00000355904 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
GTF2E2-201ENST00000355904 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
GTF2E2-201ENST00000355904 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
GTF2E2-201ENST00000355904 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
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