RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317907.8

TTC27-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC27, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-201ENST00000317907 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TTC27-201ENST00000317907 SYNJ2O15056 1496 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC27-201ENST00000317907 CEP170Q5SW79 1584 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC27-201ENST00000317907 KIAA0556O60303 1618 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC27-201ENST00000317907 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TTC27-201ENST00000317907 KDM6BO15054 1643 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC27-201ENST00000317907 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC27-201ENST00000317907 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
TTC27-201ENST00000317907 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TTC27-201ENST00000317907 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TTC27-201ENST00000317907 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC27-201ENST00000317907 ARHGEF11O15085 1522 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC27-201ENST00000317907 MSH5O43196 834 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC27-201ENST00000317907 ANP32CO43423 234 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC27-201ENST00000317907 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC27-201ENST00000317907 ABCC5O15440 1437 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC27-201ENST00000317907 DAPK1P53355 1430 aa14.79□□□□□ -0.04
TTC27-201ENST00000317907 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TTC27-201ENST00000317907 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.79□□□□□ -0.04
TTC27-201ENST00000317907 MIA2Q96PC5 1412 aa14.78□□□□□ -0.04
TTC27-201ENST00000317907 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TTC27-201ENST00000317907 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TTC27-201ENST00000317907 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
TTC27-201ENST00000317907 PTPRGP23470 1445 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 POLR3GLQ9BT43 218 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 NUP160Q12769 1436 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 PKD2Q13563 968 aa14.75□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 ATP10BO94823 1461 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 KIF14Q15058 1648 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 CCER2I3L3R5 266 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 TSPY4P0CV99 314 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 TSPY10P0CW01 314 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC27-201ENST00000317907 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.06
TTC27-201ENST00000317907 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC27-201ENST00000317907 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
TTC27-201ENST00000317907 NCOA1Q15788 1441 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC27-201ENST00000317907 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC27-201ENST00000317907 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC27-201ENST00000317907 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC27-201ENST00000317907 NUP155O75694 1391 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC27-201ENST00000317907 AKNAQ7Z591 1439 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC27-201ENST00000317907 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC27-201ENST00000317907 RGL3Q3MIN7 710 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC27-201ENST00000317907 ROCK1Q13464 1354 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC27-201ENST00000317907 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC27-201ENST00000317907 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC27-201ENST00000317907 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC27-201ENST00000317907 CCDC184Q52MB2 194 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC27-201ENST00000317907 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC27-201ENST00000317907 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TTC27-201ENST00000317907 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TTC27-201ENST00000317907 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC27-201ENST00000317907 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC27-201ENST00000317907 ABCA8O94911 1581 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC27-201ENST00000317907 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC27-201ENST00000317907 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC27-201ENST00000317907 KIF15Q9NS87 1388 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC27-201ENST00000317907 PZPP20742 1482 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC27-201ENST00000317907 CHD1O14646 1710 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC27-201ENST00000317907 NBR1Q14596 966 aa14.56□□□□□ -0.08
TTC27-201ENST00000317907 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.56□□□□□ -0.08
TTC27-201ENST00000317907 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.56□□□□□ -0.08
TTC27-201ENST00000317907 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TTC27-201ENST00000317907 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC27-201ENST00000317907 AFAP1Q8N556 730 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC27-201ENST00000317907 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC27-201ENST00000317907 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC27-201ENST00000317907 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.52□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.52□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.51□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 MBD5Q9P267 1494 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 CCDC7Q96M83 1385 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 MRS2Q9HD23 443 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.46□□□□□ -0.09
TTC27-201ENST00000317907 USP47Q96K76 1375 aa14.45□□□□□ -0.1
TTC27-201ENST00000317907 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.45□□□□□ -0.1
TTC27-201ENST00000317907 ADGRL2O95490 1459 aa14.45□□□□□ -0.1
TTC27-201ENST00000317907 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.44□□□□□ -0.1
TTC27-201ENST00000317907 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.44□□□□□ -0.1
TTC27-201ENST00000317907 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.43□□□□□ -0.1
TTC27-201ENST00000317907 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.43□□□□□ -0.1
TTC27-201ENST00000317907 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.43□□□□□ -0.1
TTC27-201ENST00000317907 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
TTC27-201ENST00000317907 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.43□□□□□ -0.1
TTC27-201ENST00000317907 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.43□□□□□ -0.1
TTC27-201ENST00000317907 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms