RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316999.9

SMAP1-201, Transcript of small ArfGAP 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAP1, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAP1-201ENST00000316999 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.66■■□□□ 1.38
SMAP1-201ENST00000316999 TRIM52Q96A61 297 aa23.65■■□□□ 1.38
SMAP1-201ENST00000316999 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SMAP1-201ENST00000316999 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SMAP1-201ENST00000316999 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.62■■□□□ 1.37
SMAP1-201ENST00000316999 ROCK1Q13464 1354 aa23.62■■□□□ 1.37
SMAP1-201ENST00000316999 SHROOM2Q13796 1616 aa23.61■■□□□ 1.37
SMAP1-201ENST00000316999 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.6■■□□□ 1.37
SMAP1-201ENST00000316999 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.6■■□□□ 1.37
SMAP1-201ENST00000316999 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.58■■□□□ 1.37
SMAP1-201ENST00000316999 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.58■■□□□ 1.37
SMAP1-201ENST00000316999 TONSLQ96HA7 1378 aa23.57■■□□□ 1.36
SMAP1-201ENST00000316999 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.55■■□□□ 1.36
SMAP1-201ENST00000316999 FOXD1Q16676 465 aa23.54■■□□□ 1.36
SMAP1-201ENST00000316999 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SMAP1-201ENST00000316999 NCOA1Q15788 1441 aa23.52■■□□□ 1.36
SMAP1-201ENST00000316999 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SMAP1-201ENST00000316999 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SMAP1-201ENST00000316999 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SMAP1-201ENST00000316999 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.47■■□□□ 1.35
SMAP1-201ENST00000316999 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
SMAP1-201ENST00000316999 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.45■■□□□ 1.34
SMAP1-201ENST00000316999 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.44■■□□□ 1.34
SMAP1-201ENST00000316999 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
SMAP1-201ENST00000316999 ADGRL2O95490 1459 aa23.43■■□□□ 1.34
SMAP1-201ENST00000316999 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.42■■□□□ 1.34
SMAP1-201ENST00000316999 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SMAP1-201ENST00000316999 ABCC2Q92887 1545 aa23.4■■□□□ 1.34
SMAP1-201ENST00000316999 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.4■■□□□ 1.34
SMAP1-201ENST00000316999 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.4■■□□□ 1.34
SMAP1-201ENST00000316999 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.39■■□□□ 1.33
SMAP1-201ENST00000316999 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SMAP1-201ENST00000316999 PZPP20742 1482 aa23.36■■□□□ 1.33
SMAP1-201ENST00000316999 MBD5Q9P267 1494 aa23.36■■□□□ 1.33
SMAP1-201ENST00000316999 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.36■■□□□ 1.33
SMAP1-201ENST00000316999 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.35■■□□□ 1.33
SMAP1-201ENST00000316999 TSPY4P0CV99 314 aa23.35■■□□□ 1.33
SMAP1-201ENST00000316999 TSPY10P0CW01 314 aa23.35■■□□□ 1.33
SMAP1-201ENST00000316999 KCNH8Q96L42 1107 aa23.34■■□□□ 1.33
SMAP1-201ENST00000316999 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.34■■□□□ 1.33
SMAP1-201ENST00000316999 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.34■■□□□ 1.33
SMAP1-201ENST00000316999 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
SMAP1-201ENST00000316999 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.33■■□□□ 1.33
SMAP1-201ENST00000316999 PREX2Q70Z35 1606 aa23.33■■□□□ 1.33
SMAP1-201ENST00000316999 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.32■■□□□ 1.32
SMAP1-201ENST00000316999 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SMAP1-201ENST00000316999 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.29■■□□□ 1.32
SMAP1-201ENST00000316999 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SMAP1-201ENST00000316999 PKD2Q13563 968 aa23.26■■□□□ 1.31
SMAP1-201ENST00000316999 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.26■■□□□ 1.31
SMAP1-201ENST00000316999 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.25■■□□□ 1.31
SMAP1-201ENST00000316999 KIF15Q9NS87 1388 aa23.24■■□□□ 1.31
SMAP1-201ENST00000316999 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.24■■□□□ 1.31
SMAP1-201ENST00000316999 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.23■■□□□ 1.31
SMAP1-201ENST00000316999 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.23■■□□□ 1.31
SMAP1-201ENST00000316999 NUP155O75694 1391 aa23.23■■□□□ 1.31
SMAP1-201ENST00000316999 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.22■■□□□ 1.31
SMAP1-201ENST00000316999 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.22■■□□□ 1.31
SMAP1-201ENST00000316999 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.22■■□□□ 1.31
SMAP1-201ENST00000316999 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.21■■□□□ 1.31
SMAP1-201ENST00000316999 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SMAP1-201ENST00000316999 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.2■■□□□ 1.3
SMAP1-201ENST00000316999 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.16■■□□□ 1.3
SMAP1-201ENST00000316999 PLCH2O75038 1416 aa23.16■■□□□ 1.3
SMAP1-201ENST00000316999 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
SMAP1-201ENST00000316999 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.11■■□□□ 1.29
SMAP1-201ENST00000316999 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.11■■□□□ 1.29
SMAP1-201ENST00000316999 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.1■■□□□ 1.29
SMAP1-201ENST00000316999 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.09■■□□□ 1.29
SMAP1-201ENST00000316999 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.08■■□□□ 1.29
SMAP1-201ENST00000316999 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SMAP1-201ENST00000316999 OSCARQ8IYS5 282 aa23.07■■□□□ 1.28
SMAP1-201ENST00000316999 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.04■■□□□ 1.28
SMAP1-201ENST00000316999 ANP32CO43423 234 aa23.03■■□□□ 1.28
SMAP1-201ENST00000316999 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.03■■□□□ 1.28
SMAP1-201ENST00000316999 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
SMAP1-201ENST00000316999 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.02■■□□□ 1.27
SMAP1-201ENST00000316999 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SMAP1-201ENST00000316999 ABCC1P33527 1531 aa23.01■■□□□ 1.27
SMAP1-201ENST00000316999 PLXNC1O60486 1568 aa23.01■■□□□ 1.27
SMAP1-201ENST00000316999 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23■■□□□ 1.27
SMAP1-201ENST00000316999 AFAP1Q8N556 730 aa23■■□□□ 1.27
SMAP1-201ENST00000316999 UNC13BO14795 1591 aa22.96■■□□□ 1.27
SMAP1-201ENST00000316999 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.95■■□□□ 1.27
SMAP1-201ENST00000316999 CCER2I3L3R5 266 aa22.95■■□□□ 1.26
SMAP1-201ENST00000316999 ASXL2Q76L83 1435 aa22.94■■□□□ 1.26
SMAP1-201ENST00000316999 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.93■■□□□ 1.26
SMAP1-201ENST00000316999 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.93■■□□□ 1.26
SMAP1-201ENST00000316999 CCDC7Q96M83 1385 aa22.93■■□□□ 1.26
SMAP1-201ENST00000316999 PLA2R1Q13018 1463 aa22.92■■□□□ 1.26
SMAP1-201ENST00000316999 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SMAP1-201ENST00000316999 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.91■■□□□ 1.26
SMAP1-201ENST00000316999 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.9■■□□□ 1.26
SMAP1-201ENST00000316999 FANCAO15360 1455 aa22.9■■□□□ 1.26
SMAP1-201ENST00000316999 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.9■■□□□ 1.26
SMAP1-201ENST00000316999 ERBINQ96RT1 1412 aa22.9■■□□□ 1.26
SMAP1-201ENST00000316999 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.89■■□□□ 1.25
SMAP1-201ENST00000316999 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.88■■□□□ 1.25
SMAP1-201ENST00000316999 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.86■■□□□ 1.25
SMAP1-201ENST00000316999 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms